35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0306 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0306  major facilitator transporter  100 
 
 		 409 aa  796    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.338859  normal  0.158126 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0981  hypothetical protein  50.37 
 
 		 415 aa  407  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1438  major facilitator transporter  50.26 
 
 		 415 aa  385  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1824  major facilitator transporter  47.9 
 
 		 415 aa  362  8e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3505  major facilitator transporter  46.53 
 
 		 412 aa  362  8e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2963  major facilitator superfamily MFS_1  48.03 
 
 		 421 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121972  normal  0.284618 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1433  transporter, MFS superfamily  46.08 
 
 		 420 aa  333  4e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.811642  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1261  major facilitator transporter  44.5 
 
 		 406 aa  322  9.999999999999999e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0066  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 		 406 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.574631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0067  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 406 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37883  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  28.01 
 
 		 406 aa  98.2  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0062  major facilitator transporter  26.68 
 
 		 406 aa  97.1  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.7183  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4287  major facilitator transporter  26.68 
 
 		 406 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000504378  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3964  transporter, putative  26.65 
 
 		 407 aa  96.3  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000523123  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00677  transporter, putative  25.99 
 
 		 405 aa  93.6  6e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00179637  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 425 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000056973  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0065  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 406 aa  84  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.596651  decreased coverage  0.0000000729069 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0067  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 406 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.700351  unclonable  0.0000000000855622 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0063  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 406 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0580428  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4329  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 		 420 aa  71.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0005  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 421 aa  67  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0753564  normal  0.228788 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2076  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1068  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 395 aa  56.2  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2947  major facilitator superfamily MFS_1  22.89 
 
 		 432 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1434  major facilitator transporter  23.13 
 
 		 432 aa  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0694  transporter, major facilitator family protein  29.17 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1407  major facilitator transporter  23.13 
 
 		 447 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1163  hypothetical protein  26.19 
 
 		 391 aa  44.3  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2115  major facilitator transporter  23.96 
 
 		 386 aa  43.9  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08768  conserved hypothetical protein  27.42 
 
 		 433 aa  43.5  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0863373  normal  0.186532 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0065  major facilitator family transporter  24.36 
 
 		 388 aa  43.1  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0068  transporter, putative  24.36 
 
 		 391 aa  43.1  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0563  major facilitator transporter  21.01 
 
 		 425 aa  43.1  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1398  major facilitator transporter  22.41 
 
 		 432 aa  43.1  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>