24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1580 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1580  putative plasmid replication initiator protein  100 
 
 		 521 aa  1047    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0150406 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4534  hypothetical protein  41.55 
 
 		 474 aa  296  4e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0080  hypothetical protein  40.73 
 
 		 461 aa  296  5e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0998986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8662  hypothetical protein  38.35 
 
 		 466 aa  291  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7035  hypothetical protein  36.19 
 
 		 499 aa  281  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747593 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0602  hypothetical protein  39.24 
 
 		 469 aa  261  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4126  putative replication initiation protein  38.19 
 
 		 481 aa  261  3e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4273  putative plasmid replication initiator protein  36.82 
 
 		 506 aa  258  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.730737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3399  putative replication initiation protein  39.07 
 
 		 476 aa  248  1e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00332315  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0122  replication initiation protein  37.65 
 
 		 478 aa  247  3e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2106  putative replication initiation protein  39.46 
 
 		 478 aa  242  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.612009  normal  0.44749 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23890  hypothetical protein  36.38 
 
 		 450 aa  241  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0719573  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4162  putative replication initiation protein  37.8 
 
 		 492 aa  237  4e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0471943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4088  putative replication initiation protein  35.62 
 
 		 476 aa  233  8.000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1292  hypothetical protein  33.33 
 
 		 447 aa  223  8e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1116  hypothetical protein  35.74 
 
 		 436 aa  221  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0635  hypothetical protein  37.28 
 
 		 522 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1563  replication initiation protein  34.67 
 
 		 449 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3035  putative plasmid replication initiator protein  32.64 
 
 		 474 aa  190  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3228  putative plasmid replication initiator protein  31.44 
 
 		 499 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00604715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3178  putative plasmid replication initiator protein  31.44 
 
 		 499 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.80009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3166  putative plasmid replication initiator protein  31.44 
 
 		 499 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.40822  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5992  plasmid replication initiator protein  37.5 
 
 		 197 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679906  hitchhiker  0.0000578035 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5591  plasmid replication initiator protein  37.5 
 
 		 197 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>