53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2520 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1781  outer membrane protein, putative  51.06 
 
 		 712 aa  733    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2762  outer membrane protein, putative  52.79 
 
 		 716 aa  764    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00885909  hitchhiker  0.000163865 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1592  outer membrane protein, putative  52.93 
 
 		 716 aa  766    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000338536  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1615  outer membrane protein, putative  52.65 
 
 		 716 aa  761    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.208848  normal  0.197166 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2507  outer membrane protein, putative  51.35 
 
 		 712 aa  750    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0767045  decreased coverage  0.000584641 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1581  outer membrane protein, putative  52.51 
 
 		 716 aa  761    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0408477  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2673  outer membrane protein, putative  50.92 
 
 		 712 aa  746    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.335311  normal  0.0727867 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1529  outer membrane protein, putative  57.86 
 
 		 711 aa  849    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2575  outer membrane protein, putative  50.92 
 
 		 712 aa  745    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.382223  normal  0.0100753 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2693  outer membrane protein, putative  58.59 
 
 		 706 aa  838    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2520  outer membrane protein, putative  100 
 
 		 703 aa  1437    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.383126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1212  outer membrane protein, putative  44.94 
 
 		 698 aa  615  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1523  outer membrane protein precursor MtrB  37.39 
 
 		 703 aa  479  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.415633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2700  outer membrane protein precursor MtrB  36.75 
 
 		 699 aa  462  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.140373  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2527  outer membrane protein precursor MtrB  35.75 
 
 		 699 aa  456  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1610  outer membrane protein precursor MtrB  36.53 
 
 		 695 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2767  outer membrane protein precursor MtrB  36.53 
 
 		 695 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.38459  decreased coverage  0.0000000195366 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1576  outer membrane protein precursor MtrB  36.53 
 
 		 695 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0247408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1587  outer membrane protein precursor MtrB  36.25 
 
 		 695 aa  452  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.14869  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3127  outer membrane protein precursor MtrB  37.41 
 
 		 698 aa  443  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000335103 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1776  outer membrane protein precursor MtrB  36.1 
 
 		 697 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2639  outer membrane protein precursor MtrB  35.92 
 
 		 695 aa  432  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.381518  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1206  outer membrane protein precursor MtrB  36.63 
 
 		 693 aa  426  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00712734  normal  0.823248 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2678  outer membrane protein precursor MtrB  36.25 
 
 		 695 aa  425  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0120666 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2580  outer membrane protein precursor MtrB  36.25 
 
 		 695 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0892811  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2512  outer membrane protein precursor MtrB  36.68 
 
 		 695 aa  425  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.481344  hitchhiker  0.00380912 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1476  outer membrane protein precursor MtrB  35.45 
 
 		 704 aa  382  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0583388  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0351  outer membrane protein  32.91 
 
 		 668 aa  350  3e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.132929 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3129  outer membrane protein  32.48 
 
 		 668 aa  346  7e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1428  outer membrane protein  31.73 
 
 		 662 aa  312  2e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0626  outer membrane protein  31.42 
 
 		 662 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0228  outer membrane protein  29.65 
 
 		 669 aa  300  8e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1403  outer membrane protein  29.12 
 
 		 668 aa  294  4e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3676  outer membrane protein  30.31 
 
 		 667 aa  293  8e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0267  outer membrane protein  30.85 
 
 		 667 aa  290  6e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2229  outer membrane protein  30.45 
 
 		 667 aa  289  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00516967  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2924  outer membrane protein  30.16 
 
 		 672 aa  288  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3685  outer membrane protein  29.06 
 
 		 669 aa  286  7e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2819  outer membrane protein  30.76 
 
 		 674 aa  284  5.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.216315  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0232  outer membrane protein  29.02 
 
 		 668 aa  276  7e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1306  outer membrane protein  27.71 
 
 		 672 aa  231  4e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179151 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2150  outer membrane protein  27.52 
 
 		 669 aa  227  6e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0260254  normal  0.662224 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003778  outer membrane protein  24.89 
 
 		 660 aa  154  5.9999999999999996e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4359  outer membrane protein, putative  23.32 
 
 		 656 aa  127  9e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2380  hypothetical protein  21.25 
 
 		 681 aa  114  6e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.573716  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0360  hypothetical protein  23.22 
 
 		 565 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0310928  hitchhiker  0.00101277 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3860  hypothetical protein  23.63 
 
 		 573 aa  101  6e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00093801  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4081  hypothetical protein  23.15 
 
 		 706 aa  88.6  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0596135  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0398  hypothetical protein  21.32 
 
 		 807 aa  73.9  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.513046 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0816  hypothetical protein  20.98 
 
 		 810 aa  64.7  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2959  putative outer membrane protein precursor  21.67 
 
 		 830 aa  63.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3627  hypothetical protein  21.17 
 
 		 835 aa  61.6  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1403  hypothetical protein  22.22 
 
 		 772 aa  53.1  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142579  normal  0.0825928 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>