51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2441 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2441  putative pyruvyl transferase  100 
 
 		 426 aa  885    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248643 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2226  putative pyruvyl transferase  99.3 
 
 		 426 aa  879    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0937494  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2334  putative pyruvyl transferase  99.3 
 
 		 426 aa  879    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.703418 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2327  putative pyruvyl transferase  99.3 
 
 		 426 aa  879    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.244725  normal  0.210218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2283  putative pyruvyl transferase  99.3 
 
 		 426 aa  880    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193394 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1612  polysaccharide pyruvyl transferase  67.61 
 
 		 426 aa  622  1e-177  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00148194  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1017  putative pyruvyl transferase  67.61 
 
 		 426 aa  621  1e-177  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826012  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01951  predicted pyruvyl transferase  67.84 
 
 		 426 aa  623  1e-177  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0168831  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2659  putative pyruvyl transferase  67.61 
 
 		 426 aa  624  1e-177  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.520792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01940  hypothetical protein  67.84 
 
 		 426 aa  623  1e-177  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0157145  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2979  putative pyruvyl transferase  66.9 
 
 		 426 aa  619  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.158831  hitchhiker  0.000214392 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2337  putative pyruvyl transferase  67.37 
 
 		 426 aa  620  1e-176  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00581258  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1187  putative pyruvyl transferase  66.9 
 
 		 426 aa  615  1e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1596  putative pyruvyl transferase  67.14 
 
 		 426 aa  600  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.077358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3356  polysaccharide pyruvyl transferase  24.37 
 
 		 435 aa  91.7  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1129  polysaccharide pyruvyl transferase  27.39 
 
 		 428 aa  89.7  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.904656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0956  polysaccharide pyruvyl transferase  24.35 
 
 		 407 aa  82.4  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0618  hypothetical protein  23.53 
 
 		 405 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  normal  0.0191891 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3108  polysaccharide pyruvyl transferase  24.81 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00646313  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0960  polysaccharide pyruvyl transferase  20.62 
 
 		 418 aa  71.6  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.63346  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0586  polysaccharide pyruvyl transferase  18.81 
 
 		 395 aa  63.5  0.000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00188852  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2943  polysaccharide pyruvyl transferase  24.34 
 
 		 367 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4122  polysaccharide pyruvyl transferase  21.58 
 
 		 367 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000169583  unclonable  0.000000000262551 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0215  polysaccharide pyruvyl transferase  21.48 
 
 		 366 aa  58.9  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2379  polysaccharide pyruvyl transferase  22.1 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000108064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3117  polysaccharide pyruvyl transferase  19.79 
 
 		 370 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.030522  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0419  hypothetical protein  23.91 
 
 		 413 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0840  CsaB protein  20.43 
 
 		 367 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4482  hypothetical protein  23.19 
 
 		 432 aa  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1063  CsaB protein  20.43 
 
 		 367 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3975  polysaccharide pyruvyl transferase  21.46 
 
 		 1225 aa  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.584875 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0713  polysaccharide pyruvyl transferase  20.38 
 
 		 369 aa  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.67475  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0884  pyruvyl-transferase  20.43 
 
 		 367 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1408  polysaccharide pyruvyl transferase  21.08 
 
 		 341 aa  51.2  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000381534  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0973  CsaB protein  20.43 
 
 		 367 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0112574 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0788  pyruvyl-transferase  20.16 
 
 		 367 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192045  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2096  polysaccharide pyruvyl transferase  24.08 
 
 		 388 aa  50.4  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0252  polysaccharide pyruvyl transferase  20.22 
 
 		 438 aa  50.1  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000318155  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  21.07 
 
 		 745 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0829  polysaccharide pyruvyl transferase  20.87 
 
 		 411 aa  47.8  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.270983  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3929  hypothetical protein  24.72 
 
 		 431 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0786  pyruvyl-transferase  19.51 
 
 		 375 aa  47.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0972  CsaB protein  21.05 
 
 		 369 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953296  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2020  polysaccharide pyruvyl transferase  19.49 
 
 		 392 aa  47.4  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.751321 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3792  response regulator receiver domain-containing protein  35 
 
 		 359 aa  47.4  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2392  polysaccharide pyruvyl transferase  19.75 
 
 		 395 aa  46.2  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.692445  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4399  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  23.64 
 
 		 362 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0391258  hitchhiker  0.00000000000323458 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0373  hypothetical protein  20.58 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0482859  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2062  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  19.05 
 
 		 612 aa  44.7  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000046039  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0431  hypothetical protein  20.58 
 
 		 413 aa  44.7  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.645976  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0783  polysaccharide pyruvyl transferase  23.64 
 
 		 362 aa  43.9  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>