43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0896 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0896  methyltransferase type 11  100 
 
 		 269 aa  555  1e-157  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1765  methyltransferase type 11  63.81 
 
 		 257 aa  354  6.999999999999999e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.751788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  25.79 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  25 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  22.88 
 
 		 210 aa  49.3  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1238  methyltransferase type 11  24.12 
 
 		 219 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2752  Methyltransferase type 12  28.24 
 
 		 225 aa  47  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  22.75 
 
 		 240 aa  46.2  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  25.9 
 
 		 202 aa  46.2  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  22.22 
 
 		 260 aa  46.2  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  29.31 
 
 		 199 aa  45.8  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2027  putative methyltransferase  26.67 
 
 		 330 aa  45.8  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0258345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2310  putative methyltransferase  26.67 
 
 		 331 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0805655  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2037  methyltransferase  26.67 
 
 		 331 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0212649  hitchhiker  0.0000106333 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  21.05 
 
 		 219 aa  45.8  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2035  putative methyltransferase  26.67 
 
 		 331 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2426  putative methyltransferase  26.67 
 
 		 331 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.487881  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2369  putative methyltransferase  26.67 
 
 		 330 aa  45.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0122535  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1846  methyltransferase, putative  25.83 
 
 		 330 aa  44.3  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.528406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  27.35 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25.16 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1932  putative methyltransferase  25.83 
 
 		 332 aa  43.9  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.87 
 
 		 237 aa  43.9  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01566  conserved hypothetical protein  26.7 
 
 		 279 aa  43.9  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145995  normal  0.121317 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  22.15 
 
 		 274 aa  43.5  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2082  putative methyltransferase  26.67 
 
 		 330 aa  43.1  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0434288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1570  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.19 
 
 		 233 aa  43.1  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.375212  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  25.93 
 
 		 235 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2436  methyltransferase, putative  25.83 
 
 		 330 aa  42.7  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  25.57 
 
 		 269 aa  42.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0112  Methyltransferase type 11  27.55 
 
 		 258 aa  42.7  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.387929 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0629  hypothetical protein  28.07 
 
 		 239 aa  42.7  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.41007  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1950  putative methyltransferase  25.83 
 
 		 330 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1895  putative methyltransferase  25.83 
 
 		 330 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.175832 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2083  putative methyltransferase  25.83 
 
 		 330 aa  42.7  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.018552  normal  0.426363 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  23.17 
 
 		 246 aa  42.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3984  methyltransferase type 11  26.14 
 
 		 245 aa  42.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.237178  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.93 
 
 		 236 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1251  methyltransferase, putative  20 
 
 		 229 aa  42.4  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  26.16 
 
 		 252 aa  42  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2578  methyltransferase  25.83 
 
 		 330 aa  42  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000179081  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0732  hypothetical protein  23.08 
 
 		 323 aa  42  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000183098  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  20.67 
 
 		 255 aa  42  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>