53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1615 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1781  outer membrane protein, putative  79.19 
 
 
712 aa  1206    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2762  outer membrane protein, putative  96.23 
 
 
716 aa  1437    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00885909  hitchhiker  0.000163865 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1592  outer membrane protein, putative  96.93 
 
 
716 aa  1444    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000338536  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1615  outer membrane protein, putative  100 
 
 
716 aa  1481    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.208848  normal  0.197166 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2507  outer membrane protein, putative  80.59 
 
 
712 aa  1226    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0767045  decreased coverage  0.000584641 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1581  outer membrane protein, putative  96.65 
 
 
716 aa  1443    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0408477  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2673  outer membrane protein, putative  80.17 
 
 
712 aa  1216    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.335311  normal  0.0727867 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1529  outer membrane protein, putative  55.11 
 
 
711 aa  813    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2575  outer membrane protein, putative  79.61 
 
 
712 aa  1216    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.382223  normal  0.0100753 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2693  outer membrane protein, putative  54.27 
 
 
706 aa  783    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2520  outer membrane protein, putative  53.35 
 
 
703 aa  753    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.383126  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1212  outer membrane protein, putative  42.66 
 
 
698 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1523  outer membrane protein precursor MtrB  38.59 
 
 
703 aa  476  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.415633  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2700  outer membrane protein precursor MtrB  37.75 
 
 
699 aa  464  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.140373  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2527  outer membrane protein precursor MtrB  36.54 
 
 
699 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3127  outer membrane protein precursor MtrB  37.97 
 
 
698 aa  451  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000335103 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1610  outer membrane protein precursor MtrB  35.77 
 
 
695 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2767  outer membrane protein precursor MtrB  35.77 
 
 
695 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.38459  decreased coverage  0.0000000195366 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1576  outer membrane protein precursor MtrB  35.77 
 
 
695 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0247408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1587  outer membrane protein precursor MtrB  35.49 
 
 
695 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.14869  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1776  outer membrane protein precursor MtrB  36.06 
 
 
697 aa  438  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2678  outer membrane protein precursor MtrB  36.62 
 
 
695 aa  433  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0120666 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2580  outer membrane protein precursor MtrB  36.62 
 
 
695 aa  434  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0892811  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2512  outer membrane protein precursor MtrB  36.76 
 
 
695 aa  434  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.481344  hitchhiker  0.00380912 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2639  outer membrane protein precursor MtrB  34.64 
 
 
695 aa  427  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.381518  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1206  outer membrane protein precursor MtrB  34.7 
 
 
693 aa  404  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00712734  normal  0.823248 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1476  outer membrane protein precursor MtrB  34.08 
 
 
704 aa  383  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0583388  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0351  outer membrane protein  32.2 
 
 
668 aa  343  8e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.132929 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3129  outer membrane protein  31.58 
 
 
668 aa  343  9e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1428  outer membrane protein  30.15 
 
 
662 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0626  outer membrane protein  30 
 
 
662 aa  311  2e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0267  outer membrane protein  30 
 
 
667 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2924  outer membrane protein  29.96 
 
 
672 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3676  outer membrane protein  30.2 
 
 
667 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0228  outer membrane protein  29.25 
 
 
669 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1403  outer membrane protein  28.63 
 
 
668 aa  301  4e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2229  outer membrane protein  29.86 
 
 
667 aa  298  3e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00516967  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0232  outer membrane protein  29.03 
 
 
668 aa  295  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3685  outer membrane protein  28.93 
 
 
669 aa  288  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2819  outer membrane protein  28.59 
 
 
674 aa  267  5.999999999999999e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.216315  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1306  outer membrane protein  27.75 
 
 
672 aa  233  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179151 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2150  outer membrane protein  26.7 
 
 
669 aa  210  7e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0260254  normal  0.662224 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003778  outer membrane protein  25.92 
 
 
660 aa  146  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4359  outer membrane protein, putative  25.18 
 
 
656 aa  146  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2380  hypothetical protein  20.77 
 
 
681 aa  109  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.573716  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0360  hypothetical protein  22.9 
 
 
565 aa  105  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0310928  hitchhiker  0.00101277 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4081  hypothetical protein  23.2 
 
 
706 aa  103  9e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0596135  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3860  hypothetical protein  22.66 
 
 
573 aa  99.8  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00093801  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0398  hypothetical protein  21.47 
 
 
807 aa  65.1  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.513046 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2959  putative outer membrane protein precursor  21.61 
 
 
830 aa  59.7  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3627  hypothetical protein  21.44 
 
 
835 aa  53.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0816  hypothetical protein  21.48 
 
 
810 aa  48.9  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1403  hypothetical protein  20.51 
 
 
772 aa  47.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142579  normal  0.0825928 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>