More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1215 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1215  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 501 aa  1009    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0709148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2723  glucose-6-phosphate isomerase  70.06 
 
 		 500 aa  687    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.266217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1809  glucose-6-phosphate isomerase  66.16 
 
 		 507 aa  591  1e-168  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.850311  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1971  glucose-6-phosphate isomerase  46.17 
 
 		 537 aa  391  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.799071  normal  0.708924 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0932  glucose-6-phosphate isomerase  42.36 
 
 		 548 aa  380  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0922928  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1950  glucose-6-phosphate isomerase  44.11 
 
 		 533 aa  381  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.328568  normal  0.0244382 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2736  glucose-6-phosphate isomerase  42.8 
 
 		 533 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1394  glucose-6-phosphate isomerase  43 
 
 		 533 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1776  glucose-6-phosphate isomerase  43.39 
 
 		 533 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.243279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1215  glucose-6-phosphate isomerase  43.5 
 
 		 540 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1942  glucose-6-phosphate isomerase  43.5 
 
 		 540 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1449  glucose-6-phosphate isomerase  43.5 
 
 		 540 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.446361  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2132  glucose-6-phosphate isomerase  44.23 
 
 		 615 aa  364  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.163418  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3363  glucose-6-phosphate isomerase  43.5 
 
 		 540 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383524  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2466  glucose-6-phosphate isomerase  43.5 
 
 		 540 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2347  glucose-6-phosphate isomerase  43.5 
 
 		 540 aa  363  4e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11339  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2308  glucose-6-phosphate isomerase  43.29 
 
 		 540 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764178  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1682  glucose-6-phosphate isomerase  41.06 
 
 		 534 aa  353  4e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419793  normal  0.180807 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0200  glucose-6-phosphate isomerase  44.38 
 
 		 502 aa  352  7e-96  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.525891  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0285  glucose-6-phosphate isomerase  41.19 
 
 		 549 aa  351  1e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.542029  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1835  glucose-6-phosphate isomerase  42.06 
 
 		 540 aa  351  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.312318 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0299  glucose-6-phosphate isomerase  41.19 
 
 		 549 aa  351  1e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.921042  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00687  glucose-6-phosphate isomerase  44.4 
 
 		 504 aa  352  1e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1357  glucose-6-phosphate isomerase  43.23 
 
 		 540 aa  350  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0553854  normal  0.605631 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0378  glucose-6-phosphate isomerase  41.83 
 
 		 536 aa  351  2e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.419467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1905  glucose-6-phosphate isomerase  42.06 
 
 		 556 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139815  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0944  glucose-6-phosphate isomerase  45.27 
 
 		 532 aa  351  2e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1940  glucose-6-phosphate isomerase  40.41 
 
 		 540 aa  350  4e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6162  glucose-6-phosphate isomerase  40.41 
 
 		 556 aa  349  6e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1917  glucose-6-phosphate isomerase  40.41 
 
 		 556 aa  349  6e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0173524  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3385  glucose-6-phosphate isomerase  43.09 
 
 		 545 aa  349  6e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0176  glucose-6-phosphate isomerase  44.17 
 
 		 502 aa  349  7e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5218  glucose-6-phosphate isomerase  40.41 
 
 		 556 aa  348  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4813  glucose-6-phosphate isomerase  39.78 
 
 		 554 aa  348  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167391  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1521  glucose-6-phosphate isomerase  45.57 
 
 		 504 aa  347  2e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2986  Glucose-6-phosphate isomerase  41.05 
 
 		 541 aa  348  2e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2287  glucose-6-phosphate isomerase  42.23 
 
 		 540 aa  347  3e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384563  normal  0.236333 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1914  glucose-6-phosphate isomerase  41.58 
 
 		 540 aa  347  4e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572285  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1247  glucose-6-phosphate isomerase  39.42 
 
 		 546 aa  346  5e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237953  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1019  glucose-6-phosphate isomerase  39.16 
 
 		 540 aa  346  5e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0369  glucose-6-phosphate isomerase  40.8 
 
 		 549 aa  346  6e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0612  glucose-6-phosphate isomerase  38.7 
 
 		 548 aa  346  7e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000038742  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1279  glucose-6-phosphate isomerase  38.88 
 
 		 545 aa  345  1e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000145573  normal  0.0332252 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1006  glucose-6-phosphate isomerase  39.77 
 
 		 547 aa  345  1e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.777587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2494  Glucose-6-phosphate isomerase  40.27 
 
 		 551 aa  344  2.9999999999999997e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1386  glucose-6-phosphate isomerase  40.75 
 
 		 545 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214201  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1515  glucose-6-phosphate isomerase  38.85 
 
 		 562 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.447812  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2735  glucose-6-phosphate isomerase  40.66 
 
 		 547 aa  343  2.9999999999999997e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076508 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3148  glucose-6-phosphate isomerase  38.18 
 
 		 545 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000357068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2119  Glucose-6-phosphate isomerase  44.47 
 
