More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_12530 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_12530  putrescine carbamoyltransferase  100 
 
 		 351 aa  731    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.797625 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2191  putrescine carbamoyltransferase  76.7 
 
 		 347 aa  555  1e-157  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0676  putrescine carbamoyltransferase  76.42 
 
 		 346 aa  553  1e-156  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.208012  normal  0.0438433 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0670  putrescine carbamoyltransferase  62.2 
 
 		 341 aa  434  1e-121  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000365109  hitchhiker  0.0000131394 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3447  ornithine carbamoyltransferase  58.86 
 
 		 338 aa  398  9.999999999999999e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2960  putrescine carbamoyltransferase  47.04 
 
 		 349 aa  293  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0654  putrescine carbamoyltransferase  45.64 
 
 		 365 aa  290  3e-77  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.889245  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1142  putrescine carbamoyltransferase  42.59 
 
 		 336 aa  277  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  40.94 
 
 		 313 aa  241  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  40.81 
 
 		 302 aa  237  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.661553 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1113  ornithine carbamoyltransferase  41.07 
 
 		 302 aa  227  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  40.5 
 
 		 306 aa  225  7e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  39.56 
 
 		 315 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1572  ornithine carbamoyltransferase  39.13 
 
 		 304 aa  224  2e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.951096 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  37.31 
 
 		 316 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1054  ornithine carbamoyltransferase  38.94 
 
 		 304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  38.23 
 
 		 316 aa  220  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4137  ornithine carbamoyltransferase  37.22 
 
 		 322 aa  220  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  37.31 
 
 		 316 aa  220  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0340  ornithine carbamoyltransferase  38.51 
 
 		 304 aa  220  3e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  36.25 
 
 		 309 aa  219  6e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  38.23 
 
 		 316 aa  219  7e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1646  ornithine carbamoyltransferase  38.82 
 
 		 313 aa  219  7e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2611  ornithine carbamoyltransferase  42.15 
 
 		 299 aa  218  1e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.183412  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  38.2 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  37.61 
 
 		 316 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1756  ornithine carbamoyltransferase  38.94 
 
 		 323 aa  218  2e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0386  ornithine carbamoyltransferase  38.39 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0157  ornithine carbamoyltransferase  37.62 
 
 		 304 aa  217  2e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000760007  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0885  ornithine carbamoyltransferase  37.3 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00577741  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3961  ornithine carbamoyltransferase  37.35 
 
 		 316 aa  216  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000564713  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  39.43 
 
 		 307 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  36.99 
 
 		 308 aa  215  7e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1719  ornithine carbamoyltransferase  39.42 
 
 		 313 aa  215  8e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  37.31 
 
 		 316 aa  215  9e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  36.7 
 
 		 316 aa  215  9e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  37.31 
 
 		 316 aa  215  9e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  38.44 
 
 		 314 aa  215  9e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  37.31 
 
 		 316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0182  ornithine carbamoyltransferase  37.07 
 
 		 305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.533049  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0323  ornithine carbamoyltransferase  38.44 
 
 		 309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2825  ornithine carbamoyltransferase  36.11 
 
 		 316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3190  ornithine carbamoyltransferase  36.88 
 
 		 312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  37.81 
 
 		 309 aa  214  2.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0092  ornithine carbamoyltransferase  39.13 
 
 		 313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.371923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  37.62 
 
 		 301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1573  ornithine carbamoyltransferase  37.42 
 
 		 309 aa  213  3.9999999999999995e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0157636  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  39.69 
 
 		 312 aa  212  7e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1012  ornithine carbamoyltransferase  36.34 
 
 		 306 aa  212  7e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0827825  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  37.58 
 
 		 305 aa  212  7.999999999999999e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0795  ornithine carbamoyltransferase  35.49 
 
 		 306 aa  212  9e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.362917  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1074  ornithine carbamoyltransferase  36.34 
 
 		 306 aa  212  1e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0794  ornithine carbamoyltransferase  40.94 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  39.94 
 
 		 305 aa  210  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  38.15 
 
 		 311 aa  210  3e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  38.15 
 
 		 311 aa  210  3e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  38.63 
 
 		 303 aa  209  6e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0354  ornithine carbamoyltransferase  36.71 
 
 		 304 aa  209  7e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.140894  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  37.89 
 
 		 303 aa  208  1e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28754  Ornithine carbamoyltransferase  36.68 
 
 		 312 aa  207  2e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  36.31 
 
 		 302 aa  206  5e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0957  ornithine carbamoyltransferase  36.22 
 
 		 307 aa  206  7e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3140  ornithine carbamoyltransferase  35.78 
 
 		 311 aa  205  9e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47021  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1108  ornithine carbamoyltransferase  36 
 
 		 306 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  37.27 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0777  ornithine carbamoyltransferase  35.11 
 
 		 296 aa  204  2e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.500854 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  34.26 
 
 		 304 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  37.19 
 
 		 312 aa  203  4e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1599  ornithine carbamoyltransferase  38.44 
 
 		 312 aa  203  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1497  ornithine carbamoyltransferase  36.53 
 
 		 297 aa  202  6e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.651165  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1819  ornithine carbamoyltransferase  34.34 
 
 		 323 aa  202  7e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3073  ornithine carbamoyltransferase  35.47 
 
 		 313 aa  202  9e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1697  ornithine carbamoyltransferase  36.05 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1120  ornithine carbamoyltransferase  36 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2091  ornithine carbamoyltransferase  36.36 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.63428  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1079  ornithine carbamoyltransferase  36 
 
 		 306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  33.96 
 
 		 304 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  37.62 
 
 		 305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  36.11 
 
 		 306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0238  ornithine carbamoyltransferase  38.08 
 
 		 301 aa  200  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0421  ornithine carbamoyltransferase  36.79 
 
 		 312 aa  200  3.9999999999999996e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000841393  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3707  ornithine carbamoyltransferase  38.08 
 
 		 301 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  37.31 
 
 		 305 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1042  ornithine carbamoyltransferase  36.62 
 
 		 329 aa  199  7e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.246407  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  37 
 
 		 305 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2339  ornithine carbamoyltransferase  33.44 
 
 		 309 aa  199  7.999999999999999e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.235287  hitchhiker  0.00582642 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3903  ornithine carbamoyltransferase  37.77 
 
 		 301 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394712 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0277  ornithine carbamoyltransferase  37.35 
 
 		 301 aa  198  9e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4333  ornithine carbamoyltransferase  35.38 
 
 		 306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2405  ornithine carbamoyltransferase  34.36 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.324681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  38.41 
 
 		 355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  36.36 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4847  ornithine carbamoyltransferase  35.71 
 
 		 334 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4159  ornithine carbamoyltransferase  35.47 
 
 		 338 aa  197  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171177  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1814  ornithine carbamoyltransferase  36.68 
 
 		 312 aa  197  3e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  36.34 
 
 		 304 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1048  ornithine carbamoyltransferase  33.54 
 
 		 316 aa  196  5.000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0462  ornithine carbamoyltransferase  33.12 
 
 		 313 aa  195  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4867  ornithine carbamoyltransferase  35.42 
 
 		 334 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  36.99 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>