70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3023 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_3023  thiamine monophosphate synthase  100 
 
 		 208 aa  390  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2855  thiamine monophosphate synthase  46.35 
 
 		 178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0770384  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2053  thiamine monophosphate synthase  44.24 
 
 		 169 aa  74.7  0.0000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0504215  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0434  thiamine monophosphate synthase  42.78 
 
 		 178 aa  72  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.61207  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1284  thiamine monophosphate synthase  37.95 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2395  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.51 
 
 		 252 aa  61.2  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3633  thiamine monophosphate synthase  35.38 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  34.35 
 
 		 314 aa  58.5  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  34.78 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2096  Thiamine-phosphate diphosphorylase  32.83 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.255661  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0319  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  43.37 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2440  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  43.37 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363141  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1664  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  43.37 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1467  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  43.37 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0287  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  43.37 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2576  thiamine monophosphate synthase  43.37 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0878  dGTP-pyrophosphohydrolase; thiamine phosphate synthase  43.37 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  37.04 
 
 		 312 aa  53.1  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  40.22 
 
 		 329 aa  52.4  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  40.22 
 
 		 329 aa  52.4  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0984  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase protein  32.81 
 
 		 198 aa  52.4  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.462651 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE, putative  44.58 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  30.89 
 
 		 314 aa  51.6  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0210  dGTP-pyrophosphohydrolase; thiamine phosphate synthase  29.89 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0218369  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4895  thiamine monophosphate synthase  42.45 
 
 		 194 aa  51.6  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166292 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  31.4 
 
 		 310 aa  51.2  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4121  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.28 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  29.27 
 
 		 321 aa  50.1  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1618  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.06 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3677  thiamine monophosphate synthase  44.86 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.62971  normal  0.140239 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  32.24 
 
 		 320 aa  49.7  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4514  thiamine monophosphate synthase  44.86 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3850  thiamine monophosphate synthase  44.86 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2347  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.37 
 
 		 221 aa  49.3  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1375  thiamine monophosphate synthase  23.38 
 
 		 218 aa  48.5  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1348  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.18 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3747  thiamine monophosphate synthase  44.21 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.907624  normal  0.127935 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5573  thiamine monophosphate synthase  44.21 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  41.89 
 
 		 315 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2788  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.43 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0750  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.97 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  31.69 
 
 		 320 aa  46.6  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1132  thiamine monophosphate synthase  29.41 
 
 		 185 aa  46.2  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  40.54 
 
 		 315 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1996  NUDIX hydrolase  29.51 
 
 		 352 aa  46.6  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.42027  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  31.13 
 
 		 325 aa  46.2  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1927  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.76 
 
 		 236 aa  45.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2246  thiamine monophosphate synthase  39.81 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0548714 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.81 
 
 		 344 aa  45.8  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2235  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  25.67 
 
 		 479 aa  45.4  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1414  transcriptional regulator TenI  30.95 
 
 		 201 aa  45.8  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  40 
 
 		 315 aa  45.4  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1379  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.67 
 
 		 215 aa  45.4  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000146383  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2015  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.63 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.0030252  normal  0.0171267 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1918  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  23.03 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1989  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.91 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  34.78 
 
 		 302 aa  43.5  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3476  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.11 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0929  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.33 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.013677  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1507  NUDIX hydrolase  28.87 
 
 		 360 aa  43.5  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1691  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.52 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0247781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2025  mutator MutT protein  37.12 
 
 		 322 aa  43.1  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153674  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1532  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.63 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1686  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 		 360 aa  42.7  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.873349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2056  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.99 
 
 		 216 aa  42.4  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.343455 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1173  Thiamine-phosphate diphosphorylase  30 
 
 		 185 aa  42.4  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0633  thiamine monophosphate synthase  42.86 
 
 		 206 aa  42.4  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5033  thiamine monophosphate synthase  30.98 
 
 		 201 aa  42.4  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.519144 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0797  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.5 
 
 		 217 aa  42  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.961406 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2953  thiamine monophosphate synthase  28.8 
 
 		 194 aa  41.6  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>