243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2027 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2027  antiholin-like protein LrgB  100 
 
 		 233 aa  451  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.69711  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0248  antiholin-like protein LrgB  73.83 
 
 		 233 aa  301  8.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0254  antiholin-like protein LrgB  73.83 
 
 		 233 aa  301  8.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3956  antiholin-like protein LrgB  55.8 
 
 		 230 aa  241  5e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5232  antiholin-like protein LrgB  55.36 
 
 		 230 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5571  antiholin-like protein LrgB  54.91 
 
 		 230 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5534  antiholin-like protein LrgB  54.91 
 
 		 230 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5293  antiholin-like protein LrgB  54.91 
 
 		 230 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3627  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5386  antiholin-like protein LrgB  54.91 
 
 		 230 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.674425  normal  0.703231 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5120  antiholin-like protein LrgB  54.91 
 
 		 230 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5135  antiholin-like protein LrgB  54.91 
 
 		 230 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0238416  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5563  antiholin-like protein LrgB  54.91 
 
 		 230 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5689  antiholin-like protein LrgB  54.91 
 
 		 230 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5619  antiholin-like protein LrgB  54.91 
 
 		 230 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0185  hypothetical protein  50 
 
 		 242 aa  209  2e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0906  LrgB family protein  42.55 
 
 		 246 aa  166  4e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3199  hypothetical protein  41.44 
 
 		 238 aa  159  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.180228  normal  0.0164124 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1948  lrgB-like family protein  37.27 
 
 		 236 aa  150  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2236  lrgB-like family protein  37.27 
 
 		 236 aa  149  4e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1359  LrgB family protein  34.09 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957145  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0707  LrgB family protein  34.68 
 
 		 230 aa  138  7e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000904549  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1415  LrgB family protein  35.59 
 
 		 231 aa  138  8.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.429931  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0811  putative effector of murein hydrolase  34.06 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00607912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3274  hypothetical protein  35.43 
 
 		 231 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.640575 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02071  predicted inner membrane protein  34.98 
 
 		 231 aa  132  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1516  LrgB family protein  34.98 
 
 		 231 aa  132  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2437  hypothetical protein  34.98 
 
 		 231 aa  132  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02030  hypothetical protein  34.98 
 
 		 231 aa  132  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0829  hypothetical protein  34.98 
 
 		 231 aa  132  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1506  hypothetical protein  34.98 
 
 		 231 aa  132  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2289  hypothetical protein  34.98 
 
 		 231 aa  132  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2417  hypothetical protein  36.07 
 
 		 231 aa  131  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2328  hypothetical protein  36.07 
 
 		 231 aa  131  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2372  hypothetical protein  36.07 
 
 		 231 aa  131  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2421  hypothetical protein  36.07 
 
 		 231 aa  131  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2745  hypothetical protein  35.62 
 
 		 231 aa  131  7.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0159  LrgB family protein  37.12 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2529  hypothetical protein  35.62 
 
 		 231 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22940  conserved hypothetical protein TIGR00659  33.48 
 
 		 244 aa  125  4.0000000000000003e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1204  LrgB-like protein  32.29 
 
 		 239 aa  125  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574065  normal  0.106071 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1569  hypothetical protein  35.16 
 
 		 231 aa  125  7e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3524  LrgB family protein  32.71 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00860  putative effector of murein hydrolase  30.09 
 
 		 234 aa  124  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3024  hypothetical protein  35.35 
 
 		 231 aa  123  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318383  normal  0.0470923 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2461  hypothetical protein  35.35 
 
 		 231 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2907  LrgB family protein  33.33 
 
 		 229 aa  122  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2560  hypothetical protein  35.35 
 
 		 231 aa  122  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143384  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5839  LrgB family protein  31.7 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5345  LrgB family protein  32.74 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.426431 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3765  hypothetical protein  30.37 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000370937 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2322  LrgB family protein  32.26 
 
 		 225 aa  119  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000117788  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6075  LrgB family protein  31.25 
 
 		 244 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1482  putative effector of murein hydrolase  30.53 
 
 		 231 aa  119  3e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0187991  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3704  hypothetical protein  33.33 
 
 		 225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1949  LrgB family protein  33.78 
 
 		 236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000146324  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3855  hypothetical protein  31.31 
 
 		 223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0819  LrgB family protein  29.82 
 
 		 224 aa  119  4.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.061161  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3598  hypothetical protein  30.37 
 
 		 219 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.350738  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3884  hypothetical protein  30.37 
 
 		 219 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3376  murein hydrolase export regulator  32.85 
 
 		 225 aa  118  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.508194  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2209  LrgB family protein  30.43 
 
 		 248 aa  118  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591035  normal  0.130625 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3687  hypothetical protein  32.85 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.353433 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3459  hypothetical protein  32.85 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.807619  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3425  murein hydrolase export regulator  32.85 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0481029  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7636  LrgB-like protein  30.8 
 
 		 244 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393691 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1938  LrgB-like protein  30.74 
 
 		 245 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3731  hypothetical protein  32.85 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1497  hypothetical protein  34.85 
 
 		 231 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1444  hypothetical protein  31.31 
 
 		 223 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000188634 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6059  LrgB family protein  31.25 
 
 		 244 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.742566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2968  hypothetical protein  34.34 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45272  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3711  hypothetical protein  32.85 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.34067  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1577  LrgB family protein  37.11 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.4351e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6133  LrgB family protein  31.7 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7753  normal  0.649123 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6615  LrgB family protein  31.7 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.918495  normal  0.128036 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3778  hypothetical protein  32.37 
 
 		 225 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1536  hypothetical protein  32.37 
 
 		 225 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.020516 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4815  LrgB family protein  30.32 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.576508 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4690  LrgB family protein  30.32 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.827168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4868  LrgB family protein  29.86 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0606  LrgB family protein  29.86 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2909  LrgB family protein  30.52 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1607  LrgB-like protein  30.05 
 
 		 241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.884781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1236  hypothetical protein  32.52 
 
 		 231 aa  113  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1318  LrgB family protein  34.34 
 
 		 229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95009e-21 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2977  LrgB family protein  27.4 
 
 		 241 aa  112  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2448  hypothetical protein  30.14 
 
 		 231 aa  112  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2405  LrgB family protein  27.4 
 
 		 241 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0637  LrgB-like protein  29.41 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0793077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11930  hypothetical protein  30.8 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000775125  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0272  hypothetical protein  29.19 
 
 		 235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3106  LrgB-like protein  30.92 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1096  hypothetical protein  31.94 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00551431  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2563  hypothetical protein  29.15 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2254  putative transmembrane protein  30.66 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.75348 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1695  hypothetical protein  28.05 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2616  hypothetical protein  29.15 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1148  hypothetical protein  32.17 
 
 		 231 aa  110  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000875943  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4337  LrgB family protein  30.81 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.4746  normal  0.466601 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0267  hypothetical protein  29.19 
 
 		 235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>