31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0964 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0964  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3320  dienelactone hydrolase  94.12 
 
 		 245 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0806  dienelactone hydrolase  94.12 
 
 		 245 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248795 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3217  dienelactone hydrolase  92.65 
 
 		 245 aa  137  6e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0903  dienelactone hydrolase  89.55 
 
 		 245 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.833449  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0857  dienelactone hydrolase  86.76 
 
 		 245 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3630  dienelactone hydrolase  86.76 
 
 		 245 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3507  dienelactone hydrolase  86.76 
 
 		 245 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3435  dienelactone hydrolase  88.06 
 
 		 245 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0519  dienelactone hydrolase  77.61 
 
 		 245 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0788  dienelactone hydrolase  73.53 
 
 		 245 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.237009  normal  0.0587871 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0743  dienelactone hydrolase  70.59 
 
 		 245 aa  105  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.774494  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0924  dienelactone hydrolase  69.12 
 
 		 245 aa  102  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0826  dienelactone hydrolase  67.65 
 
 		 245 aa  100  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.390994 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3046  dienelactone hydrolase  67.65 
 
 		 245 aa  100  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.715018  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2467  dienelactone hydrolase  64.18 
 
 		 247 aa  97.1  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1546  dienelactone hydrolase  64.18 
 
 		 245 aa  96.7  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.770426  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4005  carboxymethylenebutenolidase family protein  59.7 
 
 		 245 aa  93.6  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1544  threonyl-tRNA synthetase, class IIA  64.18 
 
 		 245 aa  92.8  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0613  dienelactone hydrolase  62.69 
 
 		 244 aa  86.7  9e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2602  carboxymethylenebutenolidase  53.73 
 
 		 244 aa  77  0.00000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3109  Carboxymethylenebutenolidase  53.73 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06410  carboxymethylenebutenolidase, putative  47.76 
 
 		 275 aa  65.5  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10652  dienelactone hydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G07130)  47.89 
 
 		 289 aa  64.3  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1279  Carboxymethylenebutenolidase  44.78 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0092  carboxymethylenebutenolidase  45.59 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019242 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78962  carboxymethylenebutenolidase  43.66 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0108419 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2927  dienelactone hydrolase  35.82 
 
 		 246 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3192  Carboxymethylenebutenolidase  35.82 
 
 		 246 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0392  carboxymethylenebutenolidase  30.88 
 
 		 250 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0533  dienelactone hydrolase  29.85 
 
 		 246 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>