More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2887 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2887  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  100 
 
 
297 aa  580  1.0000000000000001e-165  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1061  phosphate ABC transporter permease  69.73 
 
 
298 aa  408  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0764  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  67.68 
 
 
297 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.316 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0565  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  67.24 
 
 
296 aa  389  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1926  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  65.74 
 
 
309 aa  380  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0478834  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21615  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  53.85 
 
 
318 aa  310  1e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  47.75 
 
 
291 aa  275  6e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0751  phosphate ABC transporter inner membrane protein  49.48 
 
 
297 aa  272  5.000000000000001e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0108561  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1779  phosphate ABC transporter, permease protein  48.1 
 
 
296 aa  272  6e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0094  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  49.29 
 
 
315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2277  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.67 
 
 
646 aa  259  3e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0488  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  47.39 
 
 
291 aa  258  7e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.456942  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0421  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.69 
 
 
290 aa  258  9e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1571  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  47.04 
 
 
291 aa  256  3e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0348  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.69 
 
 
291 aa  255  8e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0704  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  49.48 
 
 
303 aa  253  3e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0481  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.42 
 
 
645 aa  247  2e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.04 
 
 
292 aa  247  2e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2982  phosphate ABC transporter permease  47.96 
 
 
649 aa  241  1e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0980  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.25 
 
 
303 aa  240  2e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.120988 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1117  hypothetical protein  51.26 
 
 
627 aa  240  2e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4409  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.2 
 
 
296 aa  238  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0464334  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2105  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.37 
 
 
283 aa  237  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1162  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.77 
 
 
284 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4147  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.89 
 
 
336 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4121  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.89 
 
 
336 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0619  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  42.47 
 
 
295 aa  229  3e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.637823  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4005  phosphate ABC transporter inner membrane protein  42.9 
 
 
336 aa  228  9e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.475796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0605  phosphate ABC transporter, permease protein  42.47 
 
 
295 aa  227  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.77912  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0419  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.19 
 
 
325 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.730812 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1668  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.05 
 
 
281 aa  223  3e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000035104  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1918  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.46 
 
 
604 aa  223  3e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.396887  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1604  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.49 
 
 
284 aa  219  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000397487  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4291  phosphate ABC transporter, permease protein  43.91 
 
 
290 aa  218  7e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2103  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.48 
 
 
310 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2119  phosphate ABC transporter, inner membrane component  41.16 
 
 
308 aa  216  4e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0068  phosphate ABC transporter, permease protein  39.49 
 
 
327 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.532516  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2546  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.07 
 
 
535 aa  213  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4229  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.91 
 
 
301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1086  phosphate ABC transporter permease  39.12 
 
 
310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2479  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.02 
 
 
307 aa  213  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001263  phosphate transport system permease protein PstC  39.64 
 
 
310 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4404  phosphate ABC transporter, permease protein  39.59 
 
 
316 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4387  phosphate ABC transporter, permease protein  40.27 
 
 
316 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.434868  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0379  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.36 
 
 
308 aa  212  5.999999999999999e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2566  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.4 
 
 
286 aa  212  7e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4351  phosphate ABC transporter, permease protein  39.93 
 
 
316 aa  211  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4124  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.07 
 
 
316 aa  211  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4173  phosphate ABC transporter permease  39.59 
 
 
316 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0231  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.81 
 
 
286 aa  211  1e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4495  phosphate ABC transporter permease  39.59 
 
 
316 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0849  phosphate ABC transporter, permease protein  39.59 
 
 
316 aa  211  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.68749  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1655  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.64 
 
 
311 aa  210  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4011  phosphate ABC transporter, permease  39.59 
 
 
316 aa  210  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0794  phosphate ABC transporter permease  39.46 
 
 
320 aa  211  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2589  ABC phosphate transporter inner membrane protein PstC  40.56 
 
 
301 aa  210  3e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0122175  normal  0.83958 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4291  phosphate ABC transporter, permease protein  39.38 
 
 
316 aa  209  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00236226 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4021  phosphate ABC transporter, permease  39.25 
 
 
316 aa  209  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4493  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.52 
 
 
320 aa  209  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.89646 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1098  phosphate ABC transporter, permease protein  37.67 
 
 
325 aa  209  6e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0705  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.04 
 
 
301 aa  208  7e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0779351  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0493  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.97 
 
 
307 aa  208  1e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1094  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.25 
 
 
284 aa  205  8e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1023  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.1 
 
 
309 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1052  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.1 
 
 
309 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.130457  hitchhiker  0.0000180725 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_147  phosphate ABC transporter, permease protein  41.46 
 
 
286 aa  203  3e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3636  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.33 
 
 
304 aa  203  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.301349  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1489  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.83 
 
 
343 aa  203  3e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111462  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1828  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.1 
 
 
314 aa  203  3e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1965  phosphate ABC transporter, permease protein  37.54 
 
 
281 aa  202  5e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3563  phosphate ABC transporter permease  38.98 
 
 
311 aa  202  6e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0139  phosphate ABC transporter, permease protein  41.11 
 
 
286 aa  201  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05138  ABC-type phosphate transport system permease component  40.51 
 
 
322 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3955  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.16 
 
 
315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.189058  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1449  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.23 
 
 
308 aa  200  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1478  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.23 
 
 
308 aa  200  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0682584  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2833  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.91 
 
 
321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1250  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.9 
 
 
306 aa  196  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.125763  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3819  phosphate ABC transporter, permease component  36.58 
 
 
295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.37684 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0959  phosphate ABC transporter, permease protein  37.88 
 
 
308 aa  195  9e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1959  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.44 
 
 
290 aa  194  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4581  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.68 
 
 
313 aa  195  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.235553  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0046  phosphate ABC transporter permease  37.68 
 
 
313 aa  191  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.640676  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2839  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40 
 
 
596 aa  190  2e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1378  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.38 
 
 
287 aa  189  4e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000500776  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1534  phosphate transport system permease protein  36.03 
 
 
489 aa  189  4e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.718662  normal  0.490878 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0588  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.42 
 
 
319 aa  189  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.175196 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28130  phosphate ABC transporter membrane protein  36.75 
 
 
288 aa  189  4e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2999  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.6 
 
 
316 aa  189  5e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3317  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.84 
 
 
464 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0169  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.6 
 
 
493 aa  189  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.516158 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1931  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.85 
 
 
288 aa  187  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0179  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.27 
 
 
493 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.558643 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0287  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.5 
 
 
315 aa  186  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0473771  normal  0.154696 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2290  phosphate ABC transporter permease  35.71 
 
 
483 aa  187  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1920  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.05 
 
 
480 aa  185  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.71778  normal  0.886394 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.11 
 
 
287 aa  185  7e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3120  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.24 
 
 
456 aa  185  7e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43315  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0770  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.75 
 
 
497 aa  185  8e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0798935  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2139  phosphate ABC transporter, permease protein  36.75 
 
 
496 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>