More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3790 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3790  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  100 
 
 
510 aa  1021    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4824  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  61.74 
 
 
499 aa  580  1e-164  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921542  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3231  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  56.35 
 
 
490 aa  496  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0401358  normal  0.764695 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1061  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  50.84 
 
 
484 aa  427  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.799252  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0943  phosphomannomutase, putative  50.84 
 
 
483 aa  426  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0774465  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1902  Phosphomannomutase  48.54 
 
 
473 aa  426  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0550466 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1733  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  49.28 
 
 
469 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000017319  normal  0.274178 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3809  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  47.95 
 
 
517 aa  404  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0348  phosphoglucomutase, putative  45.98 
 
 
477 aa  393  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.896466  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2716  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  45.99 
 
 
474 aa  393  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.431398  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2889  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  44.35 
 
 
474 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00703  phosphomannomutase  43.21 
 
 
472 aa  382  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1329  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  44.79 
 
 
472 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.117788  decreased coverage  0.000167775 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2993  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  45.64 
 
 
474 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0769  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  43.8 
 
 
475 aa  364  2e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.934178  normal  0.109685 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2208  putative phosphomannomutase  43.24 
 
 
477 aa  363  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11518  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3242  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  44.51 
 
 
474 aa  363  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2262  phosphomannomutase  40.78 
 
 
478 aa  362  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033572 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2309  putative phosphomannomutase  43.42 
 
 
477 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0454655 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2311  putative phosphomannomutase  42.28 
 
 
477 aa  358  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.016492 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2422  putative phosphomannomutase  43.21 
 
 
477 aa  358  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00366334 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0540  putative phosphomannomutase  44.87 
 
 
467 aa  358  1.9999999999999998e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0126  phosphomannomutase  43.1 
 
 
481 aa  348  1e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0537  phosphomannomutase, putative  44.62 
 
 
445 aa  337  2.9999999999999997e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4238  mannose-6-phosphate isomerase, class I  41.52 
 
 
1553 aa  336  7e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4796  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  43.12 
 
 
499 aa  334  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1234  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  43.94 
 
 
469 aa  327  3e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.565449  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4052  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  46.53 
 
 
469 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4216  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  45.47 
 
 
465 aa  309  8e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4097  hypothetical protein  46.19 
 
 
466 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.909897  normal  0.207612 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0224  phosphoglucosamine mutase  26.87 
 
 
449 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0714  phosphomannomutase  26.43 
 
 
460 aa  109  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.079186  normal  0.0391719 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  24.59 
 
 
450 aa  102  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0243  phosphoglucosamine mutase  23.25 
 
 
450 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.439352  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2225  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  25.2 
 
 
458 aa  100  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.161781  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0504  phosphoglucosamine mutase  25.56 
 
 
430 aa  100  6e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.730223  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_469  phosphomannomutase  25.31 
 
 
430 aa  97.8  4e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1140  Phosphomannomutase  26.95 
 
 
482 aa  97.4  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.188407  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0528  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  24.18 
 
 
430 aa  95.9  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1197  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  24.9 
 
 
453 aa  95.5  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0464554 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0852  Phosphoglucosamine mutase  27.71 
 
 
454 aa  94  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198816  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1384  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  28.17 
 
 
454 aa  94  7e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2324  phosphoglucosamine mutase  26.87 
 
 
448 aa  93.6  8e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02641  phosphotransferase superclass  21.84 
 
 
450 aa  93.6  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.23702  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2638  phosphoglucosamine mutase  26.59 
 
 
448 aa  92.8  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0545  phosphoglucosamine mutase  28.77 
 
 
447 aa  93.2  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0496  Phosphoglucosamine mutase  25.2 
 
 
480 aa  92  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0230  phosphoglucosamine mutase  26.58 
 
 
459 aa  91.7  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.116009  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0785  alpha-phosphoglucomutase / phosphomannomutase  23.75 
 
 
458 aa  91.3  4e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00879985  unclonable  0.000000000000213638 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0949  phosphoglucosamine mutase  24.75 
 
 
447 aa  90.1  9e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2655  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  28.09 
 
 
484 aa  89.4  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0512  Phosphoglucosamine mutase  26.71 
 
