More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_0053 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_0054  integrase catalytic region  100 
 
 
140 aa  282  9e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0053  integrase catalytic subunit  100 
 
 
140 aa  282  9e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0354  transposase  45.77 
 
 
294 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.163187  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5220  transposase  45.77 
 
 
294 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00041055  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3446  transposase  44.37 
 
 
284 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000031866 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1365  transposase  46.72 
 
 
246 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0447e-22 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0515  transposase  46.72 
 
 
246 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1312  transposase  46.72 
 
 
246 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000889717  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2024  transposase  46.72 
 
 
246 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.08352e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2862  transposase  46.72 
 
 
246 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.318  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2994  transposase  46.72 
 
 
246 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4078  transposase  46.72 
 
 
246 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0741694  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0347  integrase core domain protein  46.72 
 
 
246 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0509  transposase  46.72 
 
 
246 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1099  transposase  46.72 
 
 
246 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.41959e-57 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1522  transposase  46.72 
 
 
246 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.60985e-43 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0124  ISPsy8, transposase OrfB  44.06 
 
 
259 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0450  ISPsy8, transposase OrfB  44.06 
 
 
259 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0516  ISPsy8, transposase OrfB  44.06 
 
 
259 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.390784  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5509  ISPsy8, transposase OrfB  44.06 
 
 
259 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.359281  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1784  transposase  44.37 
 
 
294 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0553  transposase  44.37 
 
 
294 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000171843  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0737  transposase  44.37 
 
 
294 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0120329  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5175  transposase  44.37 
 
 
294 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3205  transposase  44.37 
 
 
294 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4045  transposase  44.37 
 
 
294 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000330857  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1689  transposase  44.37 
 
 
294 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.42483  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5066  ISPsy8, transposase OrfB  44.06 
 
 
259 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1564  integrase catalytic subunit  42.45 
 
 
278 aa  107  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1214  integrase core domain protein  42.96 
 
 
294 aa  105  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000600847  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2805  integrase core domain protein  42.96 
 
 
294 aa  105  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000153033 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1194  integrase catalytic region  43.66 
 
 
293 aa  105  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0470498  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1975  integrase catalytic subunit  44.44 
 
 
268 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.259629 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4860  integrase catalytic subunit  44.44 
 
 
268 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.434054  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3912  integrase catalytic region  42.45 
 
 
248 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0553017  normal  0.660901 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2654  integrase catalytic subunit  43.75 
 
 
268 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.596052  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3317  integrase catalytic subunit  43.75 
 
 
268 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.817536  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3346  integrase catalytic region  42.45 
 
 
248 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0096806 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4456  integrase catalytic region  42.45 
 
 
248 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2727  integrase catalytic region  42.45 
 
 
248 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.74831  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2397  integrase catalytic region  42.45 
 
 
248 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.861552 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2938  integrase catalytic region  42.45 
 
 
248 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1740  integrase catalytic region  42.45 
 
 
248 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  hitchhiker  0.000236948 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1458  integrase catalytic region  42.45 
 
 
248 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31397  normal  0.395934 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2945  Integrase catalytic region  45 
 
 
277 aa  102  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0817746  normal  0.460878 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3620  transposase  43.17 
 
 
265 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0498053  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0273  integrase catalytic subunit  46.04 
 
 
278 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0592  integrase catalytic subunit  46.04 
 
 
278 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398355  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1176  integrase catalytic subunit  46.04 
 
 
278 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.155999  normal  0.139612 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4616  integrase catalytic subunit  46.04 
 
 
278 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.698457  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4680  integrase catalytic subunit  46.04 
 
 
278 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3208  Integrase catalytic region  45 
 
 
277 aa  102  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.928461 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0974  Integrase catalytic region  45 
 
 
277 aa  102  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382547  normal  0.109209 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3662  integrase core domain protein  43.17 
 
 
265 aa  101  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0307  transposase orfB, IS150-related  43.17 
 
 
269 aa  100  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0814  integrase catalytic subunit  41.73 
 
 
278 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1446  integrase catalytic subunit  41.73 
 
 
278 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2564  integrase catalytic subunit  41.73 
 
 
278 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95917  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2714  integrase catalytic subunit  41.73 
 
 
278 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6205  integrase catalytic subunit  41.73 
 
 
260 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.346125  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4363  transposase  43.17 
 
 
215 aa  100  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0267789  hitchhiker  2.99756e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1197  IS3-family transposase, OrfB  43.88 
 
 
249 aa  100  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000397952  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1128  IS3 family transposase OrfB  43.88 
 
 
267 aa  100  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0056  IS3 family transposase OrfB  43.88 
 
 
267 aa  100  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0109  IS3-family transposase, OrfB  43.88 
 
 
249 aa  100  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0514465  hitchhiker  0.00000245789 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4383  integrase core domain protein  43.17 
 
 
270 aa  100  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.364071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1280  integrase core domain protein  43.17 
 
 
270 aa  100  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.613069  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1018  integrase core domain protein  43.17 
 
 
270 aa  100  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00171596  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1436  isrso11-transposase orfb protein  40.29 
 
 
278 aa  99.4  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2265  isrso11-transposase orfb protein  41.01 
 
 
269 aa  99.4  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.654109  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2408  isrso11-transposase orfb protein  40.29 
 
 
278 aa  99.8  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915903  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3089  isrso11-transposase orfb protein  40.29 
 
 
278 aa  99.4  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5018  ISPsy9, transposase OrfB  45.32 
 
 
278 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1339  integrase catalytic region  42.25 
 
 
278 aa  99.8  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327623 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5561  integrase catalytic region  42.25 
 
 
278 aa  99.8  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.966664  normal  0.319693 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3939  integrase catalytic region  42.25 
 
 
278 aa  99.8  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.997818  normal  0.816377 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1165  integrase catalytic region  42.25 
 
 
222 aa  99.8  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000468999 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0288  integrase catalytic region  42.25 
 
 
278 aa  99.8  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.010827  normal  0.364185 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1714  transposase  40.29 
 
 
278 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02200  YadA protein  44.29 
 
 
279 aa  98.6  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04289  transposase  44.29 
 
 
279 aa  98.6  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02377  hypothetical protein  44.29 
 
 
279 aa  98.6  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02160  hypothetical protein  44.29 
 
 
279 aa  98.6  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.604012  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2533  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  40.58 
 
 
239 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2164  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  40.58 
 
 
239 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2250  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  40.58 
 
 
239 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3041  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  40.58 
 
 
239 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0026  transposase  41.73 
 
 
269 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0564  integrase catalytic region  40.29 
 
 
278 aa  97.4  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22633  normal  0.244778 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2352  integrase catalytic region  40.29 
 
 
278 aa  97.4  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  0.149217 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1493  transposase  38.89 
 
 
196 aa  97.1  7e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0018  transposase  43.48 
 
 
162 aa  96.7  8e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.163137  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1214  transposase  38.89 
 
 
284 aa  97.1  8e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.933809  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1357  transposase  38.89 
 
 
240 aa  97.1  8e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1993  transposase  38.89 
 
 
284 aa  96.7  9e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1966  transposase  38.89 
 
 
284 aa  96.7  9e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0681  transposase  38.89 
 
 
284 aa  96.7  9e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.606011  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00620  IS150 putative transposase  38.85 
 
 
283 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04284  IS150 putative transposase  38.85 
 
 
283 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1797  transposase  38.89 
 
 
284 aa  96.3  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>