More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1898 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1898  ABC transporter related  100 
 
 		 236 aa  486  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1769  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  53.74 
 
 		 225 aa  240  1e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0632527  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1544  ABC transporter related  51.4 
 
 		 225 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.75811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1748  ABC transporter related  53.49 
 
 		 276 aa  231  9e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00373907  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2484  ABC transporter related  54.21 
 
 		 225 aa  228  5e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3310  putative phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  52.5 
 
 		 236 aa  226  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2346  ABC transporter-related protein  51.87 
 
 		 221 aa  223  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0523662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1793  putative phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  47.96 
 
 		 231 aa  221  8e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.360055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2802  ABC transporter related  48.66 
 
 		 225 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0232474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2744  ABC transporter related  46.85 
 
 		 233 aa  187  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.600258  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3493  ABC transporter related  42.65 
 
 		 226 aa  166  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1497  ABC transporter related  39.34 
 
 		 222 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1447  ABC transporter related  41.71 
 
 		 216 aa  159  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2784  ABC transporter related  33.33 
 
 		 242 aa  115  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.197707 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1293  ATPase  35.91 
 
 		 234 aa  115  6.9999999999999995e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.484642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3256  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  32.64 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.485781  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0829  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  29.36 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07851  putative phosphonate ABC transporter  33.33 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266674 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3919  ABC transporter related protein  31.19 
 
 		 275 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1184  ATPase  33.48 
 
 		 225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.795417  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21160  ABC transporter ATP-binding protein  32.08 
 
 		 267 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.511735  normal  0.707952 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0489  ABC transporter-related protein  31.03 
 
 		 498 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.878745  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0455  phosphonate ABC transporter ATPase  31.47 
 
 		 498 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.874499  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07291  putative phosphonate ABC transporter  29.49 
 
 		 244 aa  105  6e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.305194  hitchhiker  0.00460957 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0278  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  31.33 
 
 		 279 aa  105  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2964  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  30.17 
 
 		 296 aa  105  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.245669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3198  ABC transporter related  31.45 
 
 		 266 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.012913 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3516  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  29.55 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0775  phosphonate ABC transporter ATP-binding  29.29 
 
 		 309 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.831408  normal  0.944742 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0484  ABC transporter related  31.47 
 
 		 499 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.431216  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2555  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  30.67 
 
 		 277 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.205375  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2409  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  30.92 
 
 		 292 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0393  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  29.1 
 
 		 264 aa  103  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.385125 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0309  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  29.61 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.053951 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4177  ATPase  30.96 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1594  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  29.79 
 
 		 261 aa  102  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12501  hypothetical protein  30.71 
 
 		 261 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0259  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  28.46 
 
 		 270 aa  102  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0745614 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1805  ABC transporter ATP-binding protein  31.6 
 
 		 267 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1616  ABC transporter related  33.2 
 
 		 277 aa  102  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0839  ABC phophonates transporter, ATPase subunit PhnC  29.54 
 
 		 301 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0851593 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0104  ATPase  28.63 
 
 		 244 aa  102  7e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2247  ABC transporter  31.09 
 
 		 277 aa  101  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03977  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  29.61 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3886  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  30.9 
 
 		 262 aa  100  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5619  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  29.61 
 
 		 262 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4571  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  29.61 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0730  ABC transporter, ATP-binding protein  27.35 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4346  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  29.61 
 
 		 262 aa  100  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3921  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  29.61 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2890  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  29.75 
 
 		 274 aa  100  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0336941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5876  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  31.58 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4659  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  29.61 
 
 		 262 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03938  hypothetical protein  29.61 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3304  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  31.47 
 
 		 307 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296205  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3350  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  31.47 
 
 		 307 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3338  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  31.47 
 
 		 307 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1097  ATPase  31.35 
 
 		 254 aa  100  3e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0866  ABC transporter related  31.91 
 
 		 264 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07451  putative phosphonate ABC transporter  31.02 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2916  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  29.79 
 
 		 284 aa  99.4  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.178582  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0825  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.49 
 
 		 269 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal  0.0442115 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4524  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  29.91 
 
 		 307 aa  99.4  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2156  phosphonate ABC transporter ATP-binding  33.61 
 
 		 253 aa  99.4  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3416  thiamine transporter ATP-binding subunit  34.76 
 
 		 236 aa  99  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3544  thiamine transporter ATP-binding subunit  34.76 
 
 		 236 aa  99  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2945  thiamine transporter ATP-binding subunit  34.76 
 
 		 236 aa  98.6  7e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.525623 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2407  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  31.03 
 
 		 307 aa  98.6  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2593  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  31.03 
 
 		 307 aa  98.6  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0323  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  31.03 
 
 		 307 aa  98.6  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.558714  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1649  ABC transporter related protein  30.04 
 
 		 248 aa  98.6  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1184  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  31.03 
 
 		 307 aa  98.6  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2367  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  31.14 
 
 		 277 aa  98.6  8e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20300  ATP-binding component of ABC phosphonate transporter  28.95 
 
 		 278 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.540657  normal  0.410183 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0126  ABC type ATPase  32.27 
 
 		 352 aa  98.2  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228603 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4117  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  28.4 
 
 		 282 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.914371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14301  putative phosphonate ABC transporter  33.77 
 
 		 247 aa  98.2  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0790  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.47 
 
 		 265 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2080  ABC transporter related  31.14 
 
 		 272 aa  97.1  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4960  phosphonate ABC transporter ATPase subunit  32.63 
 
 		 269 aa  97.1  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1745  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  28.3 
 
 		 278 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.35608  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4361  ABC transporter related  29.2 
 
 		 264 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0829786  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02560  ABC transporter  32.1 
 
 		 249 aa  95.9  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.092761  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3810  thiamine transporter ATP-binding subunit  33.49 
 
 		 234 aa  96.3  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4431  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  27.98 
 
 		 284 aa  96.3  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07271  putative phosphonate ABC transporter  30.08 
 
 		 246 aa  96.3  4e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0413071  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0751  ABC transporter related  35.27 
 
 		 365 aa  95.5  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3621  thiamine transporter ATP-binding subunit  33.49 
 
 		 236 aa  95.1  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.802335  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11301  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  31.15 
 
 		 257 aa  95.1  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0500512 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3859  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  29.67 
 
 		 267 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl572  phosphonate ABC transporter ATP-binding component  30.08 
 
 		 249 aa  94.4  1e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2920  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  30.47 
 
 		 272 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0377  ABC transporter related  31.48 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.308685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0185  phosphonate ABC transporter ATP-binding  28.27 
 
 		 293 aa  94.4  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3908  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  29.67 
 
 		 267 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.480865 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4668  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  27.14 
 
 		 300 aa  94.4  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.621423  decreased coverage  0.000827837 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1000  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  29.91 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4623  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  27.78 
 
 		 269 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.263735 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2299  ABC phosphate/phosphonate transport system ATPase  31 
 
 		 259 aa  93.6  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3865  phosphonate ABC transporter ATP-binding  30.3 
 
 		 272 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>