More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1418 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1418  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  100 
 
 
482 aa  936    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2740  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  62.84 
 
 
445 aa  568  1e-161  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0512  Phosphoglucosamine mutase  63.58 
 
 
460 aa  557  1e-157  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2460  Phosphoglucosamine mutase  61.63 
 
 
480 aa  531  1e-149  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1384  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  55.53 
 
 
454 aa  503  1e-141  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0714  phosphomannomutase  33.67 
 
 
460 aa  229  7e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.079186  normal  0.0391719 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0512  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  33.68 
 
 
447 aa  211  3e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2021  phosphoglucomutase  32.24 
 
 
434 aa  210  5e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.63108 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  30.77 
 
 
450 aa  210  6e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0433  phosphoglucosamine mutase  32.84 
 
 
452 aa  204  4e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.732829  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1582  phosphoglucosamine mutase  33.04 
 
 
437 aa  203  6e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.0060705  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2342  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  32.52 
 
 
433 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0286234  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0330  phosphoglucosamine mutase  33.04 
 
 
437 aa  199  9e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.256489  hitchhiker  0.00063167 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1197  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  31.64 
 
 
453 aa  193  7e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0464554 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0486  Phosphoglucosamine mutase  32.55 
 
 
455 aa  192  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0400  phosphoglucosamine mutase  31.6 
 
 
446 aa  189  1e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0785  alpha-phosphoglucomutase / phosphomannomutase  31.55 
 
 
458 aa  188  2e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00879985  unclonable  0.000000000000213638 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0224  phosphoglucosamine mutase  29.42 
 
 
449 aa  188  2e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2256  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  35.52 
 
 
453 aa  188  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.361439  decreased coverage  0.00522565 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0852  Phosphoglucosamine mutase  35.15 
 
 
454 aa  186  7e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198816  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0084  Phosphoglucosamine mutase  36.69 
 
 
454 aa  185  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1344  Phosphoglucosamine mutase  36.73 
 
 
446 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3046  Phosphoglucosamine mutase  35.82 
 
 
445 aa  184  5.0000000000000004e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0721  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  30.56 
 
 
452 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0831033  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0755  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  31.91 
 
 
456 aa  177  4e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0117608  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2253  Phosphoglucosamine mutase  34.03 
 
 
434 aa  176  7e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.329457  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2115  phosphoglucosamine mutase  29.96 
 
 
448 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1740  Phosphoglucosamine mutase  34.62 
 
 
454 aa  173  6.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.533946  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1084  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  35.27 
 
 
442 aa  172  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0605  phosphoglucosamine mutase  30.04 
 
 
451 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000599128  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2225  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  28.6 
 
 
458 aa  171  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.161781  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0496  Phosphoglucosamine mutase  33.12 
 
 
480 aa  168  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0083  phosphomannomutase AlgC  30.38 
 
 
465 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23210  phosphoglucosamine mutase  34.01 
 
 
448 aa  167  5e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0474709  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6098  phosphomannomutase AlgC  28.78 
 
 
868 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21229  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01560  phosphoglucosamine mutase  28.33 
 
 
449 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0219  phosphomannomutase  30.21 
 
 
465 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1132  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  34.91 
 
 
437 aa  164  4.0000000000000004e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.303022  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1863  phosphoglucosamine mutase  31.96 
 
 
447 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0359  phosphoglucosamine mutase  32.44 
 
 
452 aa  164  5.0000000000000005e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1204  phosphoglucosamine mutase  28.16 
 
 
449 aa  163  6e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0223  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  29.42 
 
 
452 aa  163  6e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00762456  normal  0.0119193 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2324  phosphoglucosamine mutase  27.88 
 
 
449 aa  162  9e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.4434  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1786  phosphoglucomutase  30.11 
 
 
471 aa  162  1e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70270  phosphomannomutase AlgC  28.37 
 
 
854 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1001  phosphoglucosamine mutase  29.71 
 
 
460 aa  162  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00128114  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2324  phosphoglucosamine mutase  29.7 
 
 
448 aa  162  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0949  phosphoglucosamine mutase  28.39 
 
 
447 aa  161  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0545  phosphoglucosamine mutase  31.17 
 
 
447 aa  161  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0512  phosphoglucosamine mutase  31.75 
 
 
447 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0399  phosphomannomutase  30.11 
 
