28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1988 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1988  hypothetical protein  100 
 
 		 2615 aa  4814    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2382  hypothetical protein  38.01 
 
 		 3069 aa  190  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.287651  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0350  hypothetical protein  40.22 
 
 		 2090 aa  159  6e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.279017 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2664  filamentous hemeagglutinin family outer membrane protein  32.08 
 
 		 1058 aa  65.5  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2282  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.66 
 
 		 1081 aa  63.5  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.41488 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12280  hypothetical protein  34.44 
 
 		 2716 aa  59.7  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0504  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  29.84 
 
 		 1844 aa  58.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3059  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.44 
 
 		 2387 aa  57  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.820187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2695  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.34 
 
 		 3589 aa  55.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1055  filamentous haemagglutinin-like protein  33.65 
 
 		 1451 aa  53.9  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0430168  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1603  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.57 
 
 		 607 aa  53.1  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17462  normal  0.795272 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3062  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.57 
 
 		 4016 aa  52.4  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00313386 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0943  filamentous haemagglutinin-like protein  31.13 
 
 		 2328 aa  52  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1289  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.5 
 
 		 985 aa  50.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0969666  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1053  filamentous haemagglutinin-like protein  36.97 
 
 		 1447 aa  50.1  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0559145  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1512  filamentous haemagglutinin-like protein  31.51 
 
 		 1999 aa  50.1  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0748  filamentous haemagglutinin-like protein  31.36 
 
 		 390 aa  49.3  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.704937  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3284  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.28 
 
 		 1137 aa  48.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5707  adhesive protein CupB5  30.11 
 
 		 991 aa  48.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3524  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.73 
 
 		 481 aa  48.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.838951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2394  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.92 
 
 		 4500 aa  48.5  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3430  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.16 
 
 		 5613 aa  47.8  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0177269 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5177  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.96 
 
 		 1148 aa  47.8  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445577  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1018  adhesive protein CupB5  30.77 
 
 		 1009 aa  47.8  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3705  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.06 
 
 		 1105 aa  47.4  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.249518 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58900  large exoprotein  35.25 
 
 		 1417 aa  47.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0117693 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61200  hypothetical protein  27.54 
 
 		 1994 aa  47  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5271  hemagglutination activity domain-containing protein  27.05 
 
 		 2271 aa  45.8  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>