92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1725 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1725  patatin  100 
 
 		 380 aa  786    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000438392  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1591  patatin  90.6 
 
 		 383 aa  710    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2559  Patatin  91.32 
 
 		 372 aa  707    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00539059  hitchhiker  0.000000000253034 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1730  patatin  91.34 
 
 		 372 aa  704    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.220053  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1768  patatin  89.5 
 
 		 372 aa  691    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.114347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2385  patatin  73.65 
 
 		 335 aa  498  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000835704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2550  patatin  73.95 
 
 		 335 aa  499  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.128442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0718  patatin  74.53 
 
 		 344 aa  484  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0491611  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2613  patatin  67.77 
 
 		 415 aa  455  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02679  Patatin  59.4 
 
 		 378 aa  404  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2356  patatin  51.71 
 
 		 345 aa  322  5e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2812  patatin  48.34 
 
 		 343 aa  318  1e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.338159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3501  patatin family phospholipase  38.49 
 
 		 422 aa  209  7e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  37.66 
 
 		 638 aa  208  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3630  patatin  38.49 
 
 		 424 aa  209  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330139  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0834  patatin family phospholipase  38.17 
 
 		 422 aa  207  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0656  patatin  36.91 
 
 		 373 aa  198  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.52912 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3679  patatin  35.65 
 
 		 357 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.436712  hitchhiker  0.00198477 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04253  predicted esterase  35.65 
 
 		 357 aa  197  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463702  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3621  Patatin  35.65 
 
 		 357 aa  197  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4921  phospholipase, patatin family  35.65 
 
 		 357 aa  197  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04219  hypothetical protein  35.65 
 
 		 357 aa  197  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.361585  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5890  phospholipase, patatin family  35.33 
 
 		 357 aa  196  7e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.547138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4612  patatin family phospholipase  35.33 
 
 		 357 aa  196  7e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4975  patatin family phospholipase  35.33 
 
 		 357 aa  196  7e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.065894  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4925  patatin family phospholipase  35.02 
 
 		 357 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4978  patatin  35.65 
 
 		 364 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.165091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4884  phospholipase, patatin family  35.96 
 
 		 357 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0375868  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4817  patatin  35.65 
 
 		 357 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4971  patatin  35.65 
 
 		 364 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4919  patatin  35.65 
 
 		 364 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0537  patatin  35.33 
 
 		 356 aa  184  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.871804  hitchhiker  0.00848516 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000588  hypothetical protein  31.01 
 
 		 282 aa  151  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.233579  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06415  phospholipase  30.55 
 
 		 305 aa  150  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003010  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  29.02 
 
 		 383 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12929  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02892  hypothetical protein  29.18 
 
 		 381 aa  146  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06662  hypothetical protein  29.25 
 
 		 290 aa  139  7.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1595  hypothetical protein  34.69 
 
 		 389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001123  hypothetical protein  28.16 
 
 		 290 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0238457  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0214  patatin-like phospholipase  30.33 
 
 		 290 aa  129  9.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01883  hypothetical protein  26.81 
 
 		 287 aa  114  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1339  patatin-like phospholipase family protein  25.93 
 
 		 279 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00020938  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2735  patatin  27.27 
 
 		 304 aa  90.1  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0568052  hitchhiker  0.0000690966 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1546  patatin family phospholipase  25.93 
 
 		 279 aa  89  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00664201  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1851  patatin  24.46 
 
 		 283 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.255911  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4122  patatin  27.04 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00238218  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3501  patatin  28.45 
 
 		 289 aa  79  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0437866  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0217  Patatin  27.04 
 
 		 293 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000888537  normal  0.183812 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3804  patatin  25.55 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2446  patatin  25 
 
 		 283 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0616415  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0815  phospholipase, putative  23.34 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0555533  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4243  patatin  26.45 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000146713  hitchhiker  0.00194419 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2593  putative phospholipase  23.9 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0159021 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0215  patatin  27.04 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000161768  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4528  phospholipase, patatin family  23.03 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.430948  normal  0.279256 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0652  phospholipase  22.71 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0951235  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3733  patatin  28.45 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445531 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0803  phospholipase, patatin family  23.03 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.240564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0900  phospholipase, patatin family  22.71 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2763  putative phospholipase  23.9 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.224384  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3931  patatin  28.45 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00834869  normal  0.974076 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0653  phospholipase  22.71 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000540236  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0821  phospholipase, patatin family  22.71 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5960900000000002e-53 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0709  phospholipase  22.71 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0745  phospholipase  22.71 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0574828  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2716  putative phospholipase  23.53 
 
 		 283 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2438  serine protease  23.9 
 
 		 283 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00741052  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0660  patatin  22.64 
 
 		 284 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2473  patatin-like phospholipase  23.9 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000274868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2711  putative phospholipase  23.9 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000208359 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0630  patatin  24.09 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000302445  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0299  hypothetical protein  28.63 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0103  putative esterase-like protein  26.62 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2059  hypothetical protein  27.35 
 
 		 281 aa  72.4  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1409  hypothetical protein  26.39 
 
 		 282 aa  72.4  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0513  Patatin  30.41 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000855028  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4525  hypothetical protein  24.06 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1792  Patatin  23.05 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1253  Patatin  30.07 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0997  patatin  24.21 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00027457  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1044  alpha-beta hydrolase family esterase  29.25 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0733835  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1410  hypothetical protein  21.62 
 
 		 270 aa  55.8  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  36.67 
 
 		 320 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0935  Patatin  24.49 
 
 		 314 aa  46.6  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08930  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  26.39 
 
 		 313 aa  45.8  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0254499  normal  0.882141 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0908  patatin  45.61 
 
 		 359 aa  44.3  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2927  patatin  22.75 
 
 		 301 aa  44.3  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.224599  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0703  patatin  52 
 
 		 365 aa  44.3  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14290  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  27.37 
 
 		 303 aa  43.1  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5552  patatin  46.43 
 
 		 343 aa  43.1  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  24.28 
 
 		 323 aa  42.7  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0543  alpha-beta hydrolase family esterase  21.1 
 
 		 282 aa  43.1  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.47199e-26 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>