53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1206 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1776  outer membrane protein precursor MtrB  63.13 
 
 		 697 aa  923    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2767  outer membrane protein precursor MtrB  63.02 
 
 		 695 aa  933    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.38459  decreased coverage  0.0000000195366 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3127  outer membrane protein precursor MtrB  61.32 
 
 		 698 aa  888    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000335103 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1610  outer membrane protein precursor MtrB  63.17 
 
 		 695 aa  934    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2700  outer membrane protein precursor MtrB  60.23 
 
 		 699 aa  896    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.140373  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1523  outer membrane protein precursor MtrB  59.32 
 
 		 703 aa  892    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.415633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1576  outer membrane protein precursor MtrB  63.17 
 
 		 695 aa  934    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0247408  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1476  outer membrane protein precursor MtrB  58.81 
 
 		 704 aa  834    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0583388  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2527  outer membrane protein precursor MtrB  61.09 
 
 		 699 aa  912    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1587  outer membrane protein precursor MtrB  62.88 
 
 		 695 aa  931    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.14869  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1206  outer membrane protein precursor MtrB  100 
 
 		 693 aa  1426    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00712734  normal  0.823248 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2678  outer membrane protein precursor MtrB  64.46 
 
 		 695 aa  920    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0120666 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2639  outer membrane protein precursor MtrB  58.71 
 
 		 695 aa  874    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.381518  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2580  outer membrane protein precursor MtrB  64.46 
 
 		 695 aa  922    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0892811  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2512  outer membrane protein precursor MtrB  64.32 
 
 		 695 aa  921    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.481344  hitchhiker  0.00380912 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1403  outer membrane protein  40.37 
 
 		 668 aa  510  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0228  outer membrane protein  40.08 
 
 		 669 aa  502  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0232  outer membrane protein  39.83 
 
 		 668 aa  491  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3129  outer membrane protein  40.43 
 
 		 668 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3685  outer membrane protein  37.45 
 
 		 669 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1529  outer membrane protein, putative  36.38 
 
 		 711 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0351  outer membrane protein  39.18 
 
 		 668 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.132929 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2819  outer membrane protein  38.46 
 
 		 674 aa  444  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.216315  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2693  outer membrane protein, putative  35.63 
 
 		 706 aa  431  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1428  outer membrane protein  37.46 
 
 		 662 aa  429  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2520  outer membrane protein, putative  36.67 
 
 		 703 aa  427  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.383126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0267  outer membrane protein  37.45 
 
 		 667 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3676  outer membrane protein  37.16 
 
 		 667 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0626  outer membrane protein  36.74 
 
 		 662 aa  420  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2229  outer membrane protein  37.02 
 
 		 667 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00516967  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2507  outer membrane protein, putative  34.99 
 
 		 712 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0767045  decreased coverage  0.000584641 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2673  outer membrane protein, putative  34.71 
 
 		 712 aa  414  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.335311  normal  0.0727867 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1212  outer membrane protein, putative  35.54 
 
 		 698 aa  414  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2575  outer membrane protein, putative  34.85 
 
 		 712 aa  414  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.382223  normal  0.0100753 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1592  outer membrane protein, putative  34.56 
 
 		 716 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000338536  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1615  outer membrane protein, putative  34.7 
 
 		 716 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.208848  normal  0.197166 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2762  outer membrane protein, putative  34.41 
 
 		 716 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00885909  hitchhiker  0.000163865 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1581  outer membrane protein, putative  34.41 
 
 		 716 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0408477  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1781  outer membrane protein, putative  34.33 
 
 		 712 aa  404  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2924  outer membrane protein  35.81 
 
 		 672 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2150  outer membrane protein  36.29 
 
 		 669 aa  390  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0260254  normal  0.662224 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1306  outer membrane protein  33.48 
 
 		 672 aa  348  2e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179151 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4359  outer membrane protein, putative  25.92 
 
 		 656 aa  180  8e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003778  outer membrane protein  25.11 
 
 		 660 aa  172  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2380  hypothetical protein  25.26 
 
 		 681 aa  138  3.0000000000000003e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.573716  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3860  hypothetical protein  26.53 
 
 		 573 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00093801  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0360  hypothetical protein  25.48 
 
 		 565 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0310928  hitchhiker  0.00101277 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1403  hypothetical protein  23.02 
 
 		 772 aa  133  7.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142579  normal  0.0825928 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3627  hypothetical protein  22.6 
 
 		 835 aa  92.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4081  hypothetical protein  21.78 
 
 		 706 aa  89  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0596135  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0398  hypothetical protein  21.79 
 
 		 807 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.513046 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2959  putative outer membrane protein precursor  21.29 
 
 		 830 aa  73.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0816  hypothetical protein  21.07 
 
 		 810 aa  63.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>