28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0365 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0365  hypothetical protein  100 
 
 
272 aa  568  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0368  hypothetical protein  96.69 
 
 
323 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000028153 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0360  hypothetical protein  95.22 
 
 
305 aa  540  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0358  hypothetical protein  92.28 
 
 
305 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3844  hypothetical protein  58.52 
 
 
260 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3805  hypothetical protein  58.2 
 
 
272 aa  309  2e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3626  hypothetical protein  57.03 
 
 
277 aa  306  3e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0366  hypothetical protein  56.64 
 
 
272 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0335  hypothetical protein  55.86 
 
 
287 aa  300  1e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.871928  normal  0.553114 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3608  hypothetical protein  54.72 
 
 
221 aa  296  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3425  hypothetical protein  52.42 
 
 
236 aa  279  3e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4507  hypothetical protein  54.15 
 
 
255 aa  275  7e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000275437 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4926  hypothetical protein  52.14 
 
 
251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000829023 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2241  hypothetical protein  51.98 
 
 
223 aa  263  3e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2047  hypothetical protein  52.57 
 
 
213 aa  261  8e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3861  hypothetical protein  50.38 
 
 
229 aa  251  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.248681  unclonable  0.00000280431 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0273  hypothetical protein  42.96 
 
 
231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1657  hypothetical protein  32.79 
 
 
211 aa  142  5e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12342  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1501  hypothetical protein  32.1 
 
 
216 aa  125  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0508793  hitchhiker  0.000844236 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3844  hypothetical protein  28.57 
 
 
524 aa  60.1  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0476944 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2393  hypothetical protein  25.13 
 
 
241 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0044  hypothetical protein  25.14 
 
 
227 aa  54.7  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2445  hypothetical protein  24.62 
 
 
240 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1833  hypothetical protein  22.75 
 
 
476 aa  53.1  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.424586  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3991  hypothetical protein  24.61 
 
 
199 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375654  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2286  hypothetical protein  27.32 
 
 
222 aa  49.3  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.798269  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1097  hypothetical protein  22.46 
 
 
215 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0022  tetratricopeptide TPR_2  24.17 
 
 
442 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>