More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1882 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1882  cell cycle protein  100 
 
 
410 aa  813    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.115024 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3948  cell cycle protein  59.38 
 
 
405 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1132  cell cycle protein  56.75 
 
 
397 aa  332  8e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.91568  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1743  cell division protein FtsW  44.68 
 
 
386 aa  292  6e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0466348  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1389  cell division protein FtsW  43.35 
 
 
385 aa  288  1e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1432  cell division protein FtsW  43.35 
 
 
385 aa  288  2e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2940  cell cycle protein  42.67 
 
 
388 aa  281  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3167  cell cycle protein  42.67 
 
 
388 aa  281  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0456428  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0951  cell cycle protein  41.22 
 
 
392 aa  278  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215554  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3123  cell cycle protein  42.4 
 
 
388 aa  277  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174848  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2855  cell division protein FtsW  40.49 
 
 
384 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487661 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2079  cell division protein FtsW  42.9 
 
 
375 aa  270  2.9999999999999997e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0540467  normal  0.263887 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2595  cell division protein FtsW  40.22 
 
 
384 aa  270  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0948  cell division protein FtsW  40.43 
 
 
386 aa  268  1e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.104281  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2892  cell division protein  40.49 
 
 
384 aa  265  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.628629  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2357  cell cycle protein  41.87 
 
 
388 aa  264  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.178188 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7444  cell cycle protein  42.47 
 
 
379 aa  261  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.727498  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1190  cell division protein FtsW  42.47 
 
 
399 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1278  cell cycle protein  41.3 
 
 
382 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.959004  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2420  cell division protein FtsW  40.81 
 
 
382 aa  253  4.0000000000000004e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.737508 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1050  cell cycle protein  40.79 
 
 
383 aa  249  5e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00180763  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2008  cell division protein FtsW  39.78 
 
 
384 aa  249  6e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0298176  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3171  cell cycle protein  37.17 
 
 
387 aa  247  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.0069748  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3486  cell cycle protein  41.29 
 
 
398 aa  246  6e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6705  cell cycle protein  42.47 
 
 
379 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2083  cell division protein FtsW  38.04 
 
 
384 aa  243  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501886  hitchhiker  0.00100012 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1993  cell cycle protein  40.92 
 
 
381 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.273485  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0691  cell cycle protein  40.96 
 
 
380 aa  240  4e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145993  normal  0.313961 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4049  cell division protein FtsW  40.11 
 
 
380 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6175  essential cell division protein (stabilizes FtsZ ring)  39.84 
 
 
383 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.189814 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3395  cell cycle protein  39.57 
 
 
381 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0062  cell cycle protein  38.1 
 
 
387 aa  236  4e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3307  cell cycle protein  39.63 
 
 
383 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3667  cell division protein FtsW  36.02 
 
 
390 aa  227  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.249047  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0681  cell division protein FtsW  38.78 
 
 
389 aa  215  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0184419 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2761  cell cycle protein  38.33 
 
 
395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.355007  normal  0.882367 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4496  cell division protein FtsW  39.35 
 
 
389 aa  193  6e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2424  putative cell division protein ftsW  38.33 
 
 
388 aa  190  4e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0439759  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0782  cell division protein FtsW  39.1 
 
 
388 aa  190  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.18598  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2106  cell division protein FtsW  39.1 
 
 
388 aa  190  5e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0692  cell division protein FtsW  39.46 
 
 
388 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1054  cell division protein FtsW  36.24 
 
 
371 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1437  stage V sporulation protein E  36.67 
 
 
367 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0394  cell division protein FtsW, putative  32.79 
 
 
371 aa  173  5e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.612635  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0842  cell cycle protein  35.47 
 
 
364 aa  169  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  33.15 
 
 
367 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1096  cell division protein FtsW  35.97 
 
 
420 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3785  cell division protein FtsW  35.62 
 
 
423 aa  159  7e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0825  cell cycle protein  33.42 
 
 
364 aa  155  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0999607  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0957  cell division protein FtsW  34.07 
 
 
394 aa  153  4e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.343907 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0166  cell division protein FtsW  30.46 
 
 
423 aa  153  5e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.582847  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0754  cell division protein FtsW  32.96 
 
 
375 aa  153  5e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.138938  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3290  cell division protein FtsW  32.78 
 
 
374 aa  153  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3771  cell division protein FtsW  35.16 
 
 
432 aa  153  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.351351  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2851  cell division protein FtsW  32.12 
 
 
424 aa  152  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2203  cell cycle protein FtsW  34.52 
 
 
369 aa  151  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0411  cell cycle protein  33.42 
 
 
375 aa  151  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2674  cell division protein FtsW  28.54 
 
 
427 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  33.69 
 
 
368 aa  151  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3064  cell division protein FtsW  33.06 
 
 
417 aa  151  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0209469  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0484  cell cycle protein  30.1 
 
 
509 aa  151  2e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  33.78 
 
 
368 aa  150  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3630  cell cycle protein  31.98 
 
 
363 aa  149  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.907488 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0180  cell division protein FtsW  29.78 
 
 
423 aa  149  9e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.598529  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  30.79 
 
 
378 aa  149  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  31.17 
 
 
374 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  31.95 
 
 
368 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2474  cell cycle protein  31.25 
 
 
376 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0921  cell division protein FtsW  34.75 
 
 
402 aa  146  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.524737  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  32.54 
 
 
368 aa  146  6e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0353  cell division protein FtsW  31.91 
 
 
402 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000708854 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  31.27 
 
 
372 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  31.56 
 
 
368 aa  145  9e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  31.56 
 
 
368 aa  145  9e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  31.56 
 
 
368 aa  145  9e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2010  stage V sporulation protein E  29.51 
 
 
368 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  31.36 
 
 
368 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  31.56 
 
 
368 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3499  cell cycle protein  30.43 
 
 
387 aa  144  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00851666  normal  0.20091 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1276  stage V sporulation protein E  33.43 
 
 
374 aa  144  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0635  cell division protein FtsW  30.38 
 
 
414 aa  144  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.146996  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  31.75 
 
 
368 aa  143  5e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0139  cell division protein FtsW  30.11 
 
 
414 aa  143  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.919378 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0136  cell division protein FtsW  30.11 
 
 
414 aa  143  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.931456 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0143  cell division protein FtsW  30.11 
 
 
414 aa  143  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.247505 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1565  cell division protein FtsW  32.54 
 
 
364 aa  143  6e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0144  cell division protein FtsW  30.11 
 
 
414 aa  143  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0378146  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0139  cell division protein FtsW  30.11 
 
 
414 aa  143  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.571731  hitchhiker  0.000000336901 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0703  cell cycle protein FtsW  29.72 
 
 
407 aa  142  7e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  31.27 
 
 
367 aa  142  8e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  31.27 
 
 
367 aa  142  8e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  31.27 
 
 
367 aa  142  8e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  31.07 
 
 
368 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  33.6 
 
 
377 aa  142  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1303  cell division protein FtsW  30.28 
 
 
365 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09080  stage V sporulation protein E  30.6 
 
 
365 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.861786  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2764  rod shape-determining protein RodA  34.06 
 
 
359 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3268  cell division protein FtsW  33.06 
 
 
511 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162204  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3257  cell division protein FtsW  33.06 
 
 
511 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19497  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3319  cell division protein FtsW  33.06 
 
 
511 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.40135  normal  0.193679 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>