More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0270 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0270  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  100 
 
 
255 aa  507  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3859  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.39 
 
 
263 aa  250  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0976  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.41 
 
 
271 aa  249  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3171  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.43 
 
 
254 aa  249  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3658  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.83 
 
 
259 aa  245  4e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3591  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.83 
 
 
259 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0647  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.83 
 
 
259 aa  245  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3781  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.44 
 
 
259 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.303771  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3926  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.84 
 
 
263 aa  241  7e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3189  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49 
 
 
259 aa  235  6e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1079  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.5 
 
 
260 aa  234  9e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0788  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.2 
 
 
258 aa  223  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1899  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.39 
 
 
265 aa  218  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.651881  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0805  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.95 
 
 
283 aa  186  2e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1084  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.15 
 
 
281 aa  178  7e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.19532 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4316  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.47 
 
 
276 aa  156  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2534  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.92 
 
 
271 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0499  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.57 
 
 
285 aa  149  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.686032  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1877  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.06 
 
 
261 aa  149  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000288014  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0206  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.37 
 
 
271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1620  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.88 
 
 
270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00970  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.18 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.1 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288361  normal  0.186488 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0348  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.84 
 
 
289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0625  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.77 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000503068  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2262  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.8 
 
 
276 aa  146  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1425  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.44 
 
 
260 aa  146  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2928  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.57 
 
 
256 aa  146  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004428  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.37 
 
 
273 aa  146  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2802  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.22 
 
 
270 aa  146  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1880  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.24 
 
 
271 aa  146  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0668134  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2874  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.96 
 
 
271 aa  145  8.000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.421405 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.87 
 
 
276 aa  144  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0434  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.43 
 
 
266 aa  144  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0921151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.43 
 
 
266 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0768  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.36 
 
 
263 aa  143  2e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2782  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.78 
 
 
256 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0339  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.06 
 
 
261 aa  143  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1639  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.83 
 
 
281 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2213  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.01 
 
 
296 aa  143  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.717518  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2727  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.58 
 
 
262 aa  142  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0904003  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0572  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.48 
 
 
283 aa  142  4e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2042  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.02 
 
 
260 aa  142  6e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000269177  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5049  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.98 
 
 
268 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5195  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.98 
 
 
268 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2746  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.92 
 
 
265 aa  141  9e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5142  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.26 
 
 
268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0470002  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0323  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.36 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.337894  normal  0.658901 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03707  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.47 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.09 
 
 
262 aa  140  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5374  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.36 
 
 
271 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2150  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.69 
 
 
300 aa  139  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0505  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.72 
 
 
287 aa  137  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0238281 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1923  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.98 
 
 
275 aa  137  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2087  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.98 
 
 
276 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.228254  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2651  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.6 
 
 
257 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0620  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.92 
 
 
302 aa  137  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.863429  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2948  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.52 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0260  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.51 
 
 
292 aa  136  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.632197 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2649  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.11 
 
 
296 aa  136  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.635632  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3224  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.69 
 
 
277 aa  136  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.284426 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2410  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.83 
 
 
303 aa  135  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1698  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.82 
 
 
266 aa  135  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000567119  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1528  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.12 
 
 
281 aa  135  8e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1477  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.12 
 
 
281 aa  135  8e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0180455  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6749  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.6 
 
 
282 aa  135  9e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1389  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.23 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0233  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.1 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1227  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.2 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0136152 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0488  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.98 
 
 
291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.597824  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5283  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.83 
 
 
270 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2252  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.07 
 
 
280 aa  133  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.936253  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06045  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.08 
 
 
277 aa  133  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.915315  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1583  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.43 
 
 
257 aa  133  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.889628 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.08 
 
 
269 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270014  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1509  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.33 
 
 
270 aa  133  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.903456  normal  0.162087 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3126  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.08 
 
 
269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.178661  normal  0.438843 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3040  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.33 
 
 
268 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.600526 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2214  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.74 
 
 
300 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.913014 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3843  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.72 
 
 
280 aa  132  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.944466  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2862  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.95 
 
 
268 aa  132  5e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.107443  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2944  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.95 
 
 
268 aa  132  5e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00576066  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1187  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.08 
 
 
269 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0797242  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4841  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.46 
 
 
270 aa  132  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1264  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.34 
 
 
269 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.327178  normal  0.379558 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4214  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.34 
 
 
266 aa  132  6e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0301  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.95 
 
 
263 aa  132  6.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000153612  normal  0.153918 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1101  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.8 
 
 
280 aa  132  6.999999999999999e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3239  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.75 
 
 
290 aa  132  7.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.132712  normal  0.305063 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0983  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.75 
 
 
290 aa  132  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000100522  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1035  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.75 
 
 
290 aa  132  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.849889  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3622  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.73 
 
 
290 aa  130  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1334  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.95 
 
 
268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0994  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.94 
 
 
285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.101042  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1580  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.8 
 
 
292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0232  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.8 
 
 
292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.02 
 
 
274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.462482  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12220  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.85 
 
 
281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000110554  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3021  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.97 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2674  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.03 
 
 
300 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.932329  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>