More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0860 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1626  ATP-dependent protease La  42.93 
 
 		 880 aa  639    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.641257  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3193  ATP-dependent protease La  44.58 
 
 		 819 aa  660    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1216  ATP-dependent protease La  63.03 
 
 		 791 aa  1031    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  43.11 
 
 		 797 aa  641    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  42.59 
 
 		 778 aa  638    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0961  DNA-binding, ATP-dependent protease La  61.61 
 
 		 792 aa  1005    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1958  ATP-dependent protease La  71.09 
 
 		 805 aa  1168    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0912  ATP-dependent protease La  42.89 
 
 		 796 aa  640    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0860  ATP-dependent protease La  100 
 
 		 807 aa  1624    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  44.84 
 
 		 823 aa  675    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0691  ATP-dependent protease La  43.87 
 
 		 817 aa  663    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000937415  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0650  ATP-dependent protease La  62.66 
 
 		 791 aa  1030    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.649538  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0414  peptidase S16, ATP-dependent protease La  66.38 
 
 		 803 aa  1116    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0549  ATP-dependent protease La  62.09 
 
 		 792 aa  1015    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.56565  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  44.78 
 
 		 816 aa  669    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1589  ATP-dependent protease La  71.87 
 
 		 803 aa  1179    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  44.25 
 
 		 816 aa  667    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  44.25 
 
 		 817 aa  664    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0560  ATP-dependent protease La  43.72 
 
 		 807 aa  642    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  42.05 
 
 		 815 aa  636    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  45.77 
 
 		 800 aa  661    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1033  ATP-dependent protease La  42.89 
 
 		 811 aa  641    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0951111  hitchhiker  0.0000000189689 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  42.75 
 
 		 792 aa  640    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1060  ATP-dependent protease La  68.53 
 
 		 798 aa  1103    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  42.68 
 
 		 823 aa  664    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1091  ATP-dependent protease La  63.03 
 
 		 791 aa  1031    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.529046  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3262  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.45 
 
 		 793 aa  633  1e-180  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1097  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.07 
 
 		 784 aa  632  1e-180  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000612483  hitchhiker  0.00000716976 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3066  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.41 
 
 		 787 aa  633  1e-180  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3350  Lon-A peptidase  42.86 
 
 		 812 aa  635  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2874  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.54 
 
 		 786 aa  635  1e-180  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1050  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.26 
 
 		 793 aa  632  1e-180  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.362366  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  41.98 
 
 		 810 aa  634  1e-180  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0027  ATP-dependent protease La  41.54 
 
 		 780 aa  631  1e-179  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00391  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.56 
 
 		 784 aa  625  1e-178  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3170  ATP-dependent protease La  42.56 
 
 		 784 aa  625  1e-178  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172446  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0475  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.56 
 
 		 784 aa  625  1e-178  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000237635  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00395  hypothetical protein  42.56 
 
 		 784 aa  625  1e-178  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3090  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.38 
 
 		 784 aa  625  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  0.00000000000000593102  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3418  ATP-dependent protease La  41.78 
 
 		 810 aa  627  1e-178  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136554  normal  0.0269191 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0482  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.56 
 
 		 784 aa  625  1e-178  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000167472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0516  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.56 
 
 		 784 aa  625  1e-178  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129427  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  41.58 
 
 		 797 aa  628  1e-178  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3193  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.56 
 
 		 784 aa  625  1e-178  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.000504746 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  41.41 
 
 		 812 aa  626  1e-178  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0362  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.56 
 
 		 784 aa  626  1e-178  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1842  ATP-dependent protease La  41.91 
 
 		 811 aa  624  1e-177  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.523368  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0490  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.38 
 
 		 784 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000003188  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0525  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.43 
 
 		 799 aa  623  1e-177  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000828536  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0509  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.38 
 
 		 784 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00343413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3052  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.38 
 
 		 784 aa  625  1e-177  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000101207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3496  ATP-dependent protease La  42.36 
 
 		 812 aa  625  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.473507  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0553  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.38 
 
 		 784 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00718767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3232  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.38 
 
 		 784 aa  623  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0492  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.38 
 
