88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1284 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_1284  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
166 aa  341  2.9999999999999997e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.568121 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1538  GCN5-related N-acetyltransferase  55.21 
 
 
170 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.268239 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1425  GCN5-related N-acetyltransferase  55.28 
 
 
181 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.167968 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1298  GCN5-related N-acetyltransferase  53.37 
 
 
166 aa  184  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1289  acetyltransferase  48.17 
 
 
173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.057634  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1219  acetyltransferase  47.24 
 
 
173 aa  159  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.846102 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1218  acetyltransferase  47.24 
 
 
173 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.148458  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2666  GCN5-related N-acetyltransferase  49.39 
 
 
170 aa  155  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0312822  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3015  GCN5-related N-acetyltransferase  46.63 
 
 
169 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3158  GCN5-related N-acetyltransferase  45.4 
 
 
203 aa  154  8e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00653995 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3000  GCN5-related N-acetyltransferase  46.01 
 
 
173 aa  153  9e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3324  acetyltransferase  46.3 
 
 
203 aa  153  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1363  GCN5-related N-acetyltransferase  46.01 
 
 
169 aa  153  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.933433  hitchhiker  0.000190742 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1109  GCN5-related N-acetyltransferase  47.2 
 
 
177 aa  151  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1251  GCN5-related N-acetyltransferase  36 
 
 
185 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2371  hypothetical protein  36.02 
 
 
320 aa  105  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.896111  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1299  GCN5-related N-acetyltransferase  26.4 
 
 
180 aa  80.9  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1942  GCN5-related N-acetyltransferase  30.25 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.35373  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0261  hypothetical protein  32.5 
 
 
150 aa  72.4  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0266  hypothetical protein  32.5 
 
 
150 aa  72.4  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0229  hypothetical protein  32.5 
 
 
150 aa  72.4  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1387  GCN5-related N-acetyltransferase  26.83 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678698  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00229  predicted acyltransferase with acyl-CoA N-acyltransferase domain  33.12 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00232  hypothetical protein  33.12 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0288  hypothetical protein  33.12 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.867365  normal  0.217589 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1357  GCN5-related N-acetyltransferase  27.22 
 
 
163 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3373  GCN5-related N-acetyltransferase  34.85 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3474  acetyltransferase  28.12 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000407854  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2759  acetyltransferase  27.98 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3828  acetyltransferase, gnat family  27.78 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00017711  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3757  acetyltransferase  28.12 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000162031  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003587  acetyltransferase GNAT family  27.33 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0142  GCN5-related N-acetyltransferase  26.43 
 
 
162 aa  64.7  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000142721  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1855  acetyltransferase  26.32 
 
 
164 aa  64.3  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00212517 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3495  GCN5-related N-acetyltransferase  26.54 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000137557  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3557  GCN5-related N-acetyltransferase  24.54 
 
 
154 aa  63.5  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0279  hypothetical protein  32.5 
 
 
150 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1290  acetyltransferase  27.81 
 
 
176 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0542587  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1219  acetyltransferase  27.81 
 
 
176 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0886873  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1220  acetyltransferase  27.22 
 
 
176 aa  61.2  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.850535 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1831  GCN5-related N-acetyltransferase  26.95 
 
 
158 aa  60.1  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0803543  normal  0.0847083 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0960  GCN5-related N-acetyltransferase  29.25 
 
 
174 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1914  GCN5-related N-acetyltransferase  26.17 
 
 
167 aa  59.3  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3323  acetyltransferase  26.04 
 
 
176 aa  59.7  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2999  GCN5-related N-acetyltransferase  28.05 
 
 
174 aa  59.3  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0451  acetyltransferase  29.33 
 
 
156 aa  59.3  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.896782  normal  0.723991 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2068  GCN5-related N-acetyltransferase  28.17 
 
 
169 aa  58.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.313385  normal  0.750925 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1364  GCN5-related N-acetyltransferase  27.44 
 
 
174 aa  58.2  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139138 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3157  GCN5-related N-acetyltransferase  27.44 
 
 
174 aa  58.2  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621797 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2210  GCN5-related N-acetyltransferase  26.09 
 
 
166 aa  57.8  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2068  GCN5-related N-acetyltransferase  26.35 
 
 
155 aa  57.8  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3014  GCN5-related N-acetyltransferase  27.22 
 
 
174 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3514  acetyltransferase  24.34 
 
 
156 aa  55.1  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.191622 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2665  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 
177 aa  54.7  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0357871  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0040  acetyltransferase  26.38 
 
 
150 aa  54.7  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3372  GCN5-related N-acetyltransferase  26.06 
 
 
169 aa  54.3  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0851191  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02546  hypothetical protein  22.36 
 
 
159 aa  53.9  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05473  putative acyltransferase protein  29.37 
 
 
155 aa  53.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0190305 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0963  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
160 aa  53.1  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0136  GCN5-related N-acetyltransferase  28.79 
 
 
167 aa  52  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3001  GCN5-related N-acetyltransferase  27.86 
 
 
159 aa  51.2  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3500  acetyltransferase  26.06 
 
 
166 aa  51.2  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.867974  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1060  GCN5-related N-acetyltransferase  28.66 
 
 
161 aa  51.2  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.271668  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1001  acetyltransferase  24.18 
 
 
159 aa  50.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.219128  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1230  GCN5-related N-acetyltransferase  29.5 
 
 
166 aa  50.4  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814852  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4025  GCN5-related N-acetyltransferase  28.8 
 
 
157 aa  48.5  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.636183  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0887  acetyltransferase  30.5 
 
 
164 aa  48.5  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  unclonable  0.000000133756 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2088  GCN5-related N-acetyltransferase  28.17 
 
 
166 aa  48.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3685  GCN5-related N-acetyltransferase  23.68 
 
 
173 aa  47.8  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2718  acetyltransferase  24.82 
 
 
156 aa  47.8  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0714  GCN5-related N-acetyltransferase  41.54 
 
 
191 aa  47.8  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1489  GCN5-related N-acetyltransferase  27.07 
 
 
166 aa  47.4  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.170228  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2811  acetyltransferase  28.9 
 
 
178 aa  47  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1473  acetyltransferase  25.18 
 
 
128 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000250439  hitchhiker  0.00000579727 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3551  GCN5-related N-acetyltransferase  36.51 
 
 
129 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10761  GCN5-related N-acetyltransferase  28.23 
 
 
156 aa  45.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0414062  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2040  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
161 aa  45.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2410  acetyltransferase, GNAT family  27.27 
 
 
165 aa  45.1  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  35.82 
 
 
164 aa  44.7  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.105051 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10761  GCN5-related N-acetyltransferase  25.4 
 
 
156 aa  44.3  0.0008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.397538  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1874  GCN5-related N-acetyltransferase  23.78 
 
 
166 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545017  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1021  GCN5-related N-acetyltransferase  28.44 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0567857  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5121  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
203 aa  42  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000669532  normal  0.227533 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3209  GCN5-related N-acetyltransferase  35.62 
 
 
184 aa  41.6  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179345 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3185  GCN5-related N-acetyltransferase  28.36 
 
 
159 aa  41.6  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.082232  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1031  GCN5-related N-acetyltransferase  27.21 
 
 
160 aa  41.2  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2799  GCN5-related N-acetyltransferase  20.73 
 
 
154 aa  40.8  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1879  GCN5-related N-acetyltransferase  30.1 
 
 
174 aa  40.8  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.266157 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>