53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3662 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3662  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
314 aa  648    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00724126 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4772  radical SAM domain-containing protein  33.93 
 
 
353 aa  147  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.792188  hitchhiker  0.0000514716 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0904  hypothetical protein  33.88 
 
 
380 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0740  Fe-S oxidoreductase-like  35.61 
 
 
379 aa  143  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  28.02 
 
 
501 aa  52.8  0.000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3237  radical SAM domain protein  38.6 
 
 
298 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00533932  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1585  radical SAM domain-containing protein  23.57 
 
 
310 aa  50.8  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  23.68 
 
 
389 aa  50.1  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  24.66 
 
 
319 aa  49.3  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4105  hypothetical protein  37.76 
 
 
310 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.922484  normal  0.477989 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  24.82 
 
 
358 aa  48.5  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0158  molybdenum cofactor synthesis-like  27.34 
 
 
331 aa  47.8  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194349  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0740  hypothetical protein  30.39 
 
 
302 aa  47.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  23.13 
 
 
332 aa  47.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1448  ribonucleoside-triphosphate reductase, anaerobic-like  36.9 
 
 
234 aa  46.6  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.236799 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  23.17 
 
 
317 aa  46.6  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  32.93 
 
 
565 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1210  Radical SAM domain protein  25.89 
 
 
529 aa  45.4  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  40.91 
 
 
398 aa  45.8  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  22.22 
 
 
347 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2032  radical SAM domain-containing protein  30.4 
 
 
411 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0573  radical SAM domain-containing protein  22.22 
 
 
363 aa  45.1  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.119885  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0794  radical SAM domain-containing protein  23.94 
 
 
446 aa  44.3  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1914  Radical SAM domain protein  35.11 
 
 
376 aa  43.9  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  30.77 
 
 
390 aa  44.3  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0925  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.87 
 
 
339 aa  44.3  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3594  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.57 
 
 
338 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3677  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.57 
 
 
338 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.101146  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1640  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.57 
 
 
338 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3577  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.57 
 
 
338 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3584  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.57 
 
 
338 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.57 
 
 
338 aa  43.9  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00708242  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3277  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.57 
 
 
338 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.589823  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2567  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.82 
 
 
333 aa  43.5  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.324363  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3627  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.57 
 
 
338 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3363  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.57 
 
 
338 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.521865  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0787  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 
537 aa  43.5  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0612604  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  30.43 
 
 
333 aa  43.1  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0821  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35 
 
 
337 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7629  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.69 
 
 
342 aa  43.1  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3299  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36 
 
 
347 aa  43.1  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.483331 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  23.37 
 
 
323 aa  42.7  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2615  Radical SAM domain protein  29.08 
 
 
471 aa  42.7  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2703  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.81 
 
 
345 aa  42.7  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  24.55 
 
 
496 aa  42.7  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2688  Radical SAM domain protein  22.41 
 
 
423 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  24.55 
 
 
410 aa  42.7  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2195  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.72 
 
 
333 aa  42.4  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.823795  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3415  Radical SAM domain protein  22.41 
 
 
423 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1314  radical SAM domain-containing protein  36.05 
 
 
470 aa  42.4  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  hitchhiker  0.000205505 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  26.69 
 
 
316 aa  42.7  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  23.05 
 
 
460 aa  42.4  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4668  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.37 
 
 
326 aa  42.4  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>