18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4593 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4593  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  308  2e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3779  hypothetical protein  72.85 
 
 		 151 aa  233  7e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.822352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3852  hypothetical protein  72.19 
 
 		 151 aa  229  8.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3979  hypothetical protein  72.37 
 
 		 152 aa  228  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0157  hypothetical protein  49.33 
 
 		 151 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0326453  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0166  hypothetical protein  48.67 
 
 		 151 aa  158  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4300  hypothetical protein  48.67 
 
 		 151 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4169  hypothetical protein  48.67 
 
 		 151 aa  157  5e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4099  hypothetical protein  48 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0591  hypothetical protein  34.25 
 
 		 170 aa  101  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135105  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0214  hypothetical protein  39.2 
 
 		 141 aa  97.1  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0193  hypothetical protein  35.2 
 
 		 140 aa  92.8  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3985  hypothetical protein  35.61 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3538  hypothetical protein  33.78 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1966  hypothetical protein  30.71 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0272  hypothetical protein  26.36 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4148  hypothetical protein  28.57 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.144769 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1784  hypothetical protein  26.09 
 
 		 231 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.215532  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>