More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2422 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B2208  putative phosphomannomutase  99.16 
 
 		 477 aa  970    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11518  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2262  phosphomannomutase  68.35 
 
 		 478 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033572 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2311  putative phosphomannomutase  98.74 
 
 		 477 aa  971    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.016492 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2309  putative phosphomannomutase  99.79 
 
 		 477 aa  980    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0454655 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2422  putative phosphomannomutase  100 
 
 		 477 aa  983    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366334 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00703  phosphomannomutase  60 
 
 		 472 aa  580  1e-164  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0769  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  61.97 
 
 		 475 aa  577  1.0000000000000001e-163  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.934178  normal  0.109685 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2889  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  59.79 
 
 		 474 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1329  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  60.6 
 
 		 472 aa  547  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.117788  decreased coverage  0.000167775 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1902  Phosphomannomutase  49.14 
 
 		 473 aa  424  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0550466 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1733  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  47.11 
 
 		 469 aa  417  9.999999999999999e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000017319  normal  0.274178 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3809  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  42.74 
 
 		 517 aa  379  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4824  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  44.33 
 
 		 499 aa  368  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921542  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3790  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  43.36 
 
 		 510 aa  364  2e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3231  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  43.89 
 
 		 490 aa  357  1.9999999999999998e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0401358  normal  0.764695 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0943  phosphomannomutase, putative  42.83 
 
 		 483 aa  348  8e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0774465  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1061  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  42.83 
 
 		 484 aa  348  9e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.799252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2716  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  41.77 
 
 		 474 aa  338  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.431398  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0126  phosphomannomutase  43.42 
 
 		 481 aa  337  3.9999999999999995e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0540  putative phosphomannomutase  39.75 
 
 		 467 aa  330  3e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3242  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  41.77 
 
 		 474 aa  329  8e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2993  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  40.34 
 
 		 474 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0348  phosphoglucomutase, putative  40.39 
 
 		 477 aa  316  5e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.896466  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0537  phosphomannomutase, putative  39.04 
 
 		 445 aa  307  3e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1234  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  42.86 
 
 		 469 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.565449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4052  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  42.48 
 
 		 469 aa  300  3e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4097  hypothetical protein  41.74 
 
 		 466 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.909897  normal  0.207612 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4216  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  41.61 
 
 		 465 aa  283  4.0000000000000003e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4796  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  39.58 
 
 		 499 aa  282  8.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4238  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.02 
 
 		 1553 aa  266  4e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0224  phosphoglucosamine mutase  26.05 
 
 		 449 aa  111  3e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0360  phosphoglucosamine mutase  30.41 
 
 		 483 aa  102  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.943264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  26.15 
 
 		 450 aa  101  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0504  phosphoglucosamine mutase  26.75 
 
 		 430 aa  99.4  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.730223  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2115  phosphoglucosamine mutase  25.97 
 
 		 448 aa  98.6  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0714  phosphomannomutase  26.47 
 
 		 460 aa  97.8  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.079186  normal  0.0391719 
 
 
-
 
NC_002936  DET0528  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  25.9 
 
 		 430 aa  97.8  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0154  phosphoglucosamine mutase  25.84 
 
 		 449 aa  95.9  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1807  phosphoglucosamine mutase  26.26 
 
 		 446 aa  95.1  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.109286  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2490  phosphoglucosamine mutase  26.58 
 
 		 449 aa  94.4  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_469  phosphomannomutase  25.9 
 
 		 430 aa  94  6e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0230  phosphoglucosamine mutase  25.26 
 
 		 459 aa  93.6  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.116009  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0785  phosphoglucosamine mutase  25.93 
 
 		 453 aa  93.6  7e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2342  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  23.5 
 
 		 433 aa  93.6  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0286234  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0742  phosphoglucosamine mutase  26.38 
 
 		 446 aa  93.2  8e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0189  phosphoglucosamine mutase  25.54 
 
 		 448 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165004  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1152  phosphoglucosamine mutase  25.15 
 
 		 448 aa  92.8  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00023632  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5135  phosphoglucosamine mutase  25.54 
 
 		 448 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0852  Phosphoglucosamine mutase  25.79 
 
 		 454 aa  92  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0084  Phosphoglucosamine mutase  23.57 
 
 		 454 aa  91.3  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0158  phosphoglucosamine mutase  24.15 
 
 		 448 aa  90.9  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135407  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0667  hypothetical protein  25.68 
 
