More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_06340 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_06340  predicted oxidoreductase of aldo/keto reductase family  100 
 
 
341 aa  710    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.964199  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1050  aldo/keto reductase  57.77 
 
 
343 aa  432  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.780587  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1370  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.81 
 
 
350 aa  256  4e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.778576  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2291  aldo/keto reductase  36.39 
 
 
337 aa  220  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000272492  hitchhiker  0.000000557849 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0465  aldo/keto reductase  35.31 
 
 
340 aa  219  5e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1658  aldo/keto reductase  29.95 
 
 
370 aa  134  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000189792  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0236  aldo/keto reductase  28.07 
 
 
376 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.062444  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1522  aldo/keto reductase  36 
 
 
285 aa  124  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1483  aldo/keto reductase  36 
 
 
285 aa  124  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000333106  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2503  aldo/keto reductase  27.02 
 
 
374 aa  122  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4306  aldo/keto reductase  37.68 
 
 
332 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1664  aldo/keto reductase  27.1 
 
 
370 aa  120  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1226  aldo/keto reductase  26.29 
 
 
408 aa  110  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2306  aldo/keto reductase  25.43 
 
 
365 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1636  aldo/keto reductase  27.4 
 
 
379 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0684  aldo/keto reductase  27.2 
 
 
376 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1641  aldo/keto reductase  29.43 
 
 
315 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.316031  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1570  aldo/keto reductase  26.56 
 
 
379 aa  107  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2639  aldo/keto reductase  28.65 
 
 
400 aa  106  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258498  normal  0.182592 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0951  aldo/keto reductase  28.49 
 
 
406 aa  106  6e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1237  aldo/keto reductase  27.47 
 
 
401 aa  106  7e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.496781  normal  0.0437747 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1623  aldo/keto reductase  27.15 
 
 
399 aa  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.34672  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2266  aldo/keto reductase  28.13 
 
 
317 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000706888 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1210  aldo/keto reductase  27.76 
 
 
315 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1410  aldo/keto reductase  36.05 
 
 
285 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00442876 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0529  aldo/keto reductase  28.61 
 
 
400 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.407453 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1705  aldo/keto reductase  36.09 
 
 
285 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0761  aldo/keto reductase  30.98 
 
 
283 aa  101  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.273558  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3250  aldo/keto reductase  26.43 
 
 
364 aa  100  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0695  aldo/keto reductase  27.7 
 
 
396 aa  100  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.994792  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1286  aldo/keto reductase  27.96 
 
 
410 aa  99.8  6e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0119891  decreased coverage  0.00591823 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16590  predicted oxidoreductase of aldo/keto reductase family  27.79 
 
 
370 aa  99  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.101314  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0564  aldo/keto reductase  31.44 
 
 
280 aa  98.2  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0964  aldo/keto reductase  30.24 
 
 
337 aa  98.2  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000631386  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2567  aldo/keto reductase  24.73 
 
 
371 aa  98.2  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.17886  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1718  aldo/keto reductase  29.04 
 
 
316 aa  98.2  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000512805 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0745  aldo/keto reductase  25.47 
 
 
409 aa  97.8  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0774  aldo/keto reductase  26.73 
 
 
315 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000724112  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2501  aldo/keto reductase  27.92 
 
 
316 aa  97.4  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3350  aldo/keto reductase  26.4 
 
 
398 aa  97.1  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.343434  normal  0.051891 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0241  aldo/keto reductase  28.53 
 
 
376 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.036795 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0763  aldo/keto reductase  26.35 
 
 
400 aa  96.3  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000804851 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0625  aldo/keto reductase  26.15 
 
 
377 aa  95.9  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0356812  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07500  aldo/keto reductase  24.8 
 
 
376 aa  95.1  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1455  aldo/keto reductase  28.61 
 
 
399 aa  95.1  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.981784  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0521  aldo/keto reductase  30.17 
 
 
294 aa  94.4  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0914  aldo/keto reductase  27.69 
 
 
316 aa  93.6  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.288271  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3197  aldo/keto reductase  24.86 
 
 
374 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000351042  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0152  aldo/keto reductase  26.2 
 
 
315 aa  93.6  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.145765  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2899  aldo/keto reductase  24.86 
 
