79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0608 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0608  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  100 
 
 		 417 aa  833    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0543645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2687  Polysulphide reductase NrfD  55.21 
 
 		 417 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046719 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2271  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  55.31 
 
 		 419 aa  464  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2549  polysulphide reductase NrfD  54.7 
 
 		 410 aa  455  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2935  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  55.56 
 
 		 418 aa  455  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.52066  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0273  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  54.48 
 
 		 409 aa  443  1e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3393  Polysulphide reductase NrfD  54.48 
 
 		 411 aa  436  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0779  formate dehydrogenase, b-type cytochrome subunit, putative  26.15 
 
 		 401 aa  95.9  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0292  Polysulphide reductase NrfD  28.84 
 
 		 396 aa  95.5  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.468469  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2602  polysulphide reductase, NrfD  28.22 
 
 		 398 aa  94  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1061  polysulphide reductase, NrfD  24.68 
 
 		 401 aa  92.8  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.079733 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_175  molybdopterin oxidoreductase, formate dehydrogenase membrane subunit  25.54 
 
 		 403 aa  92.8  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.100817  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0166  polysulphide reductase, NrfD  25.54 
 
 		 403 aa  92.4  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.391929  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2943  polysulphide reductase, NrfD  27.01 
 
 		 394 aa  92.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.486448  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0186  formate dehydrogenase, membrane subunit, putative  25.24 
 
 		 403 aa  92  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2265  Polysulphide reductase NrfD  26.83 
 
 		 403 aa  90.9  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1957  Polysulphide reductase NrfD  26.29 
 
 		 403 aa  90.1  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0160  polysulphide reductase, NrfD  25.88 
 
 		 402 aa  88.2  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3386  polysulphide reductase, NrfD  25.77 
 
 		 403 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3972  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  24.6 
 
 		 386 aa  83.6  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.158247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1198  Polysulphide reductase NrfD  27.94 
 
 		 400 aa  83.2  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3042  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.74 
 
 		 744 aa  83.2  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1578  putative hydrogenase cytochrome b subunit  26.12 
 
 		 394 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.534156  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1044  putative hydrogenase cytochrome b subunit  26.12 
 
 		 401 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4090  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  24 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194025  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0524  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  27.95 
 
 		 416 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.920848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2087  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  26.61 
 
 		 731 aa  77  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1790  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.38 
 
 		 731 aa  76.6  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0170  Polysulphide reductase NrfD  24.4 
 
 		 378 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1869  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.38 
 
 		 731 aa  73.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.856186  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0570  Polysulphide reductase NrfD  24.48 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2252  polysulphide reductase NrfD  24.73 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.38952  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4619  Polysulphide reductase NrfD  23.51 
 
 		 416 aa  69.7  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3524  polysulphide reductase NrfD  24.87 
 
 		 401 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.902311  normal  0.369035 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2040  Polysulphide reductase NrfD  23.75 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.918159  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4239  nickel-dependent hydrogenase, membrane protein  29.76 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0455  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  24.26 
 
 		 729 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0507  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  24.42 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1957  Polysulphide reductase NrfD  24.01 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0356047  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0512  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  24.13 
 
 		 415 aa  63.2  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0651  hmc operon protein 3  23.66 
 
 		 389 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.958991  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0875  Polysulphide reductase NrfD  24.27 
 
 		 402 aa  61.2  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.946275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2596  Polysulphide reductase NrfD  24.4 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1945  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  22.91 
 
 		 438 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0461  putative hydrogenase cytochrome b subunit  25.41 
 
 		 381 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1116  polysulphide reductase, NrfD  24.76 
 
 		 386 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3521  polysulphide reductase NrfD  27.88 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.538127  normal  0.625626 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2407  polysulphide reductase, NrfD  22.63 
 
 		 388 aa  56.2  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385052 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2006  polysulphide reductase, NrfD  25 
 
 		 403 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1801  polysulphide reductase NrfD  25.97 
 
 		 408 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1125  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  23.6 
 
 		 435 aa  54.7  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1872  Polysulphide reductase NrfD  23.95 
 
 		 403 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3262  Polysulphide reductase NrfD  25.5 
 
 		 442 aa  53.1  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0389204 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3137  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  23.94 
 
 		 446 aa  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0146  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  22.07 
 
 		 421 aa  52.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  22.88 
 
 		 391 aa  49.7  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0784  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  28.17 
 
 		 442 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.242896  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2504  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  24.48 
 
 		 382 aa  48.5  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130941 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27690  polysulphide reductase  30.07 
 
 		 384 aa  47  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  24.88 
 
 		 393 aa  47  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2383  Polysulphide reductase NrfD  28.99 
 
 		 408 aa  45.8  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.290901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3933  polysulphide reductase NrfD  27.78 
 
 		 493 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.053608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1984  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  21.72 
 
 		 414 aa  45.8  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00764136  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3002  polysulphide reductase, NrfD  30 
 
 		 468 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130542 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1906  polysulphide reductase, NrfD  23.11 
 
 		 413 aa  44.3  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0698  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  24.35 
 
 		 392 aa  43.1  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02820  hypothetical protein  24.35 
 
 		 392 aa  43.1  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4307  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  24.35 
 
 		 392 aa  43.1  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3281  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  24.35 
 
 		 392 aa  43.1  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02871  predicted hydrogenase 2 cytochrome b type component  24.35 
 
 		 392 aa  43.1  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3175  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  24.35 
 
 		 392 aa  43.1  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2275  reductase, transmembrane subunit, putative  22.43 
 
 		 387 aa  43.5  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0701  Polysulphide reductase NrfD  24.35 
 
 		 392 aa  43.1  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  24.32 
 
 		 389 aa  43.1  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3496  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  23.3 
 
 		 392 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.426978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3321  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  23.3 
 
 		 392 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.437559  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3330  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  23.3 
 
 		 392 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.353265  normal  0.837141 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3395  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  23.3 
 
 		 392 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.522703 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3401  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  23.3 
 
 		 392 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>