42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_08680 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_08680  preprotein translocase, SecE subunit  100 
 
 		 126 aa  246  1e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000111106  hitchhiker  0.0000000182665 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09680  preprotein translocase, SecE subunit  44.44 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00103622  hitchhiker  0.00000745581 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2131  preprotein translocase, SecE subunit  51.82 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0325097  normal  0.788588 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  44.19 
 
 		 60 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  31.25 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0092  preprotein translocase subunit SecE  46.51 
 
 		 60 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0089  preprotein translocase subunit SecE  44.19 
 
 		 59 aa  47.8  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000139585  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1533  preprotein translocase, SecE subunit  46.3 
 
 		 89 aa  47  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000234675  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1110  preprotein translocase, SecE subunit  34 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.103006  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0115  preprotein translocase subunit SecE  44.19 
 
 		 59 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000539908  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5211  preprotein translocase subunit SecE  44.19 
 
 		 59 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209683  unclonable  2.82699e-26 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  33.65 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0125  preprotein translocase subunit SecE  41.86 
 
 		 59 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000332702  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0105  preprotein translocase subunit SecE  41.86 
 
 		 59 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.53288e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0095  preprotein translocase subunit SecE  41.86 
 
 		 59 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000233788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0089.1  preprotein translocase subunit SecE  41.86 
 
 		 59 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000332974  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0095  preprotein translocase subunit SecE  41.86 
 
 		 59 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000184804  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0095  preprotein translocase subunit SecE  41.86 
 
 		 59 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0091  preprotein translocase subunit SecE  41.86 
 
 		 63 aa  44.7  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.58206e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0090  preprotein translocase subunit SecE  41.86 
 
 		 59 aa  44.3  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000140466  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0853  preprotein translocase, SecE subunit  48.72 
 
 		 51 aa  44.3  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000244118  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03620  preprotein translocase, SecE subunit  30.48 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0572  preprotein translocase subunit SecE  38.1 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000919573  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0179  preprotein translocase, SecE subunit  37.78 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0120  preprotein translocase, SecE subunit  43.75 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.568104  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4331  preprotein translocase, SecE subunit  30.38 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.673336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0558  preprotein translocase subunit SecE  38.1 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00292414  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5118  preprotein translocase subunit SecE  24.55 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0176  preprotein translocase subunit SecE  38.1 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.103844  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1176  preprotein translocase, SecE subunit  37.5 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000187146  unclonable  0.0000000215336 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  35.71 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0995  preprotein translocase subunit SecE  36.21 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000327583  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1321  preprotein translocase, SecE subunit  31.34 
 
 		 187 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1931  preprotein translocase, SecE subunit  30 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000112962  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6642  preprotein translocase, SecE subunit  25.21 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10651  preprotein translocase subunit SecE  37.74 
 
 		 161 aa  41.2  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0332132 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0408  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  39.47 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000649073  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2078  preprotein translocase, SecE subunit  30.77 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_867  preprotein translocase SecE subunit  36.21 
 
 		 72 aa  40.8  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000768713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0938  preprotein translocase subunit SecE  31.58 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0921  preprotein translocase subunit SecE  31.58 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.613648  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2869  preprotein translocase subunit SecE  41.86 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.07093  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>