More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2452 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_2452  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  100 
 
 
314 aa  650    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02791  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  48.23 
 
 
311 aa  280  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1337  alcohol dehydrogenase  40.37 
 
 
336 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0856  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  42 
 
 
302 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2961  alcohol dehydrogenase  39.54 
 
 
331 aa  210  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.284622 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4656  alcohol dehydrogenase  41.05 
 
 
336 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37950  zinc-containing alcohol dehydrogenase  43.32 
 
 
331 aa  206  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2325  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.13 
 
 
331 aa  195  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2437  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.28 
 
 
330 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.12399 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2027  alcohol dehydrogenase  38.64 
 
 
328 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0562  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.64 
 
 
326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.6978  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2447  alcohol dehydrogenase  29.28 
 
 
331 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767036  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1670  alcohol dehydrogenase  28.28 
 
 
328 aa  109  7.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000446585  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3528  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.51 
 
 
332 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3306  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  27.18 
 
 
332 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3566  alcohol dehydrogenase  27.18 
 
 
332 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.558316  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3522  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.18 
 
 
332 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3221  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  26.86 
 
 
332 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3521  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  26.54 
 
 
332 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.271147  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3273  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  26.54 
 
 
332 aa  95.9  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0112  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.32 
 
 
334 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.985575  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05254  oxidoreductase  25.65 
 
 
329 aa  94.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1741  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.18 
 
 
332 aa  94  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3507  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  26.54 
 
 
332 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0304  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.88 
 
 
333 aa  90.5  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337818  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0751  quinone oxidoreductase  32.75 
 
 
328 aa  90.1  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.199766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3085  bifunctional protein: zinc-containing alcohol dehydrogenase; quinone oxidoreductase ( NADPH:quinone reductase)  30.05 
 
 
317 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0506  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.45 
 
 
317 aa  89  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10178  alcohol dehydrogenase, zinc-containing protein  28.98 
 
 
335 aa  88.6  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1291  alcohol dehydrogenase  32.51 
 
 
333 aa  87.8  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3416  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.58 
 
 
317 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.740115  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3647  alcohol dehydrogenase  27.95 
 
 
333 aa  86.7  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3184  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.11 
 
 
317 aa  86.7  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3435  alcohol dehydrogenase  29.11 
 
 
317 aa  86.7  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1047  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.22 
 
 
336 aa  86.3  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125126  normal  0.659937 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0999  alcohol dehydrogenase  31.16 
 
 
331 aa  85.9  8e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0148463  hitchhiker  0.00000104797 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1494  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  29.34 
 
 
338 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253421  normal  0.032291 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6082  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.47 
 
 
333 aa  85.5  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3490  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.11 
 
 
287 aa  84.3  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0444759  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4384  alcohol dehydrogenase  29.18 
 
 
333 aa  84.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0102  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.51 
 
 
333 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.703358  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3101  alcohol dehydrogenase  29.39 
 
 
333 aa  84.7  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0948  NADPH:quinone reductase related Zn-dependent oxidoreductase  27.6 
 
 
312 aa  84.7  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.102607  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.27 
 
 
333 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02525  oxidoreductase  29.54 
 
 
307 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481971  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1753  NADPH:quinone reductase  27.57 
 
 
333 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0658  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.2 
 
 
337 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01966  oxidoreductase, zinc-binding protein  34.27 
 
 
363 aa  82.8  0.000000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2008  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.84 
 
 
333 aa  82.4  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482535  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0125  alcohol dehydrogenase, zinc-binding  32.54 
 
 
337 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.384409  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2159  hypothetical protein  28.22 
 
 
337 aa  82  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4263  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.33 
 
 
342 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493971  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2543  alcohol dehydrogenase  24.41 
 
 
308 aa  82  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549026  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2133  hypothetical protein  28.22 
 
 
337 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3712  alcohol dehydrogenase  29.36 
 
 
338 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1688  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  28.93 
 
 
338 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851726  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2265  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.31 
 
 
328 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.846418  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3419  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  26.92 
 
 
331 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.816241  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0933  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  33.33 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2281  alcohol dehydrogenase  27.62 
 
 
339 aa  80.5  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.166638 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4426  alcohol dehydrogenase  30.8 
 
 
319 aa  80.9  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1944  quinone oxidoreductase  28.9 
 
 
328 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0819038  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2147  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.9 
 
 
328 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0429  alcohol dehydrogenase  27.69 
 
 
335 aa  80.1  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2967  alcohol dehydrogenase  27.85 
 
 
313 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3191  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.9 
 
 
328 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0472649  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1716  alcohol dehydrogenase  28.51 
 
 
339 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.616978  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2613  alcohol dehydrogenase  27.03 
 
 
316 aa  78.6  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.616835 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1489  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.8 
 
 
330 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151992  normal  0.194221 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4584  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.27 
 
 
333 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.978307 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0754  alcohol dehydrogenase, zinc-containing protein  37.5 
 
 
349 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.094248  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3894  alcohol dehydrogenase  26.26 
 
 
312 aa  77.8  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00052515  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1920  quinone oxidoreductase  28.9 
 
 
328 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3540  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  25.62 
 
 
333 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.971542  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2242  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  26.86 
 
 
314 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1577  putative oxidoreductase  29.44 
 
 
337 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3542  alcohol dehydrogenase  26.79 
 
 
334 aa  77.4  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.946439  normal  0.516815 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0401  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.48 
 
 
337 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3957  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
340 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0107  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.16 
 
 
341 aa  76.3  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.4232  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1033  NADPH:quinone reductase (quinone oxidoreductase)  28.24 
 
 
337 aa  76.3  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0799  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  32 
 
 
339 aa  76.3  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.115573  normal  0.158773 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3168  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  25.08 
 
 
331 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212321  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0066  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  31.17 
 
 
337 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3182  alcohol dehydrogenase  26.78 
 
 
339 aa  76.3  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0074  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  31.17 
 
 
337 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2988  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.45 
 
 
338 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143388  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1553  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.01 
 
 
340 aa  75.9  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3436  alcohol dehydrogenase  32.64 
 
 
340 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1965  quinone oxidoreductase  28.32 
 
 
328 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3186  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  25.16 
 
 
335 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6616  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.57 
 
 
333 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809993  normal  0.12586 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2113  quinone oxidoreductase  28.32 
 
 
328 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3438  alcohol dehydrogenase  25.16 
 
 
335 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3391  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  25.08 
 
 
331 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116422  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3406  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  25.48 
 
 
331 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0734  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  28.51 
 
 
336 aa  75.5  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0666  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.64 
 
 
337 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0715  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  25.31 
 
 
338 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18160  putative oxidoreductase  28.57 
 
 
337 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>