 
460 aa  89.4  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2040  Phosphomannomutase  24.59 
 
 
467 aa  88.6  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0022355  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0158  phosphoglucosamine mutase  25.15 
 
 
448 aa  89  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135407  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0343  phosphoglucosamine mutase  30.12 
 
 
461 aa  89  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.241522  normal  0.0301144 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2115  phosphoglucosamine mutase  24.38 
 
 
448 aa  88.2  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0154  phosphoglucosamine mutase  24.39 
 
 
449 aa  87.8  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0486  Phosphoglucosamine mutase  26.29 
 
 
455 aa  87  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2740  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  26.17 
 
 
445 aa  87  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0242  phosphoglucosamine mutase  26.94 
 
 
442 aa  86.3  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02741  phosphotransferase superclass  21.12 
 
 
452 aa  86.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.531675  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0835  phosphoglucosamine mutase  25.56 
 
 
445 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2324  phosphoglucosamine mutase  25 
 
 
449 aa  85.5  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.4434  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0649  phosphoglucosamine mutase  30.15 
 
 
447 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.19519 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0352  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  25.5 
 
 
475 aa  85.5  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.345655 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1752  Phosphoglucomutase  24.9 
 
 
463 aa  85.9  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1188  Phosphoglucosamine mutase  23.77 
 
 
455 aa  85.1  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0512  phosphoglucosamine mutase  29.63 
 
 
447 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0257  phosphoglucosamine mutase  27.76 
 
 
449 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497563  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0367  alpha-phosphoglucomutase  24.62 
 
 
566 aa  84.3  0.000000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.16968  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2397  phosphoglucosamine mutase  30.09 
 
 
447 aa  84.7  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.793208  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2611  phosphoglucosamine mutase  32.04 
 
 
448 aa  84.3  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1127  Phosphoglucosamine mutase  27.42 
 
 
451 aa  84  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2456  phosphoglucosamine mutase  30.3 
 
 
496 aa  84  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.406799  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1605  Phosphoglucomutase  26.24 
 
 
472 aa  84  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2368  phosphoglucosamine mutase  30.3 
 
 
496 aa  84  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.529976  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0721  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  23.93 
 
 
452 aa  83.6  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0831033  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3862  phosphoglucosamine mutase  27.18 
 
 
451 aa  83.6  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02631  phosphotransferase superclass  22.55 
 
 
450 aa  83.6  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.411441  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1863  phosphoglucosamine mutase  29.01 
 
 
447 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1248  phosphoglucosamine mutase  25.59 
 
 
447 aa  83.2  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1767  phosphoglucosamine mutase  24.37 
 
 
475 aa  82.8  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1094  phosphomannomutase  24.59 
 
 
462 aa  82  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.205287 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0294  phosphoglucosamine mutase  27.79 
 
 
444 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000894137  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2100  hypothetical protein  25.6 
 
 
450 aa  82  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000873821  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0282  Phosphoglucosamine mutase  23.74 
 
 
416 aa  82.4  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1499  phosphoglucosamine mutase  29.94 
 
 
458 aa  81.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1084  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  29.08 
 
 
442 aa  81.3  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1152  phosphoglucosamine mutase  23.54 
 
 
448 aa  81.3  0.00000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00023632  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0187  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  23.63 
 
 
439 aa  81.3  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.117639  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1783  phosphoglucosamine mutase  26.91 
 
 
450 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.363404  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0605  phosphoglucosamine mutase  26.01 
 
 
451 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000599128  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3604  phosphoglucosamine mutase  27.05 
 
 
454 aa  80.5  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.623174  hitchhiker  0.000672034 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0409  phosphoglucosamine mutase  24.95 
 
 
451 aa  80.5  0.00000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000346871  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1418  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  27.82 
 
 
482 aa  80.5  0.00000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0833  phosphoglucomutase  24.24 
 
 
572 aa  80.1  0.00000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.296961  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1019  phosphoglucosamine mutase  23.35 
 
 
447 aa  80.1  0.00000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1737  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  24.5 
 
 
475 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148942  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0276  phosphoglucosamine mutase  25.25 
 
 
463 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.292233  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0360  phosphoglucosamine mutase  27.47 
 
 
483 aa  79.7  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.943264  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>