 		 419 aa  90.9  4e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0180  phosphoglucosamine mutase  25.32 
 
 		 448 aa  90.9  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0158  phosphoglucosamine mutase  25.32 
 
 		 448 aa  90.9  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0152  phosphoglucosamine mutase  25.32 
 
 		 448 aa  90.9  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0150  phosphoglucosamine mutase  25.32 
 
 		 448 aa  90.9  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.160931  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0157  phosphoglucosamine mutase  25.32 
 
 		 448 aa  90.9  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0201  phosphoglucosamine mutase  25.32 
 
 		 448 aa  90.9  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0496  Phosphoglucosamine mutase  25 
 
 		 480 aa  90.9  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0081  phosphoglucosamine mutase  27.22 
 
 		 445 aa  90.5  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.494438  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2225  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  23.59 
 
 		 458 aa  90.5  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.161781  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1973  phosphoglucosamine mutase  27.6 
 
 		 451 aa  90.5  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100286 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0150  phosphoglucosamine mutase  25.11 
 
 		 448 aa  90.1  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.250899  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0157  phosphoglucosamine mutase  25.11 
 
 		 448 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0721  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  23.89 
 
 		 452 aa  89.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0831033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0383  phosphoglucosamine mutase  25.35 
 
 		 451 aa  89.4  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1597  phosphoglucosamine mutase  25.12 
 
 		 445 aa  88.6  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1566  phosphoglucosamine mutase  26.26 
 
 		 455 aa  89  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0777  phosphoglucosamine mutase  24.84 
 
 		 449 aa  88.2  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0601478 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1197  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  25.59 
 
 		 453 aa  88.2  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0464554 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0151  phosphoglucosamine mutase  25.32 
 
 		 448 aa  87.8  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.205668  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1224  phosphoglucosamine mutase  27.22 
 
 		 459 aa  87.4  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1567  phosphoglucosamine mutase  26.48 
 
 		 445 aa  87  6e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1789  phosphoglucosamine mutase  24 
 
 		 446 aa  87.4  6e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1188  Phosphoglucosamine mutase  25.21 
 
 		 455 aa  86.7  8e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0409  phosphoglucosamine mutase  25.12 
 
 		 445 aa  86.7  8e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3490  phosphoglucosamine mutase  24.74 
 
 		 450 aa  86.7  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731606  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0187  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  24.25 
 
 		 439 aa  86.7  8e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.117639  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0586  phosphoglucosamine mutase  25.89 
 
 		 453 aa  86.7  8e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2021  phosphoglucomutase  25.11 
 
 		 434 aa  86.7  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.63108 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2131  phosphoglucosamine mutase  27.38 
 
 		 448 aa  86.3  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.361612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3610  phosphoglucosamine mutase  31.66 
 
 		 445 aa  86.3  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00189073  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2839  phosphoglucosamine mutase  25.68 
 
 		 453 aa  85.9  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0388  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  24.65 
 
 		 470 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.477012  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2324  phosphoglucosamine mutase  26.18 
 
 		 449 aa  86.7  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.4434  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0171  phosphoglucosamine mutase  27.22 
 
 		 450 aa  85.1  0.000000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0284476  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3629  phosphoglucosamine mutase  25.73 
 
 		 450 aa  85.9  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.917297  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3635  phosphoglucosamine mutase  25.31 
 
 		 451 aa  85.5  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2622  phosphoglucosamine mutase  24.84 
 
 		 451 aa  84.7  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.412287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1967  phosphoglucosamine mutase  23.96 
 
 		 446 aa  85.1  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000194402  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1135  phosphoglucosamine mutase  26.09 
 
 		 458 aa  85.1  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1100  phosphoglucosamine mutase  26.5 
 
 		 452 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.445304  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1664  phosphoglucosamine mutase  25.53 
 
 		 444 aa  84.7  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.194728 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0835  phosphoglucosamine mutase  26.11 
 
 		 445 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1847  phosphoglucosamine mutase  27.93 
 
 		 447 aa  84  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.310353  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1738  phosphoglucosamine mutase  26.84 
 
 		 450 aa  84  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.738973  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0814  phosphoglucosamine mutase  26.11 
 
 		 444 aa  84  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000566204  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0481  phosphoglucosamine mutase  26.81 
 
 		 445 aa  84  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2013  phosphoglucosamine mutase  26.49 
 
 		 443 aa  84  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.993566  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0375  phosphoglucosamine mutase  26.44 
 
 		 448 aa  83.6  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>