 
374 aa  92.8  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4508  aldo/keto reductase  28.85 
 
 
341 aa  92.4  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532493  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1437  aldo/keto reductase  26.97 
 
 
316 aa  92  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1446  aldo/keto reductase  26.39 
 
 
383 aa  91.7  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00469922  normal  0.148441 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0288  aldo/keto reductase  32.38 
 
 
328 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2764  aldo/keto reductase  26.4 
 
 
376 aa  90.9  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0288  aldo/keto reductase  32.38 
 
 
328 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.855792  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1210  aldo/keto reductase  24.39 
 
 
409 aa  90.1  5e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.97605  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1081  aldo/keto reductase  32.66 
 
 
286 aa  89.7  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1727  aldo/keto reductase family oxidoreductase  28.57 
 
 
316 aa  89.7  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.349394 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1288  aldo/keto reductase  26.4 
 
 
380 aa  89.7  7e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00132555  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2830  aldo/keto reductase  27.57 
 
 
379 aa  89.4  8e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0663366  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1414  aldo/keto reductase  26.55 
 
 
386 aa  88.6  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3653  aldo/keto reductase  31.67 
 
 
347 aa  89  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.233218  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1880  aldo/keto reductase  34.1 
 
 
338 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1801  aldo/keto reductase  33.64 
 
 
338 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1355  aldo/keto reductase  29.6 
 
 
369 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.0541825 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3802  aldo/keto reductase  30.12 
 
 
386 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1733  aldo/keto reductase family oxidoreductase  24.53 
 
 
382 aa  88.2  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.410484  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2293  aldo/keto reductase  32.04 
 
 
294 aa  88.2  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.253278  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0658  aldo/keto reductase  33.99 
 
 
288 aa  88.2  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3085  aldo/keto reductase  31.56 
 
 
311 aa  88.2  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1895  aldo/keto reductase  29.11 
 
 
293 aa  87.4  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1193  aldo/keto reductase  31.43 
 
 
311 aa  87.4  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0446  aldo/keto reductase  30.89 
 
 
320 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1923  aldo/keto reductase  29.36 
 
 
312 aa  87  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.226373  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0550  aldo/keto reductase  30.64 
 
 
343 aa  86.7  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.216152  normal  0.992757 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1335  aldo/keto reductase  29.61 
 
 
294 aa  86.7  6e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0222  aldo/keto reductase  25.34 
 
 
375 aa  86.7  6e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.782387  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0576  aldo/keto reductase  27.31 
 
 
351 aa  86.3  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0309  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.2 
 
 
275 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000118844  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4232  aldo/keto reductase  30.14 
 
 
345 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1451  aldo/keto reductase  24.86 
 
 
384 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3786  aldo/keto reductase  29.49 
 
 
327 aa  84.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0153976 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1306  aldo/keto reductase  30.92 
 
 
287 aa  85.1  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.139902  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0276  aldo/keto reductase  25 
 
 
397 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.874141  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1630  aldo/keto reductase  24.71 
 
 
397 aa  83.6  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2076  aldo/keto reductase  32.72 
 
 
338 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0928  aldo/keto reductase  33.64 
 
 
339 aa  84  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339617  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0272  aldo/keto reductase  21.14 
 
 
370 aa  83.6  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl252  putative aldo/keto reductase  31.55 
 
 
328 aa  83.6  0.000000000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00286495  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0319  aldo/keto reductase  24.73 
 
 
381 aa  83.2  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0687  aldo/keto reductase  28.64 
 
 
319 aa  82.8  0.000000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0504  aldo/keto reductase  26.61 
 
 
376 aa  82.8  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.122684  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0104  aldo/keto reductase  29.41 
 
 
294 aa  82.8  0.000000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3487  aldo/keto reductase  30.56 
 
 
341 aa  82  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0206  aldo/keto reductase  25.82 
 
 
393 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0407  aldo/keto reductase  26.98 
 
 
383 aa  82  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3284  aldo/keto reductase  30.43 
 
 
343 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3304  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  32.87 
 
 
311 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236042 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0448  aldo/keto reductase  23.25 
 
 
374 aa  81.6  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>