More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1271 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1271  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 429 aa  876    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231459  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2029  adenylosuccinate synthetase  61.07 
 
 		 429 aa  537  1e-151  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00381049  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  57.81 
 
 		 430 aa  522  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  57.34 
 
 		 430 aa  519  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  56.41 
 
 		 431 aa  508  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3019  adenylosuccinate synthetase  57.88 
 
 		 424 aa  503  1e-141  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  56.13 
 
 		 451 aa  502  1e-141  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  55.24 
 
 		 430 aa  502  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  55.01 
 
 		 432 aa  499  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  55.48 
 
 		 431 aa  501  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2598  adenylosuccinate synthetase  57.34 
 
 		 432 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0051551  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2691  adenylosuccinate synthetase  57.58 
 
 		 432 aa  497  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321196  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1265  adenylosuccinate synthetase  57.58 
 
 		 432 aa  497  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0163864  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  54.08 
 
 		 433 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  55.66 
 
 		 427 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  54.31 
 
 		 432 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2504  adenylosuccinate synthetase  57.58 
 
 		 431 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000458788 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  54.59 
 
 		 426 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2266  adenylosuccinate synthetase  56.37 
 
 		 425 aa  490  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1939  adenylosuccinate synthetase  55.42 
 
 		 428 aa  489  1e-137  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  54.31 
 
 		 427 aa  486  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1939  adenylosuccinate synthetase  55.4 
 
 		 431 aa  488  1e-136  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  55.48 
 
 		 427 aa  488  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02633  adenylosuccinate synthetase  54.8 
 
 		 430 aa  484  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  53.18 
 
 		 424 aa  481  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  54.35 
 
 		 430 aa  481  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  54.01 
 
 		 427 aa  481  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  52.91 
 
 		 428 aa  480  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0578  adenylosuccinate synthetase  55.5 
 
 		 432 aa  479  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000001206 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  54.12 
 
 		 428 aa  479  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  54.12 
 
 		 428 aa  476  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1523  adenylosuccinate synthetase  53.49 
 
 		 442 aa  476  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000140547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0676  adenylosuccinate synthetase  51.95 
 
 		 446 aa  474  1e-132  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.678663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1281  adenylosuccinate synthetase  52.18 
 
 		 446 aa  474  1e-132  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0694  adenylosuccinate synthetase  53.5 
 
 		 432 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07600  Adenylosuccinate synthetase  52.22 
 
 		 430 aa  469  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  52.71 
 
 		 427 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  53.18 
 
 		 429 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3793  adenylosuccinate synthetase  53.5 
 
 		 432 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2007  adenylosuccinate synthetase  52.69 
 
 		 431 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00017376  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3648  adenylosuccinate synthetase  53.5 
 
 		 432 aa  468  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  56.57 
 
 		 430 aa  466  9.999999999999999e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1784  adenylosuccinate synthetase  53.4 
 
 		 430 aa  467  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  52.71 
 
 		 427 aa  465  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4889  adenylosuccinate synthetase  53.16 
 
 		 430 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0250802  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1978  adenylosuccinate synthetase  51.52 
 
 		 432 aa  463  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  54.17 
 
 		 427 aa  462  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  51.98 
 
 		 447 aa  462  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4680  adenylosuccinate synthetase  52.93 
 
 		 430 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  51.75 
 
 		 447 aa  462  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  52.58 
 
 		 427 aa  461  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  53.04 
 
 		 432 aa  464  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4765  adenylosuccinate synthetase  53.16 
 
 		 430 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0941  adenylosuccinate synthetase  51.29 
 
 		 435 aa  461  1e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1719  adenylosuccinate synthetase  53.16 
 
 		 430 aa  464  1e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  51.98 
 
 		 447 aa  461  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3013  adenylosuccinate synthetase  54.33 
 
 		 430 aa  462  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220071  normal  0.0269955 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2126  adenylosuccinate synthetase  52.93 
 
 		 428 aa  464  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4941  adenylosuccinate synthetase  53.16 
 
 		 430 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348011 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  51.28 
 
 		 444 aa  458  9.999999999999999e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1049  adenylosuccinate synthetase  51.05 
 
 		 435 aa  460  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0641  adenylosuccinate synthetase  52.57 
 
 		 431 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143682 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  52.48 
 
 		 427 aa  461  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65230  adenylosuccinate synthetase  51.76 
 
 		 430 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3138  adenylosuccinate synthetase  52.96 
 
 		 430 aa  459  9.999999999999999e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32892  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5667  adenylosuccinate synthetase  51.52 
 
 		 430 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04044  adenylosuccinate synthetase  52.34 
 
 		 432 aa  457  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3816  Adenylosuccinate synthase  52.34 
 
 		 432 aa  457  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4784  adenylosuccinate synthetase  52.1 
 
 		 432 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4648  adenylosuccinate synthetase  52.34 
 
 		 432 aa  457  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.378806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  52 
 
 		 427 aa  455  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0497  adenylosuccinate synthetase  51.64 
 
 		 432 aa  455  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04006  hypothetical protein  52.34 
 
 		 432 aa  457  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4708  adenylosuccinate synthetase  52.34 
 
 		 432 aa  457  1e-127  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05631  adenylosuccinate synthetase  51.28 
 
 		 436 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5693  adenylosuccinate synthetase  52.34 
 
 		 432 aa  457  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.580203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05331  adenylosuccinate synthetase  51.75 
 
 		 436 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  51.52 
 
 		 444 aa  457  1e-127  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4727  adenylosuccinate synthetase  52.1 
 
 		 432 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3836  adenylosuccinate synthetase  52.34 
 
 		 432 aa  457  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.930032  hitchhiker  0.00000195768 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35160  Adenylosuccinate synthetase  53.43 
 
 		 429 aa  455  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3716  adenylosuccinate synthetase  52.57 
 
 		 432 aa  455  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316289  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4763  adenylosuccinate synthetase  52.1 
 
 		 432 aa  455  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.707154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4736  adenylosuccinate synthetase  52.34 
 
 		 432 aa  457  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4644  adenylosuccinate synthetase  52.1 
 
 		 432 aa  455  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3282  adenylosuccinate synthetase  51.52 
 
 		 437 aa  456  1e-127  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00809393  normal  0.019729 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4420  adenylosuccinate synthetase  52.34 
 
 		 432 aa  457  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  52.1 
 
 		 432 aa  457  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2419  adenylosuccinate synthetase  50.83 
 
 		 424 aa  455  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000351382  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4634  adenylosuccinate synthetase  52.1 
 
 		 432 aa  455  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05071  adenylosuccinate synthetase  51.52 
 
 		 437 aa  458  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.22054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07421  adenylosuccinate synthetase  51.05 
 
 		 439 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  50.23 
 
 		 430 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4937  adenylosuccinate synthetase  52.46 
 
 		 430 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0073  adenylosuccinate synthetase  53.33 
 
 		 448 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 		 427 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2344  adenylosuccinate synthetase  53.33 
 
 		 448 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0528  adenylosuccinate synthetase  51.99 
 
 		 429 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650318  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1823  adenylosuccinate synthetase  53.33 
 
 		 448 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0436  adenylosuccinate synthetase  52.8 
 
 		 432 aa  453  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000472279 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>