More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2469 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E2469  arginine transporter permease subunit ArtQ  100 
 
 
238 aa  476  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.391563  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00867  arginine transporter subunit  99.58 
 
 
238 aa  474  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.202852  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2780  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  99.58 
 
 
238 aa  474  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00967955  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0966  arginine transporter permease subunit ArtQ  99.58 
 
 
238 aa  474  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0935  arginine transporter permease subunit ArtQ  99.58 
 
 
238 aa  474  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0890  arginine transporter permease subunit ArtQ  99.58 
 
 
238 aa  474  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.125832  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2734  arginine transporter permease subunit ArtQ  99.58 
 
 
238 aa  474  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0586836  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00873  hypothetical protein  99.58 
 
 
238 aa  474  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.202246  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1022  arginine transporter permease subunit ArtQ  97.9 
 
 
238 aa  467  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.563398 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1378  arginine transporter permease subunit ArtQ  94.51 
 
 
238 aa  457  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0961  arginine transporter permease subunit ArtQ  94.12 
 
 
238 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1024  arginine transporter permease subunit ArtQ  94.12 
 
 
238 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0926  arginine transporter permease subunit ArtQ  94.12 
 
 
238 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.412131  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0993  arginine transporter permease subunit ArtQ  94.12 
 
 
238 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.908225  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1043  arginine transporter permease subunit ArtQ  94.12 
 
 
238 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.163661  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1654  arginine transporter permease subunit ArtQ  83.19 
 
 
246 aa  411  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.571683 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1966  arginine transporter permease subunit ArtQ  84.87 
 
 
238 aa  396  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.681186  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1700  arginine transporter permease subunit ArtQ  84.87 
 
 
238 aa  397  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0374298  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2627  arginine transporter permease subunit ArtQ  79.41 
 
 
238 aa  388  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.204375  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1581  arginine transporter permease subunit ArtQ  79.41 
 
 
238 aa  388  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2712  arginine transporter permease subunit ArtQ  79.41 
 
 
238 aa  388  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2378  arginine transporter permease subunit ArtQ  83.61 
 
 
238 aa  375  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.677527  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2278  arginine transporter permease subunit ArtQ  84.45 
 
 
238 aa  373  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0253  arginine transporter permease subunit ArtQ  54.7 
 
 
223 aa  248  5e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00505088  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0325  arginine ABC transporter, permease protein  58.26 
 
 
231 aa  229  2e-59  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05530  arginine transporter permease subunit ArtQ  55.61 
 
 
229 aa  221  8e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001574  arginine ABC transporter permease protein ArtQ  55.61 
 
 
229 aa  221  8e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.552599  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0699  arginine transporter permease subunit ArtQ  54.59 
 
 
229 aa  202  5e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.127181  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1593  arginine transport system permease protein  44.5 
 
 
221 aa  179  4.999999999999999e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.216044  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0592  arginine ABC transporter, permease protein  44.5 
 
 
221 aa  179  4.999999999999999e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0258675  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4271  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.5 
 
 
231 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000112521 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5892  ABC transporter permease  44.09 
 
 
231 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68080  ABC transporter permease  44.09 
 
 
231 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.382503  normal  0.0204508 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0281  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  42.64 
 
 
230 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0627068  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0299  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.64 
 
 
230 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0837568  normal  0.0626241 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4913  amino acid ABC transporter permease  42.49 
 
 
231 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0304  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.64 
 
 
230 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0016104  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1114  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.7 
 
 
229 aa  164  8e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.384644  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5359  amino acid ABC transporter, permease protein  42.92 
 
 
231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4929  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.13 
 
 
231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0205937  hitchhiker  0.0000000789331 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0297  ABC basic amino acid transporter, inner membrane subunit  39.5 
 
 
244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2073  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.43 
 
 
246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0310  amino acid ABC transporter permease  42.92 
 
 
231 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000193986  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0328  amino acid ABC transporter permease  39.08 
 
