49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0945 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_0945    100 
 
 
479 bp  950    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.836757  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  92.51 
 
 
978 bp  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  91.85 
 
 
991 bp  541  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  90.66 
 
 
978 bp  492  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3113  hypothetical protein  90.02 
 
 
624 bp  490  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0979  hypothetical protein  100 
 
 
243 bp  482  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1377    88.94 
 
 
1010 bp  450  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  87.86 
 
 
978 bp  420  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  89.3 
 
 
951 bp  416  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1538    87.08 
 
 
1007 bp  400  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.987441  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  87.02 
 
 
978 bp  396  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  87.02 
 
 
978 bp  396  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  87.59 
 
 
981 bp  394  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  86.96 
 
 
978 bp  392  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1510  hypothetical protein  86.91 
 
 
978 bp  383  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  87.22 
 
 
960 bp  379  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0499  hypothetical protein  86.97 
 
 
561 bp  379  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  86.14 
 
 
978 bp  357  2e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  87.19 
 
 
978 bp  347  2e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0115  hypothetical protein  85.57 
 
 
978 bp  343  2.9999999999999998e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4547  hypothetical protein  85.71 
 
 
978 bp  339  3.9999999999999995e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1241  hypothetical protein  85.1 
 
 
978 bp  333  3e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2814  hypothetical protein  84.86 
 
 
978 bp  325  7e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  85.35 
 
 
978 bp  325  7e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0116  hypothetical protein  85.11 
 
 
978 bp  323  3e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  85.07 
 
 
978 bp  321  1e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  86.27 
 
 
978 bp  319  4e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1511  hypothetical protein  84.47 
 
 
978 bp  309  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1859    85.79 
 
 
930 bp  299  4e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.434219  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  85.96 
 
 
978 bp  297  1e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1728  hypothetical protein  87.65 
 
 
243 bp  244  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  82.43 
 
 
978 bp  228  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1858    89.44 
 
 
210 bp  206  4e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.681721  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2541    81 
 
 
387 bp  95.6  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.494511  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1921  hypothetical protein  81.37 
 
 
978 bp  81.8  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3676    81.37 
 
 
1107 bp  81.8  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3677    81.37 
 
 
902 bp  81.8  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3680  hypothetical protein  81.37 
 
 
978 bp  81.8  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2393  hypothetical protein  78.16 
 
 
717 bp  73.8  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0597783  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  83.65 
 
 
978 bp  71.9  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3681  hypothetical protein  85.06 
 
 
972 bp  69.9  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0135  hypothetical protein  88.71 
 
 
978 bp  67.9  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2034  hypothetical protein  91.84 
 
 
87 bp  65.9  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.285013  normal  0.158282 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0200  hypothetical protein  81.82 
 
 
882 bp  60  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1609  hypothetical protein  84.62 
 
 
150 bp  60  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3575    88.68 
 
 
515 bp  58  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0495  hypothetical protein  89.36 
 
 
171 bp  54  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0548    86.44 
 
 
446 bp  54  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2922  hypothetical protein  96.55 
 
 
978 bp  50.1  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>