22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A2910 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A2910  hypothetical protein  100 
 
 		 670 aa  1358    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00903666 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3026  hypothetical protein  41.86 
 
 		 672 aa  496  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1305  hypothetical protein  31.99 
 
 		 673 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0182944  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0573  putative DNA-binding protein  27.46 
 
 		 667 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000329347  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0969  hypothetical protein  32.89 
 
 		 510 aa  94.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.670646 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1469  hypothetical protein  26.01 
 
 		 543 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0521715  normal  0.76039 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4206  hypothetical protein  31.65 
 
 		 499 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0384  hypothetical protein  26.4 
 
 		 533 aa  82  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.686449  normal  0.193753 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2490  hypothetical protein  31.65 
 
 		 498 aa  79.7  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1410  reverse transcriptase  32.41 
 
 		 505 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0574  hypothetical protein  28.32 
 
 		 527 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4255  hypothetical protein  24.16 
 
 		 558 aa  74.3  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.669454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1153  hypothetical protein  27.34 
 
 		 557 aa  72.4  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2087  hypothetical protein  30.43 
 
 		 533 aa  71.6  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.298307  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1069  hypothetical protein  22.02 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0552  hypothetical protein  29.37 
 
 		 512 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0549  hypothetical protein, putative phage gene  29.63 
 
 		 530 aa  68.6  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.444707  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1733  reverse transcriptase  29.05 
 
 		 492 aa  47.4  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000121059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3976  hypothetical protein  26.7 
 
 		 579 aa  45.8  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.228372 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.9 
 
 		 731 aa  45.8  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  28.24 
 
 		 731 aa  44.7  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  29.41 
 
 		 727 aa  44.3  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>