19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0645 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A0645  gp16  100 
 
 		 246 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000140847 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  44.44 
 
 		 1550 aa  65.9  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  39.77 
 
 		 1969 aa  62  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  38.64 
 
 		 1132 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  44.83 
 
 		 1976 aa  58.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  41.67 
 
 		 14944 aa  53.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  38.89 
 
 		 1507 aa  50.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.53 
 
 		 1383 aa  50.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  32.53 
 
 		 2003 aa  47.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  29.41 
 
 		 1195 aa  47.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2176  major tail protein  37.35 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430295 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2886  major tail protein  37.35 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146277 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  32.95 
 
 		 972 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04803  hypothetical protein  37.84 
 
 		 441 aa  44.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.576008  normal  0.151498 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1999  immunoglobulin I-set domain-containing protein  35.23 
 
 		 1362 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354516  normal  0.677634 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1083  immunoglobulin I-set domain protein  41.67 
 
 		 134 aa  43.9  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4612  immunoglobulin I-set domain-containing protein  40 
 
 		 714 aa  43.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  32.94 
 
 		 3563 aa  42  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  32.14 
 
 		 1607 aa  42  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>