278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1342 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_1342  phosphinothricin N-acetyltransferase, putative  100 
 
 
171 aa  352  1e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.952982  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2571  phosphinothricin N-acetyltransferase  56.17 
 
 
169 aa  198  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209959  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00641  phosphinothricin N-acetyltransferase  55.9 
 
 
170 aa  190  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405677  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1921  Phosphinothricin acetyltransferase  43.31 
 
 
165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0245  GCN5-related N-acetyltransferase  43.75 
 
 
203 aa  139  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1269  GCN5-related N-acetyltransferase  46.04 
 
 
197 aa  134  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1356  GCN5-related N-acetyltransferase  41.72 
 
 
181 aa  133  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.181273  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0543  GCN5-related N-acetyltransferase  43.64 
 
 
197 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.176877  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1500  GCN5-related N-acetyltransferase  41.07 
 
 
184 aa  132  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2353  GCN5-related N-acetyltransferase  38.51 
 
 
196 aa  131  3.9999999999999996e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0665261  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0575  GCN5-related N-acetyltransferase  43.03 
 
 
197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201598  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0572  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
197 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3298  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
185 aa  128  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000192346  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0523  GCN5-related N-acetyltransferase  50.74 
 
 
182 aa  128  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142872  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0288  GCN5-related N-acetyltransferase  39.33 
 
 
205 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104009  normal  0.0123555 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2224  Phosphinothricin acetyltransferase  38.6 
 
 
198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.646523  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3618  GCN5-related N-acetyltransferase  44.79 
 
 
198 aa  124  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1276  phosphinothricin acetyltransferase, putative  43.31 
 
 
170 aa  124  7e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0287  GCN5-related N-acetyltransferase  41.21 
 
 
184 aa  124  8.000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1813  Phosphinothricin acetyltransferase  40.79 
 
 
198 aa  122  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.66102  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2038  Phosphinothricin acetyltransferase  37.58 
 
 
175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0528  GCN5-related N-acetyltransferase  37.65 
 
 
181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1948  sortase related acyltransferase  38.51 
 
 
186 aa  118  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.165454  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1197  GCN5-related N-acetyltransferase  40.35 
 
 
184 aa  117  7e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1924  phosphinothricin N-acetyltransferase, putative  38.12 
 
 
186 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.407385  unclonable  0.000000287357 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3938  GCN5-related N-acetyltransferase  41.4 
 
 
181 aa  117  7.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.521347 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4724  GCN5-related N-acetyltransferase  38.65 
 
 
182 aa  117  9e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0556271 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3647  GCN5-related N-acetyltransferase  38.65 
 
 
182 aa  117  9e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0488  GCN5-related N-acetyltransferase  39.87 
 
 
167 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.89212  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3077  GCN5-related N-acetyltransferase  37.89 
 
 
185 aa  116  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1904  Phosphinothricin acetyltransferase  41.36 
 
 
165 aa  116  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0493  GCN5-related N-acetyltransferase  39.87 
 
 
170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.691777 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1342  GCN5-related N-acetyltransferase  41.46 
 
 
185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327917  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0397  phosphinothricin acetyltransferase protein  37.8 
 
 
183 aa  115  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.456114  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1827  phosphinothricin N-acetyltransferase  36.81 
 
 
163 aa  115  3e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2931  Phosphinothricin acetyltransferase  37.65 
 
 
178 aa  115  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3936  GCN5-related N-acetyltransferase  40.91 
 
 
176 aa  114  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0390446  decreased coverage  0.000407903 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0196  GCN5-related N-acetyltransferase  39.31 
 
 
176 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695211  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3354  GCN5-related N-acetyltransferase  35.26 
 
 
186 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1133  GCN5-related N-acetyltransferase  38.01 
 
 
200 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0750  GCN5-related N-acetyltransferase  42.07 
 
 
176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1369  Phosphinothricin acetyltransferase  39.02 
 
 
177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5129  GCN5-related N-acetyltransferase  38.27 
 
 
175 aa  112  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601206  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1460  GCN5-related N-acetyltransferase  36.21 
 
 
178 aa  112  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1689  GCN5-related N-acetyltransferase  37.2 
 
 
178 aa  111  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1899  GCN5-related N-acetyltransferase  36.81 
 
 
167 aa  110  6e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0856381  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4058  GCN5-related N-acetyltransferase  36.57 
 
 
200 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3361  GCN5-related N-acetyltransferase  36.65 
 
 
168 aa  110  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350433  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5489  GCN5-related N-acetyltransferase  37.04 
 
 
176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385408  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1154  GCN5-related N-acetyltransferase  37.65 
 
