24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0617 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0617  phage integrase  100 
 
 		 383 aa  783    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.342043  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0966  phage integrase family site specific recombinase  30.18 
 
 		 341 aa  125  9e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.832131  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  28.46 
 
 		 373 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3344  phage integrase family protein  29.27 
 
 		 360 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563509  normal  0.0469601 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  26.67 
 
 		 360 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  28.29 
 
 		 346 aa  95.5  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0886  phage-related integrase  28.83 
 
 		 349 aa  94.4  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6293  integrase family protein  30.77 
 
 		 344 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1177  integrase family protein  29.93 
 
 		 383 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  26.97 
 
 		 349 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0136  putative integrase for prophage CP-933U  26.57 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.872281  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2771  phage-related integrase  26.84 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2475  integrase family protein  24.12 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  25 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0988  integrase family protein  25.66 
 
 		 370 aa  57  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2865  phage integrase  24.92 
 
 		 370 aa  50.4  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.520837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2519  integrase family protein  27.31 
 
 		 346 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  22.46 
 
 		 381 aa  46.6  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2929  integrase family protein  24.71 
 
 		 351 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0275  phage integrase  26.64 
 
 		 359 aa  45.8  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0362718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3025  integrase family protein  25.94 
 
 		 351 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282849  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7358  integrase family protein  25 
 
 		 344 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210613  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1966  integrase family protein  25.21 
 
 		 353 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  28.77 
 
 		 276 aa  43.1  0.007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>