More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2885 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2885  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  100 
 
 		 449 aa  887    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.326316 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0520  protein-disulfide reductase  34.86 
 
 		 610 aa  209  1e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00644414  normal  0.263509 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3915  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.19 
 
 		 613 aa  208  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3666  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.98 
 
 		 628 aa  206  8e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.162085  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0636  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.77 
 
 		 466 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.619274 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0583  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.64 
 
 		 610 aa  199  7e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.25 
 
 		 611 aa  199  7e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0281  thiol:disulfide interchange protein  29.6 
 
 		 630 aa  198  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2056  divalent cation transporter  30.5 
 
 		 575 aa  197  4.0000000000000005e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000288452  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.36 
 
 		 810 aa  196  6e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4167  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.89 
 
 		 586 aa  196  9e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.78 
 
 		 602 aa  194  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.23 
 
 		 604 aa  193  5e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3506  protein-disulfide reductase  32.94 
 
 		 642 aa  193  6e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0145  cytochrome C biogenesis protein transmembrane region  29.75 
 
 		 570 aa  192  8e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0591  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region/thioredoxin-related  39.53 
 
 		 471 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.945166  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.93 
 
 		 613 aa  190  5e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0372  Protein-disulfide reductase  29.83 
 
 		 750 aa  189  9e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754802  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2683  protein-disulfide reductase  31.69 
 
 		 654 aa  188  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0416  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.79 
 
 		 624 aa  189  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136243  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.71 
 
 		 613 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  30 
 
 		 609 aa  188  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.85 
 
 		 613 aa  188  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.73 
 
 		 619 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.9 
 
 		 610 aa  187  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  29.39 
 
 		 586 aa  187  3e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.09 
 
 		 619 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0636  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.86 
 
 		 619 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0701  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.64 
 
 		 616 aa  186  6e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0529075  hitchhiker  0.000000140832 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0545  thiol:disulfide interchange protein DsbD  31.64 
 
 		 616 aa  186  6e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.221768  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  28.79 
 
 		 586 aa  186  7e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.5 
 
 		 619 aa  186  9e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2559  thiol:disulfide interchange protein DsbD  32.04 
 
 		 752 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.745294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0980  thiol:disulfide interchange protein DsbD (protein-disulfide reductase) (disulfide reductase)  28.51 
 
 		 574 aa  184  3e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0538  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.82 
 
 		 607 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.126162  decreased coverage  0.00471183 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0953  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.46 
 
 		 608 aa  182  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447642  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  30.48 
 
 		 623 aa  182  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002212  cytochrome c-type biogenesis protein DsbD protein-disulfide reductase  30.79 
 
 		 603 aa  180  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2811  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.01 
 
 		 624 aa  180  4.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1055  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.19 
 
 		 626 aa  180  5.999999999999999e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000114598  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2274  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.61 
 
 		 600 aa  179  7e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2990  thiol:disulfide interchange transmembrane protein  32.75 
 
 		 608 aa  179  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0446  protein-disulfide reductase  31.59 
 
 		 731 aa  179  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3268  Protein-disulfide reductase  32.84 
 
 		 605 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0181869 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.97 
 
 		 789 aa  178  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2773  Protein-disulfide reductase  31.11 
 
 		 632 aa  176  6e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3288  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.49 
 
 		 624 aa  176  9e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3681  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.84 
 
 		 595 aa  176  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.576987  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0728  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.84 
 
 		 595 aa  176  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0712  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.23 
 
 		 570 aa  175  9.999999999999999e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.642209  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3828  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.84 
 
 		 595 aa  176  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368823  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1312  Protein-disulfide reductase  32.6 
 
 		 625 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0091784  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0079  Protein-disulfide reductase  30.12 
 
 		 557 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000987227 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2010  protein-disulfide reductase  30.13 
 
 		 649 aa  173  5e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231364 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1653  hypothetical protein  27.72 
 
 		 449 aa  173  6.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0084  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.22 
 
 		 592 aa  172  9e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00156  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.01 
 
 		 592 aa  172  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1646  hypothetical protein  27.48 
 
 		 449 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4360  thiol:disulfide interchange protein  30.38 
 
 		 603 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0322676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4244  protein-disulfide reductase  33.1 
 
 		 600 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2810  protein-disulfide reductase  32.77 
 
 		 618 aa  169  9e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126387  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0081  protein-disulfide reductase  30.38 
 
 		 558 aa  169  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3272  Protein-disulfide reductase  31.53 
 
 		 611 aa  169  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0226485 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3615  Protein-disulfide reductase  31.86 
 
 		 626 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573017  hitchhiker  0.0000000193428 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1778  protein-disulfide reductase  30.14 
 
 		 629 aa  168  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1181  thiol:disulfide interchange protein DsbD  28.29 
 
 		 628 aa  166  5.9999999999999996e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.753424  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1087  thiol:disulfide interchange protein DsbD  25.71 
 
 		 582 aa  166  9e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000524195  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1355  Thioredoxin domain protein  29.74 
 
 		 577 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1568  protein-disulfide reductase  30.89 
 
 		 622 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.314287  normal  0.0195641 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4907  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.8 
 
 		 602 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6280  protein-disulfide reductase  30.97 
 
 		 623 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.432431 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0343  protein-disulfide reductase  32.24 
 
 		 631 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0138358 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3247  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.41 
 
 		 616 aa  163  7e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0836496  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03921  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.38 
 
 		 631 aa  162  8.000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0722  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.55 
 
 		 583 aa  162  9e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0906  thiol:disulfide interchange protein DsbD  27.14 
 
 		 563 aa  161  2e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.664459  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0503  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.16 
 
 		 583 aa  161  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2921  Protein-disulfide reductase  32.77 
 
 		 604 aa  161  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351714 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3415  disulfide reductase  31.47 
 
 		 623 aa  159  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.189847 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0323  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.75 
 
 		 563 aa  157  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046864 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3876  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.84 
 
 		 565 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3856  Protein-disulfide reductase  28.84 
 
 		 565 aa  156  6e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1683  thiol:disulfide interchange protein DsbD  30.05 
 
 		 624 aa  156  7e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.424941  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0898  protein-disulfide reductase  27.21 
 
 		 589 aa  156  9e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5652  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.6 
 
 		 565 aa  154  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390549  normal  0.76636 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04006  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.84 
 
 		 565 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03968  hypothetical protein  28.84 
 
 		 565 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2382  Protein-disulfide reductase  26.67 
 
 		 581 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  7.870920000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0403  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.18 
 
 		 561 aa  154  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.471471  hitchhiker  0.00764608 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4665  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.33 
 
 		 565 aa  154  4e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.836853  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4691  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.33 
 
 		 565 aa  154  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4377  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.33 
 
 		 565 aa  154  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111987  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1357  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.01 
 
 		 612 aa  154  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.669889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4684  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.84 
 
 		 567 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4601  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.93 
 
 		 567 aa  153  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4605  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.6 
 
 		 565 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0011627  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4741  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.72 
 
 		 567 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4719  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.72 
 
 		 567 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0129572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4593  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.6 
 
 		 567 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.610696 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3535  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.05 
 
 		 572 aa  150  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>