 		 552 aa  343  5e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0430441 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2968  glucose-6-phosphate isomerase  38.49 
 
 		 545 aa  343  5.999999999999999e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000175964  normal  0.301061 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1859  Glucose-6-phosphate isomerase  41.57 
 
 		 549 aa  342  8e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77335 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0753  glucose-6-phosphate isomerase  46.33 
 
 		 525 aa  342  8e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.64368 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0070  glucose-6-phosphate isomerase  40.85 
 
 		 545 aa  341  2e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3050  glucose-6-phosphate isomerase  38.3 
 
 		 545 aa  341  2e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0740985  normal  0.178291 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0871  Glucose-6-phosphate isomerase  38.96 
 
 		 548 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.881777  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0581  glucose-6-phosphate isomerase  41.52 
 
 		 526 aa  339  8e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0608  glucose-6-phosphate isomerase  39.44 
 
 		 543 aa  338  9.999999999999999e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.028095  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0307  glucose-6-phosphate isomerase  40.57 
 
 		 549 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4018  glucose-6-phosphate isomerase  37.69 
 
 		 548 aa  337  1.9999999999999998e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.732321 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1140  glucose-6-phosphate isomerase  38.89 
 
 		 547 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.279922  normal  0.256164 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3178  glucose-6-phosphate isomerase  42.43 
 
 		 546 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1110  glucose-6-phosphate isomerase  37.96 
 
 		 545 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00275432  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2367  glucose phosphate isomerase  37.61 
 
 		 548 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000694926  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1144  glucose-6-phosphate isomerase  37.96 
 
 		 545 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0343286  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1048  glucose-6-phosphate isomerase  38.16 
 
 		 545 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000131328  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1043  glucose-6-phosphate isomerase  37.96 
 
 		 545 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3623  glucose-6-phosphate isomerase  36.72 
 
 		 547 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3246  glucose-6-phosphate isomerase  37.96 
 
 		 545 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000866912  decreased coverage  0.000837728 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5598  glucose-6-phosphate isomerase  45.44 
 
 		 520 aa  336  5.999999999999999e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.885182  normal  0.434558 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0534  glucose-6-phosphate isomerase  39.81 
 
 		 541 aa  336  7e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1073  glucose-6-phosphate isomerase  36.63 
 
 		 545 aa  335  1e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2735  glucose-6-phosphate isomerase  36.89 
 
 		 545 aa  335  1e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000381745  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1879  glucose-6-phosphate isomerase  42.02 
 
 		 541 aa  335  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0975  glucose-6-phosphate isomerase  39.15 
 
 		 549 aa  333  3e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.307999  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0137  glucose-6-phosphate isomerase  39.35 
 
 		 541 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.574148 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2901  glucose-6-phosphate isomerase  36.07 
 
 		 545 aa  333  5e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3272  glucose-6-phosphate isomerase  42.06 
 
 		 546 aa  332  6e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.701393  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1184  glucose-6-phosphate isomerase  38.72 
 
 		 545 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00253768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3594  glucose-6-phosphate isomerase  39.41 
 
 		 554 aa  332  9e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0665  glucose-6-phosphate isomerase  39.65 
 
 		 553 aa  332  1e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.796598  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0732  glucose-6-phosphate isomerase  38.29 
 
 		 554 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.309434  hitchhiker  0.0000815529 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2063  glucose-6-phosphate isomerase  39.88 
 
 		 560 aa  331  2e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0912  glucose-6-phosphate isomerase  38.22 
 
 		 545 aa  330  3e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.283196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0697  glucose-6-phosphate isomerase  43.86 
 
 		 538 aa  330  3e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000815409 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0143  glucose-6-phosphate isomerase  39.84 
 
 		 541 aa  330  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1304  glucose-6-phosphate isomerase  39.07 
 
 		 649 aa  330  5.0000000000000004e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3547  glucose-6-phosphate isomerase  37.98 
 
 		 545 aa  329  6e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3972  Glucose-6-phosphate isomerase  38.79 
 
 		 549 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1161  glucose-6-phosphate isomerase  37.98 
 
 		 552 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.149944  normal  0.283638 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4486  glucose-6-phosphate isomerase  38.67 
 
 		 549 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1339  glucose-6-phosphate isomerase  38.92 
 
 		 548 aa  327  3e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0803183  unclonable  0.00000158602 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4573  glucose-6-phosphate isomerase  38.79 
 
 		 549 aa  327  3e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4264  glucose-6-phosphate isomerase  38.79 
 
 		 549 aa  327  3e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03897  glucose-6-phosphate isomerase  38.79 
 
 		 549 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4005  glucose-6-phosphate isomerase  38.79 
 
 		 549 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.684976 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03857  hypothetical protein  38.79 
 
 		 549 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5504  glucose-6-phosphate isomerase  38.79 
 
 		 549 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4530  glucose-6-phosphate isomerase  38.79 
 
 		 549 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4700  glucose-6-phosphate isomerase  38.1 
 
 		 554 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0570543  hitchhiker  0.00570528 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>