 
186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0181286  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0201  GCN5-related N-acetyltransferase  39.35 
 
 
174 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.814424 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0463  GCN5-related N-acetyltransferase  37.72 
 
 
178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.23018 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2733  GCN5-related N-acetyltransferase  37.66 
 
 
184 aa  109  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.945518 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1467  phosphinothricin N-acetyltransferase  36.42 
 
 
188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1243  GCN5-related N-acetyltransferase  38.65 
 
 
169 aa  108  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.722913  normal  0.335188 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2530  phosphinothricin N-acetyltransferase  35.29 
 
 
247 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1352  phosphinothricin N-acetyltransferase  35.29 
 
 
247 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.207471  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1274  phosphinothricin N-acetyltransferase  35.29 
 
 
247 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0082  GCN5-related N-acetyltransferase  37.58 
 
 
192 aa  108  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0238  GCN5-related N-acetyltransferase  37.04 
 
 
183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2866  GCN5-related N-acetyltransferase  38.73 
 
 
195 aa  107  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0345136 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4023  GCN5-related N-acetyltransferase  37.27 
 
 
186 aa  107  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.210755  normal  0.806566 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1883  GCN5-related N-acetyltransferase  39.1 
 
 
197 aa  108  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.278862  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2104  GCN5-related N-acetyltransferase  35.19 
 
 
171 aa  108  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3735  GCN5-related N-acetyltransferase  35.47 
 
 
185 aa  107  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1274  Phosphinothricin acetyltransferase  38.99 
 
 
168 aa  107  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.768034  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0012  GCN5-related N-acetyltransferase  38.15 
 
 
180 aa  107  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0867027 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0284  phosphinothricin N-acetyltransferase  35.29 
 
 
247 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511587  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0554  phosphinothricin N-acetyltransferase  35.29 
 
 
247 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.450037  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4405  Phosphinothricin acetyltransferase  41.03 
 
 
190 aa  107  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1787  putative phosphinothricin N-acetyltransferase  34.08 
 
 
200 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000010061 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2704  GCN5-related N-acetyltransferase  38.22 
 
 
173 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406059  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1301  phosphinothricin N-acetyltransferase  35.29 
 
 
210 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.314376  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3699  GCN5-related N-acetyltransferase  36.42 
 
 
186 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4669  GCN5-related N-acetyltransferase  36.42 
 
 
186 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.776305  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3321  phosphinothricin N-acetyltransferase  38.65 
 
 
179 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0173112  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0996  GCN5-related N-acetyltransferase  36.02 
 
 
183 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3155  GCN5-related N-acetyltransferase  38.06 
 
 
179 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.145568  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3435  GCN5-related N-acetyltransferase  38.04 
 
 
226 aa  106  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3356  GCN5-related N-acetyltransferase  37.58 
 
 
173 aa  107  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.378643 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1014  phosphinothricin N-acetyltransferase  35.29 
 
 
188 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281887  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6404  GCN5-related N-acetyltransferase  35.88 
 
 
175 aa  106  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111575  normal  0.507549 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2198  GCN5-related N-acetyltransferase  36.02 
 
 
172 aa  106  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.408413  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5631  GCN5-related N-acetyltransferase  36.42 
 
 
186 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.320484  normal  0.522089 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2054  acetyltransferase, GNAT family  36.02 
 
 
193 aa  106  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000047072 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1629  acetyltransferase  36.02 
 
 
193 aa  106  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1103  putative phosphinothricin acetyltransferase  37.85 
 
 
190 aa  105  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0868  GCN5-related N-acetyltransferase  36.02 
 
 
169 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0919602  normal  0.666809 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1534  acetyltransferase  36.02 
 
 
193 aa  105  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3272  GCN5-related N-acetyltransferase  33.54 
 
 
210 aa  105  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2211  GCN5-related N-acetyltransferase  36.02 
 
 
172 aa  105  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09090  sortase-like acyltransferase  38.96 
 
 
185 aa  104  5e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.749785  normal  0.431101 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4433  GCN5-related N-acetyltransferase  35.8 
 
 
185 aa  104  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0583  GCN5-related N-acetyltransferase  36.26 
 
 
177 aa  104  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4184  acetyltransferase  34.86 
 
 
209 aa  104  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4059  GCN5-related N-acetyltransferase  35.8 
 
 
207 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0540643  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1770  phosphinothricin acetyltransferase  35.4 
 
 
171 aa  104  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1725  acetyltransferase  34.78 
 
 
172 aa  104  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000562438 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1751  phosphinothricin acetyltransferase  35.4 
 
 
171 aa  104  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.753499  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1705  phosphinothricin acetyltransferase  35.4 
 
 
171 aa  104  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.667334  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>