More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1640 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_1640  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  609  1e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.951385  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  29.88 
 
 
1585 aa  79.3  0.00000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0636  hypothetical protein  32.95 
 
 
545 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0229  Ankyrin  32.39 
 
 
715 aa  78.2  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000140183  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0911  hypothetical protein  31.87 
 
 
931 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0380613 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1442  ankyrin  31.82 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.858603  normal  0.0446187 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  30.59 
 
 
2413 aa  75.5  0.0000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08019  Pfs, NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01020)  31.97 
 
 
1156 aa  75.5  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  hitchhiker  0.00162932 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  37.19 
 
 
762 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  32.87 
 
 
382 aa  74.7  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0471  Ankyrin  31.79 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0418  Ankyrin  36.36 
 
 
544 aa  73.6  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3439  ankyrin  40.35 
 
 
337 aa  72  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41623  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_002978  WD0147  ankyrin repeat-containing protein  28.09 
 
 
954 aa  71.2  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0849  hypothetical protein  39.77 
 
 
723 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.048411 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3148  Ankyrin  30.34 
 
 
581 aa  71.2  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0365  gp200  34.38 
 
 
1421 aa  71.2  0.00000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  34.64 
 
 
870 aa  71.2  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3561  Ankyrin  30.1 
 
 
331 aa  71.2  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.466152  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0514  ankyrin repeat-containing protein  36.45 
 
 
469 aa  70.1  0.00000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.919326  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2661  ankyrin  33.58 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0806598 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  35.04 
 
 
1402 aa  70.1  0.00000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2666  ankyrin  34.51 
 
 
237 aa  69.3  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.931958  hitchhiker  0.000000569803 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3138  ankyrin  33.79 
 
 
208 aa  69.3  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0294  ankyrin repeat-containing protein  28.65 
 
 
541 aa  68.6  0.0000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.365976  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1610  hypothetical protein  25 
 
 
4520 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0382  ankyrin repeat protein  30.06 
 
 
891 aa  67.8  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2205  Ankyrin  36.97 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00267936  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1797  ankyrin repeat-containing protein  30.06 
 
 
483 aa  66.6  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  30.19 
 
 
426 aa  66.2  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  30.95 
 
 
1061 aa  66.2  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2498  ankyrin  30.36 
 
 
479 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  34.21 
 
 
490 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  35 
 
 
855 aa  65.9  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  32.54 
 
 
321 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1865  hypothetical protein  34 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000370925 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0456  ankyrin repeat domain protein  30.19 
 
 
196 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0121916 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4058  ankyrin  39.39 
 
 
323 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0228  hypothetical protein  33.63 
 
 
750 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.871268 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1581  hypothetical protein  35.96 
 
 
157 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3463  ankyrin  39.39 
 
 
345 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0173  Ankyrin  34.75 
 
 
149 aa  65.1  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.947078  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4783  ankyrin repeat domain protein  30.38 
 
 
226 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2199  ankyrin repeat-containing protein  38.4 
 
 
442 aa  64.7  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0155  Ankyrin  34.65 
 
 
149 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1856  hypothetical protein  39.22 
 
 
208 aa  64.3  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3421  Ankyrin  35.71 
 
 
197 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175263  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2388  ankyrin  33.33 
 
 
217 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.751385 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4402  ankyrin repeat-containing protein  29.56 
 
 
196 aa  64.3  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1071  ankyrin  37.5 
 
 
342 aa  64.3  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4419  ankyrin repeat-containing protein  27.78 
 
 
196 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02010  proteolysis and peptidolysis-related protein, putative  36.3 
 
 
236 aa  63.9  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1860  ankyrin  30.87 
 
 
181 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.43131 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_5133  predicted protein  33.07 
 
 
184 aa  63.9  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.648247  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2662  ankyrin  35.9 
 
 
756 aa  63.9  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0738  hypothetical protein  25.76 
 
 
1005 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  30.95 
 
 
731 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08304  conserved hypothetical protein  29.27 
 
 
1198 aa  63.5  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0000526329 
 
 
-
 
NC_002978  WD0550  ankyrin repeat-containing protein  36.56 
 
 
329 aa  63.5  0.000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3438  ankyrin  32.43 
 
 
296 aa  63.5  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0871  hypothetical protein  31.78 
 
 
646 aa  63.5  0.000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.985956 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  35.85 
 
 
2171 aa  63.5  0.000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4788  ankyrin repeat domain protein  28.93 
 
 
196 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4922  ankyrin repeat-containing protein  28.93 
 
 
196 aa  63.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.573974  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1250  ankyrin  30.95 
 
 
144 aa  63.2  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0909  hypothetical protein  28.34 
 
 
865 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.122525 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3277  ankyrin  29.6 
 
 
140 aa  62.8  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00782  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_1G14510)  27.31 
 
 
1139 aa  62.8  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4567  ankyrin repeat-containing protein  29.11 
 
 
226 aa  62.8  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.928226  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0395  Ankyrin  31.54 
 
 
640 aa  62.8  0.000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1834  ankyrin domain-containing protein  29.22 
 
 
174 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268175  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0519  hypothetical protein  23.41 
 
 
278 aa  62.4  0.000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.682563 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3408  ankyrin  33.33 
 
 
231 aa  62.4  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.90032  normal  0.939091 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.94 
 
 
428 aa  61.6  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3435  ankyrin repeat-containing protein  33.33 
 
 
141 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0285  ankyrin repeat-containing prophage LambdaW1  33.82 
 
 
200 aa  62  0.00000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1412  ankyrin  30.22 
 
 
174 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  28.63 
 
 
305 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  34.21 
 
 
157 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4250  ankyrin  29.83 
 
 
237 aa  61.6  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0944  hypothetical protein  37.5 
 
 
799 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0393  hypothetical protein  30.6 
 
 
821 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2051  ankyrin domain protein  29.11 
 
 
181 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0348951  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2048  hypothetical protein  32.48 
 
 
581 aa  61.2  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0685  Ankyrin  30.95 
 
 
140 aa  61.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0324  ankyrin repeat-containing protein  28.03 
 
 
142 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1220  Rhodanese domain protein  35.59 
 
 
260 aa  60.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000562605 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1502  ankyrin repeat protein/rhodanese-like domain protein  35.59 
 
 
260 aa  60.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3876  ankyrin  28.95 
 
 
174 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0424681  normal  0.353602 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36555  predicted protein  33.33 
 
 
192 aa  60.5  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.584228  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3392  ankyrin  29.31 
 
 
247 aa  60.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0097583 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0162  ankyrin  31.75 
 
 
141 aa  60.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1221  hypothetical protein  31.03 
 
 
472 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2345  Ankyrin  36.44 
 
 
233 aa  60.5  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2058  hypothetical protein  31.45 
 
 
580 aa  60.5  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1348  Ankyrin  34.19 
 
 
345 aa  59.7  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  27.11 
 
 
1030 aa  59.7  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  28.3 
 
 
494 aa  59.7  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4090  hypothetical protein  28.23 
 
 
427 aa  59.7  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0622  Ankyrin  29.46 
 
 
711 aa  59.7  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>