26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3425 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3425  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3844  hypothetical protein  59.51 
 
 		 260 aa  304  7e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0335  hypothetical protein  65.16 
 
 		 287 aa  300  9e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.871928  normal  0.553114 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3608  hypothetical protein  63 
 
 		 221 aa  295  5e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3805  hypothetical protein  63.23 
 
 		 272 aa  295  5e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0366  hypothetical protein  62.78 
 
 		 272 aa  291  4e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3626  hypothetical protein  63.89 
 
 		 277 aa  291  5e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4507  hypothetical protein  58.78 
 
 		 255 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000275437 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0365  hypothetical protein  52.42 
 
 		 272 aa  279  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0368  hypothetical protein  53.16 
 
 		 323 aa  279  3e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000028153 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0360  hypothetical protein  53.16 
 
 		 305 aa  278  4e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0358  hypothetical protein  55.73 
 
 		 305 aa  278  4e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4926  hypothetical protein  54 
 
 		 251 aa  271  6e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000829023 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2241  hypothetical protein  56.02 
 
 		 223 aa  257  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3861  hypothetical protein  56 
 
 		 229 aa  255  4e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.248681  unclonable  0.00000280431 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2047  hypothetical protein  52.31 
 
 		 213 aa  236  2e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0273  hypothetical protein  53.71 
 
 		 231 aa  228  7e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1657  hypothetical protein  41.15 
 
 		 211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12342  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1501  hypothetical protein  35.02 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0508793  hitchhiker  0.000844236 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2393  hypothetical protein  28 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2445  hypothetical protein  27.43 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0044  hypothetical protein  22.6 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3991  hypothetical protein  23.81 
 
 		 199 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1833  hypothetical protein  21.94 
 
 		 476 aa  47.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.424586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3844  hypothetical protein  25 
 
 		 524 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0476944 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1097  hypothetical protein  25.27 
 
 		 215 aa  43.5  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>