53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2767 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1776  outer membrane protein precursor MtrB  88.38 
 
 
697 aa  1289    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2767  outer membrane protein precursor MtrB  100 
 
 
695 aa  1425    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.38459  decreased coverage  0.0000000195366 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3127  outer membrane protein precursor MtrB  72.21 
 
 
698 aa  1052    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000335103 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1610  outer membrane protein precursor MtrB  99.57 
 
 
695 aa  1421    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2700  outer membrane protein precursor MtrB  67.38 
 
 
699 aa  1015    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.140373  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1523  outer membrane protein precursor MtrB  69.13 
 
 
703 aa  1053    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.415633  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1576  outer membrane protein precursor MtrB  99.71 
 
 
695 aa  1423    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0247408  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1476  outer membrane protein precursor MtrB  82.27 
 
 
704 aa  1159    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0583388  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2527  outer membrane protein precursor MtrB  70.24 
 
 
699 aa  1061    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1587  outer membrane protein precursor MtrB  99.57 
 
 
695 aa  1421    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.14869  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1206  outer membrane protein precursor MtrB  63.02 
 
 
693 aa  916    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00712734  normal  0.823248 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2678  outer membrane protein precursor MtrB  88.92 
 
 
695 aa  1277    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0120666 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2639  outer membrane protein precursor MtrB  67.77 
 
 
695 aa  1006    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.381518  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2580  outer membrane protein precursor MtrB  88.78 
 
 
695 aa  1274    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0892811  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2512  outer membrane protein precursor MtrB  88.78 
 
 
695 aa  1274    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.481344  hitchhiker  0.00380912 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0228  outer membrane protein  40.03 
 
 
669 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2693  outer membrane protein, putative  39.17 
 
 
706 aa  490  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1529  outer membrane protein, putative  38.29 
 
 
711 aa  481  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1403  outer membrane protein  38.75 
 
 
668 aa  482  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0232  outer membrane protein  39.94 
 
 
668 aa  480  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3129  outer membrane protein  39.94 
 
 
668 aa  476  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0351  outer membrane protein  39.51 
 
 
668 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.132929 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3685  outer membrane protein  37.32 
 
 
669 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2762  outer membrane protein, putative  36.48 
 
 
716 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00885909  hitchhiker  0.000163865 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1592  outer membrane protein, putative  36.2 
 
 
716 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000338536  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2520  outer membrane protein, putative  36.82 
 
 
703 aa  449  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.383126  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2575  outer membrane protein, putative  36.63 
 
 
712 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.382223  normal  0.0100753 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2507  outer membrane protein, putative  36.63 
 
 
712 aa  449  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0767045  decreased coverage  0.000584641 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2673  outer membrane protein, putative  36.11 
 
 
712 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.335311  normal  0.0727867 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2819  outer membrane protein  38.95 
 
 
674 aa  445  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.216315  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1615  outer membrane protein, putative  35.77 
 
 
716 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.208848  normal  0.197166 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1781  outer membrane protein, putative  36.26 
 
 
712 aa  442  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1581  outer membrane protein, putative  35.63 
 
 
716 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0408477  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2924  outer membrane protein  37.78 
 
 
672 aa  427  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3676  outer membrane protein  35.43 
 
 
667 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1428  outer membrane protein  34.58 
 
 
662 aa  403  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0267  outer membrane protein  35.14 
 
 
667 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1212  outer membrane protein, putative  34.1 
 
 
698 aa  395  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2229  outer membrane protein  34.9 
 
 
667 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00516967  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0626  outer membrane protein  34.29 
 
 
662 aa  394  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2150  outer membrane protein  33.48 
 
 
669 aa  371  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0260254  normal  0.662224 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1306  outer membrane protein  32.86 
 
 
672 aa  343  5e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179151 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003778  outer membrane protein  25.6 
 
 
660 aa  194  6e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4359  outer membrane protein, putative  24.96 
 
 
656 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2380  hypothetical protein  24.84 
 
 
681 aa  140  7.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.573716  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0360  hypothetical protein  25 
 
 
565 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0310928  hitchhiker  0.00101277 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1403  hypothetical protein  22.92 
 
 
772 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142579  normal  0.0825928 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3860  hypothetical protein  24.11 
 
 
573 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00093801  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3627  hypothetical protein  22.24 
 
 
835 aa  92.8  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4081  hypothetical protein  22.28 
 
 
706 aa  88.2  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0596135  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0398  hypothetical protein  22.33 
 
 
807 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.513046 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2959  putative outer membrane protein precursor  21.11 
 
 
830 aa  73.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0816  hypothetical protein  21.56 
 
 
810 aa  65.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>