 
471 aa  161  3e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.889065  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0294  phosphoglucosamine mutase  28.25 
 
 
444 aa  160  5e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000894137  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2638  phosphoglucosamine mutase  29.49 
 
 
448 aa  160  6e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0649  phosphoglucosamine mutase  31.62 
 
 
447 aa  159  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.19519 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1188  Phosphoglucosamine mutase  28.83 
 
 
455 aa  159  8e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0528  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  31.16 
 
 
430 aa  159  8e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5288  phosphomannomutase  30.02 
 
 
463 aa  159  9e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5160  phosphoglucosamine mutase  33.2 
 
 
445 aa  159  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.24824 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5338  phosphomannomutase  29.73 
 
 
466 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00384224 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_469  phosphomannomutase  31.29 
 
 
430 aa  158  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1817  phosphoglucosamine mutase  30.47 
 
 
449 aa  158  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4466  phosphoglucosamine mutase  33.2 
 
 
447 aa  158  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0183  phosphomannomutase  29.94 
 
 
465 aa  158  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.12891  decreased coverage  0.0000000447524 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0897  phosphoglucosamine mutase  28.79 
 
 
432 aa  157  4e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.05706  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0504  phosphoglucosamine mutase  31.09 
 
 
430 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.730223  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5197  phosphomannomutase  29.81 
 
 
466 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1307  phosphoglucosamine mutase  30.88 
 
 
450 aa  157  6e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.537701  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0924  phosphoglucosamine mutase  31.22 
 
 
439 aa  156  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2635  phosphoglucosamine mutase  29.47 
 
 
454 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02910  Phosphomannomutase/phosphoglucomutase AlgC  29.41 
 
 
488 aa  155  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3676  phosphomannomutase  28.63 
 
 
830 aa  155  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.991755  normal  0.132768 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4549  phosphoglucosamine mutase  31.79 
 
 
446 aa  155  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1599  phosphoglucosamine mutase  30.44 
 
 
454 aa  155  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5542  phosphomannomutase  28.96 
 
 
465 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4947  phosphoglucosamine mutase  31.21 
 
 
445 aa  154  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0784803  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2730  phosphoglucosamine mutase  30.57 
 
 
454 aa  154  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0887  phosphoglucosamine mutase  28.24 
 
 
450 aa  153  7e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00143709  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3629  phosphoglucosamine mutase  29.65 
 
 
450 aa  153  8e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.917297  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1886  phosphoglucosamine mutase  29.62 
 
 
451 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000764387  hitchhiker  0.00000000296737 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0481  phosphoglucosamine mutase  31.83 
 
 
445 aa  152  8.999999999999999e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0616  phosphoglucosamine mutase  34.36 
 
 
455 aa  152  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.508325 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0187  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  29.77 
 
 
439 aa  152  1e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.117639  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2994  phosphomannomutase  29.92 
 
 
468 aa  152  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2246  phosphoglucosamine mutase  29.71 
 
 
444 aa  152  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000153354  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2983  phosphomannomutase  30.95 
 
 
467 aa  152  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794325  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4379  phosphomannomutase  28.51 
 
 
863 aa  152  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.124617 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3067  phosphoglucosamine mutase  30.61 
 
 
446 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0945  phosphoglucosamine mutase  28.27 
 
 
461 aa  151  3e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1905  phosphomannomutase  30.13 
 
 
461 aa  150  4e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.293066  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4798  phosphoglucosamine mutase  30.77 
 
 
450 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624556  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1805  phosphoglucosamine mutase  29.94 
 
 
451 aa  150  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0835  phosphoglucosamine mutase  28.51 
 
 
445 aa  150  6e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0230  phosphoglucosamine mutase  30.51 
 
 
459 aa  150  6e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.116009  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2132  phosphoglucosamine mutase  31.5 
 
 
472 aa  150  7e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.901857 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2612  phosphoglucosamine mutase  32.71 
 
 
449 aa  149  8e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3914  phosphoglucosamine mutase  30.28 
 
 
450 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1163  phosphoglucosamine mutase  27.16 
 
 
449 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0818  phosphoglucosamine mutase  29.29 
 
 
485 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0847  phosphoglucosamine mutase  29.29 
 
 
485 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0158  phosphoglucosamine mutase  27.64 
 
 
448 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>