275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0357 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A0357  IS3 transposase OrfA  100 
 
 		 99 aa  196  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.562074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1238  IS3 OrfA  98.99 
 
 		 99 aa  195  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.431772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1117  IS3 OrfA  95.96 
 
 		 99 aa  186  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.201448  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2944  IS3, transposase orfA  94.95 
 
 		 99 aa  186  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.3441799999999996e-27 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01029  putative transposase-related protein  88.89 
 
 		 102 aa  175  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01359  putative transposase-related protein  88.89 
 
 		 102 aa  175  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01524  putative transposase-related protein  88.89 
 
 		 102 aa  175  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02695  putative transposase-related protein  88.89 
 
 		 102 aa  175  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1570  transposase IS3/IS911 family protein  88.89 
 
 		 99 aa  175  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.256983  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2507  transposase IS3/IS911 family protein  88.89 
 
 		 99 aa  175  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.419774  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2615  transposase IS3/IS911 family protein  88.89 
 
 		 99 aa  175  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0374663  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3236  transposase IS3/IS911 family protein  88.89 
 
 		 99 aa  175  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3305  transposase IS3/IS911 family protein  88.89 
 
 		 99 aa  175  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.130076  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1147  IS3, transposase orfA  88.89 
 
 		 99 aa  175  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3745  transposase IS3/IS911 family protein  88.89 
 
 		 99 aa  175  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0203126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2569  transposase IS3/IS911 family protein  88.89 
 
 		 99 aa  175  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.078573 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4846  IS3, transposase orfA  88.89 
 
 		 99 aa  175  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1772  IS3, transposase orfA  88.89 
 
 		 99 aa  175  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01036  hypothetical protein  88.89 
 
 		 102 aa  175  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0083  IS3, transposase orfA  88.89 
 
 		 99 aa  175  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.013235  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0078  IS3, transposase orfA  88.89 
 
 		 99 aa  175  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.598745  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1146  IS3, transposase orfA  88.89 
 
 		 99 aa  175  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0273368  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3024  IS3, transposase orfA  87.88 
 
 		 99 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.433294  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3717  transposase IS3/IS911 family protein  87.88 
 
 		 99 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.615031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0728  transposase IS3/IS911 family protein  87.88 
 
 		 99 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.999071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1227  transposase IS3/IS911 family protein  84.85 
 
 		 99 aa  164  5e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4201  transposase IS3/IS911 family protein  80.81 
 
 		 98 aa  152  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3156  ISEc16 transposase orfA  83.84 
 
 		 99 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.489208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1963  transposase IS3/IS911 family protein  68.89 
 
 		 94 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1466  transposase IS3/IS911 family protein  68.89 
 
 		 94 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3923  transposase IS3/IS911 family protein  68.89 
 
 		 94 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0174  transposase IS3/IS911 family protein  68.89 
 
 		 94 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20550  Transposase IS3/IS911  58.24 
 
 		 92 aa  96.7  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16540  Transposase IS3/IS911  58.24 
 
 		 92 aa  96.7  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1291  transposase IS3/IS911 family protein  53.26 
 
 		 97 aa  95.9  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0615  transposase IS3/IS911 family protein  53.26 
 
 		 97 aa  95.9  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.511326  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0766  transposase IS3/IS911 family protein  52.13 
 
 		 97 aa  94  6e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06246  hypothetical protein  61.43 
 
 		 70 aa  90.9  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1287  transposase IS3/IS911 family protein  48.48 
 
 		 97 aa  89.7  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.439238  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4159  putative transposase  84.44 
 
 		 56 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.137992 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40540  Transposase IS3/IS911  56.25 
 
 		 94 aa  81.3  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09770  Transposase IS3/IS911  56.25 
 
 		 94 aa  81.3  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41880  Transposase IS3/IS911  56.25 
 
 		 94 aa  81.3  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1458  hypothetical protein  83.33 
 
 		 49 aa  63.2  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0651  transposase IS3/IS911 family protein  36.67 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0462736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1128  transposase IS3/IS911 family protein  36.67 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1988  transposase IS3/IS911 family protein  36.67 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.275987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1992  transposase IS3/IS911 family protein  36.67 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.203185  normal  0.714899 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1583  transposase IS3/IS911 family protein  40.66 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0140  transposase IS3/IS911 family protein  40.66 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1704  transposase IS3/IS911 family protein  40.66 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2162  transposase IS3/IS911 family protein  39.56 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.102712  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1374  transposase IS3/IS911 family protein  41.76 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2643  transposase IS3/IS911 family protein  35.56 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0189783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0106  transposase IS3/IS911  38 
 
 		 99 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3811  transposase IS3/IS911  38 
 
 		 99 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000498909 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4363  transposase IS3/IS911 family protein  41.05 
 
 		 97 aa  57  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02982  transposase IS3  37.08 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4526  transposase IS3/IS911 family protein  38.95 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4682  transposase IS3/IS911 family protein  38.95 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4708  transposase IS3/IS911 family protein  38.95 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3713  transposase IS3/IS911 family protein  36.67 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0736019 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2893  transposase IS3/IS911 family protein  36.67 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0198.1  putative transposase  65 
 
 		 43 aa  54.3  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  39.56 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4708  transposase IS3/IS911 family protein  40.7 
 
 		 90 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4424  transposase IS3/IS911 family protein  40.7 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0891  transposase IS3/IS911 family protein  40.7 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2065  ISEhe3, transposase orfA  41.38 
 
 		 92 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000139393  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1990  ISEhe3, transposase orfA  37.21 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000327529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0346  ISEhe3, transposase orfA  37.21 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0509042  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2169  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263727  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4530  ISEhe3, transposase orfA  37.21 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.66022  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0684  transposase IS3/IS911 family protein  38.64 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0860261  normal  0.453264 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0280  ISEhe3, transposase orfA  37.21 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2789  ISEhe3, transposase orfA  37.21 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.013431  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1261  ISEhe3, transposase orfA  37.21 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0142  ISEhe3, transposase orfA  37.21 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000709796  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3328  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3971  ISEhe3, transposase orfA  37.21 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000376066  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  37.21 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2446  putative transposase, ISRSO8 orfA like  39.22 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00154795  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3770  putative transposase  39.22 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3022  ISEhe3, transposase orfA  37.21 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00292237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0325  ISEhe3, transposase orfA  37.21 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.196335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0436  ISEhe3, transposase orfA  37.21 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2664  transposase IS3/IS911 family protein  38.64 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916109  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0563  transposase IS3/IS911 family protein  38.64 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0378467  normal  0.24313 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5456  transposase DNA binding site ISRme11  40.7 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0552744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5496  transposase DNA binding site ISRme11  40.7 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1090  transposase IS3/IS911 family protein  35.71 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1691  transposase IS3/IS911 family protein  35.71 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1954  transposase IS3/IS911 family protein  35.71 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3660  transposase IS3/IS911 family protein  35.71 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3719  transposase IS3/IS911 family protein  35.71 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3739  transposase IS3/IS911 family protein  35.71 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5059  transposase IS3/IS911 family protein  35.71 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.478342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1469  transposase IS3/IS911 family protein  41.76 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.367264  normal  0.119554 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1726  transposase IS3/IS911  37.36 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.110151 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1785  transposase IS3/IS911 family protein  39.53 
 
 		 90 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.496155 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>