74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0255 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0255  ion transport 2 domain-containing protein  100 
 
 		 226 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.106172 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06642  Kef-type K+ transport system NAD-binding component  60.62 
 
 		 228 aa  290  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001142  potassium channel protein  59.29 
 
 		 228 aa  275  6e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1842  Ion transport 2 domain-containing protein  52.38 
 
 		 208 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1907  putative ion channel  42.59 
 
 		 220 aa  122  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4607  hypothetical protein  36.04 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0647  ion transport family protein  50 
 
 		 247 aa  99.8  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2411  Ion transport 2 domain protein  38.4 
 
 		 271 aa  87.8  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.403469  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0517  Ion transport 2 domain protein  39.66 
 
 		 218 aa  85.5  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000756398  decreased coverage  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0500  Ion transport 2 domain protein  39.66 
 
 		 218 aa  85.9  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1772  Ion transport 2 domain-containing protein  40.16 
 
 		 211 aa  84.7  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1808  Ion transport 2 domain-containing protein  35.71 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0516361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1233  hypothetical protein  32.17 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0271776 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3632  Ion transport 2 domain protein  38.98 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.070187  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2231  Ion transport 2 domain protein  36.11 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.338612 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0413  Ion transport 2 domain-containing protein  30.63 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2482  Ion transport 2 domain protein  32.05 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.745368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3734  hypothetical protein  38.46 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.724435 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2018  Ion transport 2 domain protein  32.43 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4778  hypothetical protein  34.91 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.248369  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22810  hypothetical protein  30.41 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54680  hypothetical protein  38.04 
 
 		 102 aa  62  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.238288  hitchhiker  0.00000298461 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1459  Ion transport 2 domain-containing protein  33.93 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209929 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2859  Ion transport 2 domain protein  39.18 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5186  putative Voltage-gated potassium channel  25.87 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.240486 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0923  hypothetical protein  31.2 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.581577 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1485  hypothetical protein  29.84 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.868735  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1489  Ion transport 2 domain protein  30.37 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670111  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19221  hypothetical protein  27.66 
 
 		 264 aa  52.4  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.774034 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2339  Ion transport protein  43.66 
 
 		 276 aa  50.1  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1499  Ion transport 2 domain-containing protein  42.86 
 
 		 230 aa  47.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.288718  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0700  Ion transport 2 domain protein  40.62 
 
 		 274 aa  47.4  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00257952  normal  0.062566 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4298  voltage-gated potassium channel  34.29 
 
 		 391 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3219  voltage-gated potassium channel  34.29 
 
 		 391 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.630222 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2650  Ion transport 2 domain-containing protein  28.07 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1715  voltage-gated potassium channel  34.29 
 
 		 391 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3716  voltage-gated potassium channel  34.29 
 
 		 391 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.947773 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4068  voltage-gated potassium channel  34.29 
 
 		 391 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3070  Ion transport 2 domain-containing protein  36.54 
 
 		 244 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.550123  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0749  Ion transport 2 domain protein  26.61 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0939  VIC family potassium channel protein  36.51 
 
 		 276 aa  45.8  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.650828  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1665  hypothetical protein  47.62 
 
 		 149 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0983304  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4286  Ion transport protein  35.21 
 
 		 272 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.361083  normal  0.259623 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1478  Ion transport protein  34.92 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.870774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3499  TrkA-N domain protein  44.44 
 
 		 356 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133106  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0709  Ion transport protein  44.23 
 
 		 295 aa  44.7  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1320  Ion transport 2 domain protein  46.81 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.615592  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0760  Ion transport 2 domain protein  37.29 
 
 		 224 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400355  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2774  Ion transport 2 domain protein  34.62 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000298794 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  33.33 
 
 		 295 aa  44.3  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41153  VIC family transporter: calcium-activated outward-rectifying potassium ion channel  36.51 
 
 		 265 aa  43.5  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3324  Ion transport 2 domain protein  29.84 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.304399  normal  0.471998 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1456  Ion transport 2 domain protein  34.43 
 
 		 405 aa  44.3  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0673  potassium channel protein  37.74 
 
 		 428 aa  43.9  0.002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0468102  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1991  potassium channel protein  41.54 
 
 		 279 aa  43.5  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3053  Ion transport protein  37.5 
 
 		 288 aa  43.5  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4663  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 		 359 aa  42.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  33.96 
 
 		 509 aa  42.4  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1557  Ion transport protein  31.43 
 
 		 277 aa  42.7  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0044  Ion transport 2 domain protein  25.23 
 
 		 316 aa  42.4  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38821  predicted protein  34 
 
 		 469 aa  42  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1745  Ion transport 2 domain-containing protein  29.41 
 
 		 252 aa  42  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  25 
 
 		 409 aa  42  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01615  hypothetical protein  57.14 
 
 		 347 aa  42  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0960  Ion transport 2 domain-containing protein  32.91 
 
 		 297 aa  42  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1141  voltage-gated potassium channel  27 
 
 		 391 aa  42  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.378703  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1087  voltage-gated potassium channel  27 
 
 		 391 aa  42  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4283  Ion transport protein  34.48 
 
 		 285 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0210487  normal  0.0226615 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3564  voltage-gated potassium channel  27 
 
 		 391 aa  41.6  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00301941  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0938  Ion transport 2 domain-containing protein  45.65 
 
 		 327 aa  41.6  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2281  Ion transport protein  33.33 
 
 		 289 aa  41.6  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1372  Ion transport 2 domain-containing protein  37.29 
 
 		 268 aa  41.6  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2375  Ion transport protein  37.04 
 
 		 276 aa  41.6  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1457  Kef-type K+ transport system NAD-binding protein  36.54 
 
 		 255 aa  41.6  0.01  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>