 
244 aa  162  6e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2290  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.73 
 
 
268 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142141  normal  0.98078 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2915  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.02 
 
 
229 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1827  arginine/ornithine ABC transporter, permease protein  36.41 
 
 
229 aa  152  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.883387  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3570  amino acid ABC transporter permease  35.94 
 
 
229 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.906452  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2057  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.84 
 
 
268 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28022  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0597  amino acid ABC transporter, permease protein  38.81 
 
 
240 aa  150  2e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0884053  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0953  amino acid ABC transporter, permease protein  37.33 
 
 
240 aa  149  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.578847  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2236  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.6 
 
 
240 aa  149  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4291  amino acid ABC transporter permease  35.48 
 
 
229 aa  148  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2567  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.53 
 
 
229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.386415  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3774  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.56 
 
 
229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134573  hitchhiker  0.00153221 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003971  arginine/ornithine ABC transporter permease protein AotQ  36.32 
 
 
246 aa  144  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3990  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.86 
 
 
229 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.456811 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2322  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.23 
 
 
239 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.893058  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4485  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  34.68 
 
 
229 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1430  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.68 
 
 
229 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0905208  normal  0.971438 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2809  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.35 
 
 
239 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.309944  normal  0.926456 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1524  amino acid ABC transporter permease  34.51 
 
 
229 aa  142  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1589  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.16 
 
 
267 aa  143  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3594  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  40.79 
 
 
239 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2178  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.79 
 
 
239 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.142027  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01551  ABC transporter permease protein  36.91 
 
 
246 aa  142  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0336  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.98 
 
 
234 aa  142  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2789  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.91 
 
 
229 aa  142  6e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.113989  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3607  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.12 
 
 
229 aa  141  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488418  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4625  arginine/ornithine transport protein AotQ  38.95 
 
 
229 aa  141  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1410  histidine ABC transporter, permease protein  36.32 
 
 
229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157931  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52780  arginine/ornithine transport protein AotQ  38.73 
 
 
229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1093  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.94 
 
 
229 aa  139  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436853  normal  0.0653327 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2065  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  36.74 
 
 
267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2880  arginine/ornithine transport system permease protein  40.88 
 
 
229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0976589  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5464  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.12 
 
 
229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2377  ABC His/Glu/Gln/Arg/opine transporter, inner membrane subunit  37.67 
 
 
243 aa  138  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.413222  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26230  histidine transport system permease protein  35.11 
 
 
229 aa  138  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0832582  normal  0.643473 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1429  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  37.05 
 
 
228 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0521843  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0352  histidine transport system permease HisQ  37.05 
 
 
228 aa  137  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.179299  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0885  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36 
 
 
229 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.524811 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1377  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.96 
 
 
229 aa  136  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4638  amino acid ABC transporter permease  37.22 
 
 
229 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2560  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.65 
 
 
230 aa  136  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.645171  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3725  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.22 
 
 
229 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0898326 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1539  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.61 
 
 
228 aa  135  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1791  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.71 
 
 
229 aa  135  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.369418  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0210  histidine ABC transporter, permease protein  35.43 
 
 
229 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1240  histidine ABC transporter, permease protein  35.43 
 
 
229 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.842706  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1355  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  35.43 
 
 
229 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.556  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1089  histidine ABC transporter, permease protein  35.43 
 
 
229 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.518061  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0483  histidine ABC transporter, permease protein  35.43 
 
 
229 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.158807  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2252  amino acid ABC transporter permease  37.89 
 
 
232 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1926  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.21 
 
 
228 aa  134  9e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3448  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  31.86 
 
 
228 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.869706  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2686  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  32.3 
 
 
228 aa  134  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503163  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4285  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.96 
 
 
225 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0276895  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3872  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.92 
 
 
238 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.171228  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2832  ABC polar amino acid transporter inner membrane protein  36.55 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3309  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.59 
 
 
234 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>