 		 784 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00217408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5136  ATP-dependent protease La  42.66 
 
 		 808 aa  624  1e-177  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0499  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.38 
 
 		 784 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00131573  hitchhiker  0.00467921 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3432  ATP-dependent protease La  42.18 
 
 		 819 aa  622  1e-176  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1856  ATP-dependent protease La  41.84 
 
 		 820 aa  620  1e-176  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0499044  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3307  ATP-dependent protease La  42.8 
 
 		 810 aa  620  1e-176  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0906  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.25 
 
 		 784 aa  621  1e-176  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000110606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3084  ATP-dependent protease La  41.04 
 
 		 898 aa  621  1e-176  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.981667 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0489  Lon-A peptidase  41.55 
 
 		 803 aa  619  1e-176  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2418  ATP-dependent protease La  42.08 
 
 		 806 aa  615  1e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.805498 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7407  ATP-dependent protease La  42.6 
 
 		 806 aa  616  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14505  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1429  ATP-dependent protease La  42.21 
 
 		 825 aa  618  1e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.067641  normal  0.0902926 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2373  ATP-dependent protease La  42.08 
 
 		 807 aa  617  1e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2227  ATP-dependent protease La  41.88 
 
 		 807 aa  615  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2681  ATP-dependent protease La  42.08 
 
 		 806 aa  615  1e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3134  ATP-dependent protease La  41.56 
 
 		 788 aa  616  1e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000324341  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  42.2 
 
 		 775 aa  617  1e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6585  ATP-dependent protease La  42.6 
 
 		 806 aa  616  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.339926 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01419  ATP-dependent protease  41.98 
 
 		 783 aa  619  1e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3353  ATP-dependent protease La  40.85 
 
 		 806 aa  618  1e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5273  ATP-dependent protease La  40.89 
 
 		 805 aa  613  9.999999999999999e-175  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1867  ATP-dependent protease La  42.47 
 
 		 804 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0743782  hitchhiker  0.00647578 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  41.88 
 
 		 802 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004042  ATP-dependent protease La Type I  41.6 
 
 		 783 aa  614  9.999999999999999e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000129867  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2444  Lon-A peptidase  41.12 
 
 		 809 aa  615  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.431002  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  42.19 
 
 		 768 aa  613  9.999999999999999e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2563  ATP-dependent protease La  41.39 
 
 		 807 aa  613  9.999999999999999e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.574534  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2565  ATP-dependent protease La  41.91 
 
 		 812 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.498787  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1510  ATP-dependent protease LA  41.82 
 
 		 786 aa  612  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293183  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4570  ATP-dependent protease La  41.91 
 
 		 807 aa  612  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1411  Lon-A peptidase  41.3 
 
 		 811 aa  615  9.999999999999999e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000104589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2892  ATP-dependent protease La  41.91 
 
 		 812 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.169901 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2506  ATP-dependent protease La  41.55 
 
 		 785 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000773513  normal  0.491127 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1543  endopeptidase La  42.16 
 
 		 781 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000152333  hitchhiker  0.000667603 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2915  ATP-dependent protease La  41.76 
 
 		 805 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1534  ATP-dependent protease La  42.47 
 
 		 804 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.254924 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0531  ATP-dependent protease La  42.01 
 
 		 809 aa  611  1e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0680151  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0941  ATP-dependent protease La  41.57 
 
 		 810 aa  610  1e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.131328  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1675  Lon-A peptidase  41.38 
 
 		 805 aa  611  1e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0439877 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1897  peptidase S16, ATP-dependent protease La  41.41 
 
 		 808 aa  611  1e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1158  ATP-dependent protease La  41.38 
 
 		 802 aa  609  1e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.326096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2394  ATP-dependent protease La  41.26 
 
 		 823 aa  609  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.118165 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0821  ATP-dependent protease LA  42.07 
 
 		 787 aa  611  1e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0118017  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2493  ATP-dependent protease La  42.24 
 
 		 783 aa  610  1e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000146156  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0838  ATP-dependent protease La  42.07 
 
 		 816 aa  609  1e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.486343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2182  ATP-dependent protease La  41.41 
 
 		 804 aa  611  1e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.542449 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>