33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_pSN254_0006 on replicon NC_009140
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009140  SNSL254_pSN254_0006  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  100 
 
 		 327 aa  679    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000392553  hitchhiker  0.000000249186 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2724  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  64.92 
 
 		 387 aa  460  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.548839 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1301  hypothetical protein  45.14 
 
 		 339 aa  280  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5004  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  44.92 
 
 		 346 aa  266  4e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal  0.549509 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0336  hypothetical protein  43.48 
 
 		 341 aa  264  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4322  hypothetical protein  42.11 
 
 		 348 aa  243  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4126  hypothetical protein  41.71 
 
 		 213 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4117  hypothetical protein  38.85 
 
 		 165 aa  105  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0488  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.83 
 
 		 319 aa  67  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0891  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.42 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1349  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.02 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0136042  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0790  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.06 
 
 		 784 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3838  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.78 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0614264  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0991  hypothetical protein  25.43 
 
 		 428 aa  53.1  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.536257  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1726  hypothetical protein  25 
 
 		 428 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.422238  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3506  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.94 
 
 		 430 aa  52  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0220762  normal  0.0429503 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4214  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.22 
 
 		 284 aa  50.4  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317185  normal  0.300379 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0954  hypothetical protein  25.43 
 
 		 428 aa  50.1  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.438042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0981  hypothetical protein  28.44 
 
 		 428 aa  50.1  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.534482  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3757  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.17 
 
 		 363 aa  47.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1300  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.6 
 
 		 342 aa  47.4  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1343  hypothetical protein  27.68 
 
 		 441 aa  47  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1596  hypothetical protein  27.86 
 
 		 594 aa  46.2  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2401  hypothetical protein  33.33 
 
 		 528 aa  46.2  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1365  gp51  34.12 
 
 		 373 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1030  gp57  29.71 
 
 		 332 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0818193  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2389  hypothetical protein  29.03 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0171782  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1714  hypothetical protein  25.87 
 
 		 512 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.414906  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0931  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.07 
 
 		 220 aa  44.3  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.238936  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2060  hypothetical protein  26.72 
 
 		 594 aa  43.9  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.124935 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0011  hypothetical protein  31.91 
 
 		 484 aa  43.1  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0748  hypothetical protein  28.44 
 
 		 503 aa  42.7  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0410  hypothetical protein  22.92 
 
 		 472 aa  42.4  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0165126  hitchhiker  0.000394368 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>