35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1835 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1835  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  647    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000176209  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0167  hypothetical protein  72.78 
 
 		 324 aa  472  1e-132  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.37064  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2296  hypothetical protein  49.84 
 
 		 312 aa  301  9e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4469  putative adenine-specific DNA methyltransferase  31.68 
 
 		 328 aa  166  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4747  hypothetical protein  31.37 
 
 		 328 aa  163  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4536  hypothetical protein  31.99 
 
 		 330 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4889  hypothetical protein  31.99 
 
 		 330 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4372  adenine-specific DNA methyltransferase  31.99 
 
 		 330 aa  162  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4756  hypothetical protein  31.99 
 
 		 328 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0488  hypothetical protein  31.37 
 
 		 328 aa  162  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.682666 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4774  hypothetical protein  31.06 
 
 		 330 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4773  hypothetical protein  31.06 
 
 		 328 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2709  N-6 DNA methylase  32.2 
 
 		 329 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4382  adenine-specific DNA methyltransferase  31.37 
 
 		 330 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1276  hypothetical protein  36.61 
 
 		 315 aa  158  9e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0854607  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0730  N-6 DNA methylase  33.68 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1803  hypothetical protein  34.75 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1768  hypothetical protein  34.75 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0559  adenine-specific DNA methylase-like protein  33.58 
 
 		 277 aa  155  7e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3311  N-6 DNA methylase  30.12 
 
 		 329 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0468  adenine-specific DNA methylase  27.64 
 
 		 329 aa  120  3e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1270  adenine-specific DNA methylase  29.6 
 
 		 333 aa  120  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.551057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4301  helicase, C-terminal  25 
 
 		 1649 aa  51.6  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.182147 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4656  N-6 DNA methylase  27.22 
 
 		 1700 aa  50.8  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9541  helicase SNF2 family  28.73 
 
 		 1701 aa  48.5  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.398827  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0160  Cpp14  24.83 
 
 		 2117 aa  47.4  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2995  N-6 DNA methylase  24.66 
 
 		 707 aa  46.2  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00439445  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4973  helicase domain-containing protein  25 
 
 		 1697 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.664795 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9162  helicase SNF2 family  24.51 
 
 		 1697 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0264  hypothetical protein  23.89 
 
 		 1748 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4316  methyltransferase type 11  25.28 
 
 		 1516 aa  43.9  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1609  hypothetical protein  23.56 
 
 		 521 aa  43.5  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.160321  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  22.38 
 
 		 523 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3321  modification methylase, HemK family  29.67 
 
 		 288 aa  43.1  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000192098  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a002  DNA methylase/helicase  23.04 
 
 		 1934 aa  42.7  0.007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0978124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>