25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_5052 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_4542  hypothetical protein  94.66 
 
 
412 aa  769    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.930892 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5052  hypothetical protein  100 
 
 
412 aa  819    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0143  ATPase  73.79 
 
 
397 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0190  ATPase  71.53 
 
 
393 aa  590  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0115  ATPase  73.97 
 
 
391 aa  567  1e-160  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4994  hypothetical protein  72.75 
 
 
407 aa  565  1e-160  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01160  hypothetical protein  63.66 
 
 
427 aa  535  1e-151  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0159  hypothetical protein  66.1 
 
 
400 aa  508  1e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0645  hypothetical protein  37.65 
 
 
396 aa  252  9.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0718  hypothetical protein  38.11 
 
 
397 aa  248  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000890529 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0031  ATPase  37.25 
 
 
396 aa  243  3e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.42307  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0111  hypothetical protein  37.01 
 
 
395 aa  232  7.000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.0000000108585  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0571  ATPase  30.77 
 
 
461 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.195341  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4863  hypothetical protein  38.68 
 
 
204 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2291  hypothetical protein  29.95 
 
 
449 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1552  hypothetical protein  36.31 
 
 
199 aa  108  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.465651  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4293  hypothetical protein  29.26 
 
 
457 aa  99  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06140  hypothetical protein  26.51 
 
 
412 aa  95.1  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1456  hypothetical protein  25.12 
 
 
368 aa  89.7  9e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13070  hypothetical protein  27.7 
 
 
353 aa  78.2  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.20645  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20400  hypothetical protein  24.88 
 
 
393 aa  75.5  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02770  ATPase  25.96 
 
 
364 aa  74.3  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25650  hypothetical protein  26.83 
 
 
332 aa  65.1  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0503  hypothetical protein  20.63 
 
 
362 aa  54.3  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05970  hypothetical protein  24.05 
 
 
416 aa  47.8  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.215933 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>