More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0411 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0411  guanylate kinase  100 
 
 
204 aa  422  1e-117  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1256  guanylate kinase  54.5 
 
 
203 aa  225  4e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0545  guanylate kinase  56.5 
 
 
203 aa  224  8e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1089  guanylate kinase  52 
 
 
204 aa  214  9e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.350405  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1796  guanylate kinase  50.75 
 
 
206 aa  213  9.999999999999999e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1436  guanylate kinase  51.5 
 
 
203 aa  213  1.9999999999999998e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1311  guanylate kinase  49.25 
 
 
205 aa  203  2e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0552  guanylate kinase  54.45 
 
 
205 aa  202  2e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.713895  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1192  guanylate kinase  48.76 
 
 
207 aa  202  3e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1251  guanylate kinase  49.5 
 
 
202 aa  199  3e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0985  guanylate kinase  44.97 
 
 
207 aa  171  9e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00175631  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1145  guanylate kinase  43.92 
 
 
207 aa  169  3e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49439  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0099  guanylate kinase  45.26 
 
 
204 aa  169  3e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.261524  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0634  guanylate kinase  46.81 
 
 
210 aa  165  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0976  guanylate kinase  45.6 
 
 
211 aa  165  5.9999999999999996e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.194665  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00630  guanylate kinase  48.68 
 
 
207 aa  164  6.9999999999999995e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2444  guanylate kinase  43.09 
 
 
203 aa  164  9e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.337517 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4384  guanylate kinase  46.32 
 
 
207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0577  guanylate kinase  46.03 
 
 
204 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.213259  normal  0.177715 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  46.49 
 
 
210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3233  guanylate kinase  41.49 
 
 
215 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3187  Guanylate kinase  45.45 
 
 
210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1677  guanylate kinase  42.79 
 
 
217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1700  guanylate kinase  43.88 
 
 
200 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1212  guanylate kinase  42.63 
 
 
203 aa  162  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3948  guanylate kinase  45.26 
 
 
207 aa  160  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.498976  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1220  guanylate kinase  43.01 
 
 
218 aa  160  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.289802 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1535  guanylate kinase  42.56 
 
 
220 aa  160  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0748909  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001862  guanylate kinase  48.15 
 
 
207 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0785  guanylate kinase  42.63 
 
 
201 aa  158  5e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000101008  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1205  guanylate kinase  42.93 
 
 
220 aa  158  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197853  hitchhiker  0.00108752 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1078  guanylate kinase  45.45 
 
 
212 aa  158  6e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4388  guanylate kinase  47.19 
 
 
205 aa  157  7e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.11044 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4971  guanylate kinase  42.72 
 
 
218 aa  157  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4145  guanylate kinase  44.74 
 
 
207 aa  157  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  44.02 
 
 
202 aa  156  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5344  guanylate kinase  44.81 
 
 
206 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0394211 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70440  guanylate kinase  45.9 
 
 
203 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0048  guanylate kinase  44.32 
 
 
202 aa  155  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  45.65 
 
 
207 aa  155  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0266  guanylate kinase  44.97 
 
 
207 aa  155  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4581  guanylate kinase  44.86 
 
 
207 aa  155  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  45.41 
 
 
207 aa  155  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5549  guanylate kinase  46.45 
 
 
206 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1062  guanylate kinase  41.85 
 
 
220 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  45.41 
 
 
224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2523  guanylate kinase  39.89 
 
 
214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6112  guanylate kinase  45.36 
 
 
203 aa  154  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3433  guanylate kinase  46.56 
 
 
207 aa  154  7e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21703  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  45.41 
 
 
207 aa  154  9e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  45.41 
 
 
224 aa  153  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2138  guanylate kinase  45.16 
 
 
205 aa  154  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.585915  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3147  guanylate kinase  42.25 
 
 
206 aa  154  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0347  guanylate kinase  45.03 
 
 
215 aa  154  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  44.86 
 
 
207 aa  153  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2280  guanylate kinase  46.56 
 
 
229 aa  153  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2787  guanylate kinase  43.65 
 
 
225 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1475  guanylate kinase  41.14 
 
 
199 aa  152  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000468376  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0336  guanylate kinase  43.92 
 
 
207 aa  152  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3497  guanylate kinase  45.41 
 
 
207 aa  153  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1763  guanylate kinase  42.39 
 
 
218 aa  152  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0251  guanylate kinase  38.66 
 
 
207 aa  153  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000337673  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5296  guanylate kinase  44.26 
 
 
206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0446222  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0988  guanylate kinase  40.64 
 
 
234 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0107524 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1335  guanylate kinase  42.78 
 
 
206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0075  guanylate kinase  42.49 
 
 
214 aa  152  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2692  guanylate kinase  43.09 
 
 
225 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  44.32 
 
 
210 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  44.32 
 
 
210 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  44.32 
 
 
210 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  44.74 
 
 
207 aa  151  5e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  44.74 
 
 
207 aa  151  5e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  44.74 
 
 
207 aa  151  5e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  44.74 
 
 
207 aa  151  5e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3859  guanylate kinase  44.74 
 
 
207 aa  151  5e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2606  guanylate kinase  43.09 
 
 
226 aa  152  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100354  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  40.98 
 
 
200 aa  152  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0045  guanylate kinase  46.35 
 
 
207 aa  151  5e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  44.74 
 
 
207 aa  151  5e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  44.74 
 
 
207 aa  151  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  44.74 
 
 
207 aa  151  5e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1953  guanylate kinase  40.84 
 
 
223 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217119  normal  0.0786696 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1992  guanylate kinase  40.86 
 
 
209 aa  151  5.9999999999999996e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1987  guanylate kinase  40.86 
 
 
209 aa  151  7e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00153  guanylate kinase  43.16 
 
 
213 aa  151  7e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0407  guanylate kinase  40.22 
 
 
206 aa  151  7e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0177  guanylate kinase  43.32 
 
 
206 aa  151  7e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000695034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5204  guanylate kinase  44.26 
 
 
206 aa  151  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.952406  normal  0.288026 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1780  guanylate kinase  40.22 
 
 
206 aa  151  7e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0438453  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2318  guanylate kinase  42.13 
 
 
198 aa  151  8e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000195285  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  43.78 
 
 
210 aa  151  8e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0483  guanylate kinase  46.67 
 
 
181 aa  151  8e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4020  guanylate kinase  45.26 
 
 
207 aa  150  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3957  guanylate kinase  45.26 
 
 
207 aa  150  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0856  guanylate kinase  42.25 
 
 
216 aa  150  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4066  guanylate kinase  45.26 
 
 
207 aa  150  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4127  guanylate kinase  45.26 
 
 
207 aa  150  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.514606  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3948  guanylate kinase  45.26 
 
 
207 aa  150  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531185 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0294  guanylate kinase  41.3 
 
 
212 aa  150  8.999999999999999e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0035  guanylate kinase  41.09 
 
 
209 aa  150  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>