20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_0886 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0886  terminase small subunit  100 
 
 
164 aa  342  2e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000133411  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0904  terminase small subunit  100 
 
 
189 aa  342  2e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00828047  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0948  phage terminase, small subunit  38.41 
 
 
155 aa  84  8e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2948  terminase small subunit  32.72 
 
 
143 aa  77.4  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1425  Terminase small subunit  33.95 
 
 
146 aa  72.8  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2256  Phage terminase, small subunit  38.32 
 
 
147 aa  62.4  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2473  terminase small subunit  36.77 
 
 
149 aa  62.4  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2110  Phage terminase, small subunit  37.27 
 
 
170 aa  60.8  0.000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.242575  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1220  terminase small subunit  25.84 
 
 
183 aa  57.8  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1829  terminase small subunit  29.34 
 
 
187 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00926701 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3051  Terminase small subunit  30.38 
 
 
170 aa  52.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0406075  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0800  terminase small subunit  29.28 
 
 
192 aa  51.6  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000604 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3298  Terminase small subunit  29.75 
 
 
170 aa  51.6  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0665  Phage terminase, small subunit  38.14 
 
 
173 aa  51.2  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000564827  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0603  Phage terminase, small subunit  38.14 
 
 
173 aa  51.2  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00383652  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2715  terminase small subunit  29.07 
 
 
182 aa  50.8  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2472  Terminase small subunit  27.08 
 
 
164 aa  50.8  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.325596  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4100  terminase small subunit  27.75 
 
 
210 aa  47  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000879994 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0565  terminase small subunit  29.12 
 
 
233 aa  45.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2403  terminase small subunit  24.5 
 
 
199 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>