202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2523 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_2523  thioredoxin-like protein  100 
 
 
223 aa  460  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.741385  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1443  redoxin domain-containing protein  43.01 
 
 
184 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.972914  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1431  redoxin domain-containing protein  43.58 
 
 
184 aa  164  8e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.37409  hitchhiker  0.00436762 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1378  redoxin domain-containing protein  43.09 
 
 
184 aa  162  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.519735  hitchhiker  0.000299029 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3117  thioredoxin, putative  40.72 
 
 
184 aa  158  5e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2705  redoxin domain-containing protein  39.69 
 
 
193 aa  144  9e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00254505  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2340  redoxin domain-containing protein  51.82 
 
 
165 aa  142  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2196  thioredoxin, putative  41.18 
 
 
170 aa  123  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.104453 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0759  putative suppressor for copper-sensitivity D  32.53 
 
 
178 aa  108  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3198  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.15 
 
 
188 aa  106  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1378  thioredoxin family protein  32.08 
 
 
175 aa  106  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0494  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.18 
 
 
210 aa  105  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.779352  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02846  hypothetical protein  31.1 
 
 
170 aa  105  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0225  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.06 
 
 
179 aa  102  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.55912  normal  0.220757 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1075  suppressor for copper-sensitivity D  40.91 
 
 
168 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1191  suppressor for copper-sensitivity D  40 
 
 
168 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1180  suppressor for copper-sensitivity D  40 
 
 
168 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1226  suppressor for copper-sensitivity D  40 
 
 
168 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.608659 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3003  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.45 
 
 
177 aa  100  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0578774  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0406  putative thioredoxin protein  34 
 
 
183 aa  100  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1211  suppressor for copper-sensitivity D  39.09 
 
 
168 aa  99.4  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.746268  normal  0.80439 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0365  thioredoxin protein  35.11 
 
 
187 aa  99  5e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3452  suppressor for copper-sensitivity D, putative  32.1 
 
 
169 aa  98.2  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0116  redoxin domain-containing protein  30.29 
 
 
174 aa  97.1  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0665765  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4355  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.33 
 
 
174 aa  95.9  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4223  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.59 
 
 
174 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003039  membrane protein suppressor for copper-sensitivity ScsD  28.86 
 
 
152 aa  93.6  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4151  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.59 
 
 
174 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3068  suppressor for copper-sensitivity D, putative  28.48 
 
 
170 aa  92.8  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1759  thioredoxin, putative  30 
 
 
188 aa  90.9  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3348  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.92 
 
 
166 aa  89.7  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3548  redoxin domain-containing protein  27.67 
 
 
182 aa  87.8  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0565  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.81 
 
 
183 aa  84  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.711291  hitchhiker  0.0029887 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0501  putative thioredoxin  28.66 
 
 
164 aa  82  0.000000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0176  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.67 
 
 
219 aa  82  0.000000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.102737  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0403  suppressor for copper-sensitivity D, putative  30.08 
 
 
162 aa  74.3  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1885  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.93 
 
 
447 aa  60.5  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.404766  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1410  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  27.5 
 
 
172 aa  59.7  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.459055  normal  0.574637 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  26.09 
 
 
403 aa  57.8  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2557  putative heme-binding protein  29.73 
 
 
143 aa  56.6  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.299241  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1313  Redoxin domain protein  28.12 
 
 
182 aa  57  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000515497  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  25.22 
 
 
403 aa  56.6  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1146  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  28.87 
 
 
433 aa  56.2  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299964  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0469  redoxin domain-containing protein  29.92 
 
 
190 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0817  Redoxin domain protein  26.9 
 
 
182 aa  55.5  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0724066  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3484  redoxin domain-containing protein  25.42 
 
 
180 aa  55.1  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.234166  normal  0.21665 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1445  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.23 
 
 
182 aa  55.1  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0463  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  26.98 
 
 
179 aa  55.1  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.198306 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  22.98 
 
 
173 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0030  Redoxin domain protein  28.91 
 
 
179 aa  54.7  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.57 
 
 
169 aa  53.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  22.36 
 
 
173 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3951  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  26.09 
 
 
188 aa  53.9  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.57 
 
 
169 aa  52.8  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0340  hypothetical protein  25.41 
 
 
192 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  23.12 
 
 
173 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  21.15 
 
 
173 aa  52.8  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1928  thioredoxin family thiol:disulfide interchange protein  28.79 
 
 
183 aa  52.4  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.652807  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0367  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.19 
 
 
191 aa  52  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0354  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.19 
 
 
191 aa  52  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.35 
 
 
168 aa  52  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0354049 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0413  periplasmic protein thiol  29.41 
 
 
197 aa  52  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2046  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  29.46 
 
 
437 aa  50.8  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0189188  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4193  thiol:disulfide interchange protein  31.93 
 
 
208 aa  50.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3409  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  22.88 
 
 
169 aa  50.8  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.690578  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0243  redoxin domain-containing protein  29.66 
 
 
184 aa  50.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.487537  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2006  redoxin domain-containing protein  23.48 
 
 
176 aa  50.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0112011  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3088  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  24.42 
 
 
199 aa  50.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1805  thiol-disulfide interchange protein  27.55 
 
 
179 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175978  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0510  putative secreted protein  28.57 
 
 
209 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113668  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0451  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  27.55 
 
 
179 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  21.74 
 
 
171 aa  49.7  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4599  thioredoxin family protein  27.1 
 
 
158 aa  49.7  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  23.46 
 
 
173 aa  49.7  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0022  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  25.58 
 
 
175 aa  49.7  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  22.58 
 
 
168 aa  49.3  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.91 
 
 
166 aa  49.3  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.35 
 
 
171 aa  49.3  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3743  periplasmic protein thiol/disulphide oxidoreductase DsbE  28.57 
 
 
202 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  25.88 
 
 
184 aa  48.9  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3231  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.67 
 
 
160 aa  48.9  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0496837 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0521  putative lipoprotein  21.1 
 
 
185 aa  48.5  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.747119  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1533  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.31 
 
 
193 aa  48.9  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3280  thioredoxin-related protein  22.58 
 
 
171 aa  48.5  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0506  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  21.43 
 
 
175 aa  48.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0010915  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  25.18 
 
 
167 aa  47.8  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0247  Redoxin domain protein  29.66 
 
 
165 aa  48.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.549118  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1288  thiol:disulfide interchange protein CycY  24.81 
 
 
208 aa  48.1  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  20.14 
 
 
170 aa  48.1  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0364  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.91 
 
 
170 aa  47.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000189648  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0096  thioredoxin family thiol:disulfide interchange protein  29.38 
 
 
203 aa  47.8  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1341  putative lipoprotein  22.22 
 
 
185 aa  47.4  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.346269  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0098  thioredoxin family thiol:disulfide interchange protein  29.31 
 
 
203 aa  47.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  23.29 
 
 
182 aa  47.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1383  thioredoxin family protein  23.73 
 
 
168 aa  47.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.12426  normal  0.0879111 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2650  periplasmic protein thiol  26.72 
 
 
199 aa  47.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00508069  normal  0.0118832 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0405  redoxin domain-containing protein  29.29 
 
 
203 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0050  redoxin domain-containing protein  26.67 
 
 
180 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.577845  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1222  putative lipoprotein  22.22 
 
 
185 aa  47.4  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0377  periplasmic thioredoxin (cytochrome c biogenesis)  26.27 
 
 
198 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>